Стабильность вторичной структуры олигонуклеотидных субстратов. Эффект ДНК-метилазы Ecodam

Исследована стабильность олигонуклеотидных комплексов, содержащих различные дефекты в участке узнавания метилазы Ecodam. Одноцепочечный 20-членный олигонуклеотид, содержащий в центре самокомплементарную гексануклеотидную последовательность, образует частично дуплексную структуру только при температу...

Повний опис

Збережено в:

Бібліографічні деталі
Дата:	1989
Автори:	Речкунова, Н.И., Лохов, С.Г., Горбунов, Ю.А., Зиновьев, В.В., Бурьянов, Я.И., Малыгин, Э.Г.
Формат:	Стаття
Мова:	Russian
Опубліковано:	Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 1989
Назва видання:	Биополимеры и клетка
Теми:	Структура и функции биополимеров
Онлайн доступ:	http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/155017
Теги:	Додати тег Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Назва журналу:	Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Цитувати:	Стабильность вторичной структуры олигонуклеотидных субстратов. Эффект ДНК-метилазы Ecodam / Η.И. Речкунова, С.Г. Лохов, Ю.А. Горбунов, В.В. Зиновьев, Я.И. Бурьянов, Э.Г. Малыгин // Биополимеры и клетка. — 1989. — Т. 5, № 3. — С. 43-48. — Бібліогр.: 16 назв. — рос.

Репозитарії

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine

id	irk-123456789-155017
record_format	dspace
spelling	irk-123456789-1550172019-06-17T01:31:01Z Стабильность вторичной структуры олигонуклеотидных субстратов. Эффект ДНК-метилазы Ecodam Речкунова, Н.И. Лохов, С.Г. Горбунов, Ю.А. Зиновьев, В.В. Бурьянов, Я.И. Малыгин, Э.Г. Структура и функции биополимеров Исследована стабильность олигонуклеотидных комплексов, содержащих различные дефекты в участке узнавания метилазы Ecodam. Одноцепочечный 20-членный олигонуклеотид, содержащий в центре самокомплементарную гексануклеотидную последовательность, образует частично дуплексную структуру только при температуре ниже 5 <С. Остальные комплексы плавятся в узком интервале температур 22–31 °С в 30 мМ калий-фосфатном буфере, рН 7,8. В присутствии метилазы Ecodam наблюдается увеличение температуры плавления комплекса по крайней мере на 5 °С. Досліджено стабільність олігонуклеотидних комплексів, що містять різні дефекти в ділянці упізнавання метилази Ecodam. Одноланцюговий 20-членний олігонуклеотид, який містить у центрі самокомплементарну гексануклеотидну послідовність, утворює частково дуплексну структуру лише за температури нижче 5 °С. Решта комплексів плавляться у вузькому інтервалі температур 22–31 °С у 30 мМ калій-фосфатному буфері, рН 7,8. За присутності метилази Ecodam спостерігається збільшення температури плавлення комплексу принаймні на 5 °С. Oligonucleotide complexes containing various defects in Ecodam methylase recognition site have been investigated for their stability. Partial duplex structure of the single-stranded 20-base long oligonucleotide containing a self-complementary hexanucleotide sequence is observed only below 5 °C. Other complexes are melting within the narrow temperature range of 22–31 °C in 30 mM of potassium-phosphate buffer, pH 7.8. Presence of Ecodam methylase results in an increase of complex melting point at least by 5 °C. 1989 Article Стабильность вторичной структуры олигонуклеотидных субстратов. Эффект ДНК-метилазы Ecodam / Η.И. Речкунова, С.Г. Лохов, Ю.А. Горбунов, В.В. Зиновьев, Я.И. Бурьянов, Э.Г. Малыгин // Биополимеры и клетка. — 1989. — Т. 5, № 3. — С. 43-48. — Бібліогр.: 16 назв. — рос. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.0000B6 http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/155017 577.323 ru Биополимеры и клетка Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
institution	Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection	DSpace DC
language	Russian
topic	Структура и функции биополимеров Структура и функции биополимеров
spellingShingle	Структура и функции биополимеров Структура и функции биополимеров Речкунова, Н.И. Лохов, С.Г. Горбунов, Ю.А. Зиновьев, В.В. Бурьянов, Я.И. Малыгин, Э.Г. Стабильность вторичной структуры олигонуклеотидных субстратов. Эффект ДНК-метилазы Ecodam Биополимеры и клетка
description	Исследована стабильность олигонуклеотидных комплексов, содержащих различные дефекты в участке узнавания метилазы Ecodam. Одноцепочечный 20-членный олигонуклеотид, содержащий в центре самокомплементарную гексануклеотидную последовательность, образует частично дуплексную структуру только при температуре ниже 5 <С. Остальные комплексы плавятся в узком интервале температур 22–31 °С в 30 мМ калий-фосфатном буфере, рН 7,8. В присутствии метилазы Ecodam наблюдается увеличение температуры плавления комплекса по крайней мере на 5 °С.
format	Article
author	Речкунова, Н.И. Лохов, С.Г. Горбунов, Ю.А. Зиновьев, В.В. Бурьянов, Я.И. Малыгин, Э.Г.
author_facet	Речкунова, Н.И. Лохов, С.Г. Горбунов, Ю.А. Зиновьев, В.В. Бурьянов, Я.И. Малыгин, Э.Г.
author_sort	Речкунова, Н.И.
title	Стабильность вторичной структуры олигонуклеотидных субстратов. Эффект ДНК-метилазы Ecodam
title_short	Стабильность вторичной структуры олигонуклеотидных субстратов. Эффект ДНК-метилазы Ecodam
title_full	Стабильность вторичной структуры олигонуклеотидных субстратов. Эффект ДНК-метилазы Ecodam
title_fullStr	Стабильность вторичной структуры олигонуклеотидных субстратов. Эффект ДНК-метилазы Ecodam
title_full_unstemmed	Стабильность вторичной структуры олигонуклеотидных субстратов. Эффект ДНК-метилазы Ecodam
title_sort	стабильность вторичной структуры олигонуклеотидных субстратов. эффект днк-метилазы ecodam
publisher	Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
publishDate	1989
topic_facet	Структура и функции биополимеров
url	http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/155017
citation_txt	Стабильность вторичной структуры олигонуклеотидных субстратов. Эффект ДНК-метилазы Ecodam / Η.И. Речкунова, С.Г. Лохов, Ю.А. Горбунов, В.В. Зиновьев, Я.И. Бурьянов, Э.Г. Малыгин // Биополимеры и клетка. — 1989. — Т. 5, № 3. — С. 43-48. — Бібліогр.: 16 назв. — рос.
series	Биополимеры и клетка
work_keys_str_mv	AT rečkunovani stabilʹnostʹvtoričnojstrukturyoligonukleotidnyhsubstratovéffektdnkmetilazyecodam AT lohovsg stabilʹnostʹvtoričnojstrukturyoligonukleotidnyhsubstratovéffektdnkmetilazyecodam AT gorbunovûa stabilʹnostʹvtoričnojstrukturyoligonukleotidnyhsubstratovéffektdnkmetilazyecodam AT zinovʹevvv stabilʹnostʹvtoričnojstrukturyoligonukleotidnyhsubstratovéffektdnkmetilazyecodam AT burʹânovâi stabilʹnostʹvtoričnojstrukturyoligonukleotidnyhsubstratovéffektdnkmetilazyecodam AT malyginég stabilʹnostʹvtoričnojstrukturyoligonukleotidnyhsubstratovéffektdnkmetilazyecodam
first_indexed	2025-07-14T07:02:36Z
last_indexed	2025-07-14T07:02:36Z
_version_	1837604857483100160
fulltext	18. Millar D. P., Robbins R. /., Zewail A. H. Torsion and bending of nucleic acids stu- died by subnanosecond time-resolved fluorescence depolarization of intercalated dy- es / / J . Chem. Phys.— 1982.—76, N 4 .—P. 2080—2094. 19. Hagerman P. / . Investigation of the flexibility of DNA using transient electric bi- ref r ingence/ /Biopolymers .—1981,—20, N 7 .—P. 1503—1535. 20. Ярмола Ε. Г., Зарудная Μ. И., Лазуркин Ю. С. Зависимость осмотического давле- ния Д Н К и эффективного диаметра от ионной с и л ы / / Б и о ф и з и к а . — 1986.—31, № 2.— С. 338—339. 21. Strigter D. Interactions of highly charged colloidal cylinders with applications to double-stranded DNA / / Biopolymers.— 1977.—16, N 7 .—P. 1435—1448. 22. Brian A. A., Frisch H. L., Lerman L. S. Thermodynamics and equilibrium sedimenta- tion analysis of the close approach of DNA molecules and a molecular ordering t ran- s i t ion / / Ib id .—1981.—20, N 6 . — P . 1305—1328. 23. Shore D., Boldwiti R. L. Energetics of DNA twisting. 2. Topoisomer a n a l y s i s / / J . Мої. Biol.— 1983.—170, N 4 ,—P. 983—1007. 24. Horowitz D. SWang J. C. The torsional rigidity of DNA and the length dependence of the free energy of DNA supe rco i l i ng / / Ib id .— 1984.—173, N 1.—P. 75—91. 25. Maniatis T., Fritsch E. F., Sambrook J. Molecular cloning.— New York: Cold Spring Harbor Lab., 1982,—542 p. 26. Wang J. C. The degree of unwinding of the helix by e t h i d i u m / / J . Мої. Biol.— 1974.—89, N 4 .—P. 783—801. Ин-т цитологии и генетики Получено 12.01.88 Сиб. отд-ния АН СССР, Новосибирск EFFECT OF THE IONIC SOLUTION STRENGTH ON ENERGY OF DNA SUPERCOILING M. A. Shurdov, A. D. Gruzdev Insti tute of Cytology and Genetics, Siberian Branch of the Academy of Sciences of the USSR, Novosibirsk S u m m a r y Binding isoterms of EtBr to supercoiled and relaxed pBR322 DNA were used to deter- mine dependence of the free energy of DNA supercoiling on NaCl concentration in the solution. It is shown that a decrease of concentration from 0.3 M to 0.01 M NaCl makes the value of K constant more than doubled and promote a significant reduction of the superhelical density — σ. The free energy of DNA supercoiling decreases approxima- tely by 20 per cent. У Д К 577.323 Η. И. Речкунова, С. Г. Лохов, Ю. А. Горбунов, В. В. Зиновьев, Я. И. Бурьянов, Э. Г. Малыгин СТАБИЛЬНОСТЬ ВТОРИЧНОЙ СТРУКТУРЫ ОЛИГОНУКЛЕОТИДНЫХ СУБСТРАТОВ. ЭФФЕКТ ДНК-МЕТИЛАЗЫ ECODAM* Исследована стабильность олигонуклеотидных комплексов, содержащих различные де- фекты в участке узнавания метилазы Ecodam. Одноцепочечный 20-членный олигонук- леотид, содержащий в центре самокомплементарную гексануклеотидную последователь- ность, образует частично дуплексную структуру только при температуре ниже 5 °С. Остальные комплексы плавятся в узком интервале температур 22—31 °С в 30 мМ ка- лий-фосфатном буфере, рН 7,8. В присутствии метилазы Ecodam наблюдается увеличе- ние температуры плавления комплекса по крайней мере на 5 °С. Введение. Адениновая ДНК-метилаза Ecodam узнает симметричную тетрануклеотидную последовательность 5'...—G—А—T—С—... ...—С—T—А—G— ... 5' П р и н я т ы е о б о з н а ч е н и я : MeS — тиометильная группировка; префикс d в формулах олигонуклеотидов для краткости опущен. * Представлена членом редколлегии М. Д. Франк-Каменецким. ISSN 0233-7657. Б И О П О Л И М Е Р Ы И КЛЕТКА. 1989. Т. 5. № 3 43 и в присутствии S-аденозилметионина переносит метальные группы в обе цепи участка узнавания с образованием ]М6-метиладенина [1, 2]. При исследовании ДНК-метилазы Ecodam обнаружена интересная особенность, состоящая в том, что фермент может метилировать дена- турированную Д Н К , хотя и с замедленной скоростью и в меньшей сте- пени, чем нативную [3, 4]. Нами также была показана возможность метилирования этим ферментом не только денатурированных и одно- цепочечных ДНК, но и однонитчатых олигонуклеотидных субстратов при пониженных температурах [5, 6]. Естественно предположить, что Рис. 1. Дифференциальные кривые плавления олигонуклеотидных комплексов в 30 мМ калий-фосфатном буфере (рН 7,8): олигонуклеотид I ( / ) ; эквимолярная смесь олиго- нуклеотидов I и VI (2) и I, V, VI (J) Fig. 1. Differential melting curves of oligonucleotide complexes in 30 mM of potassium- phosphate buffer (pH 7.8): oligonucleotide I ( / ) ; equimolar mixture of oligonucleotides I, VI (2); equimolar mixture of oligonucleotides I, V, VI (3) Рис. 2. Кривые плавления олигонуклеотидного комплекса (1 мкМ), состоящего из оли- гонуклеотидов I, II и IV: 1 — без фермента; 2 — в присутствии 2 мкМ Ecodam мети- лазы Fig. 2. Melting curves of the oligonucleotide complex (1 μΜ) containing oligonucleotides I, II and IV: 1 — without enzyme; 2 — in presence of 2 μΜ Ecodam methylase метилируемые участки в таких субстратах находятся в составе локаль- ных самокомплементарных дуплексных структур. Однако оставалось неясным, может ли метилаза Ecodam участвовать в образовании и ста- билизации таких структур, как это предполагается для рестриктаз [7]. В настоящей работе приводятся данные по температурам плавле- ния олигонуклеотидных комплексов и влиянию на их стабильность ДНК-метилазы Ecodam. Материалы и методы, Метилаза Ecodam выделена по методу [8]. Олигодезокси- рибонуклеотиды синтезированы фосфотриэфирным методом [9] и содержат на Б'-кон- це свободную гидроксильную группу. Для синтеза олигодезоксирибонуклеотидов, име- ющих З'-концевой S-метилтиофосфат, использовали мононуклеотидные блоки, в кото- рых З'-тиофосфатный остаток блокирован S-метильной и 2,4-дихлорфенильной груп- пами [10]. Исследование стабильности олигонуклеотидных комплексов проводили в 30 мМ калий-фосфатном буфере, рН 7,8. Температуры плавления олигонуклеотидных комп- лексов устанавливали, используя эквимолярные количества олигонуклеотидов с общей концентрацией 1 о. е./мл, по ранее описанной методике [11]. Величины температур определяли в точке максимума первой производной кривой плавления комплекса. Диф- ференцирование производили графическим методом. По кривой плавления находили' долю олигонуклеотидов, находящихся в двухцепочечном состоянии, используя метод, предложенный в работе [12]. Результаты и обсуждение. Ранее мы показали, что метилаза E co- dam, кроме одноцепочечных ДНК, способна метилировать широкий ряд дефектных олигонуклеотидных субстратов, где отсутствует один или не- 44 ISSN 0233-7657. БИОПОЛИМЕРЫ И КЛЕТКА. 1989. Т. 5. № 3 44 сколько нуклеотидных остатков в одной из цепей последовательности узнавания [6]. При всем разнообразии исследованных дефектов ока- залось, что для проявления ферментативной активности необходимо со- хранение частичной симметрии двунитчатого субстрата, а именно, при- сутствие в обеих цепях участка узнавания последовательностей G—А—, содержащих необходимый для метилирования остаток адениловой кис- лоты. Следует отметить, что при исследовании эндонуклеазы BatnHI также показана возможность расщепления частично симметричных де- фектных олигонуклеотидных субстратов [13]. Эти данные указывают на то, что в продуктивном фермент-субстратном комплексе олигонук- леотиды должны иметь двунитчатую структуру, по крайней мере в участке узнавания. Существование такой структуры зависит от стабиль- ности исходных двухцепочечных олигонуклеотидов и, возможно, частич- но определяется влиянием фермента. Для изучения стабильности субстратных комплексов были выбра- ны основные типы исследованных ранее олигонуклеотидных структур [6] и для них определены температуры плавления (табл. 1) в услови- ях метилирования. На рис. 1 показаны типичные дифференциальные кривые плавления некоторых комплексов, приведенных в табл. 1. Для одноцепочечного олигонуклеотида I наблюдается частичное образование двуспиральной структуры только при температуре ниже 5 °С (рис. 1). Образование двухцепочечной структуры для этого оли- гонуклеотида при низких температурах возможно по центральному сим- метричному гексануклеотиду ...—G—G—А—T—С—С—..., включающему участок узнавания для метилазы Ecodam. Другие самокомплементар- ные участки, участвующие в самоассоциации, отсутствуют в олигонук- леотиде I, за исключением пары G-C на 5'- и З'-концах олигонук- леотида. Добавление к 20-членному олигонуклеотиду I олигонуклеотидов II или III, комплементарных его З'-концу, приводит к образованию комп- лексов, плавящихся при 30 и 26 °С соответственно (комплексы 2 и 3, табл. 1). Эти величины заметно выше температуры плавления для комп- лекса 4, образованного при участии олигонуклеотида IV, комплемен- тарного 5'-концу олигонуклеотида I. Такое различие, наблюдаемое при равном содержании A-T- и G-C-nap в составе комплексов, по-видимо- му, является следствием зависимости стабильности двойных спиралей нуклеиновых кислот от последовательности оснований в них [14]. При добавлении к олигонуклеотиду I олигонуклеотидов V и VI об- разуется двухцепочечный комплекс, в котором отсутствует только фос- фатный остаток между С и T (комплекс 5). Этот комплекс плавится при температуре 31 °С. В остальных вариантах такого типа, где дефек- том является отсутствие целого нуклеотидного остатка (комплексы 6— 8), наблюдаемая кривая плавления существенно уширена и средняя температура плавления ниже по сравнению с комплексом 5. По-види- мому, указанный дефект прерывает стэкинг-взаимодействия между при- лежащими основаниями и снимает кооперативность в плавлении обеих ттоловин комплексов. В этом случае наблюдаемая кривая плавления является суммарной кривой плавления двух типов комплексов. Указанная особенность в плавлении таких комплексов согласуется с наблюдаемым понижением температуры плавления комплексов 6 и 7, содержащих только один неспаренный нуклеотидный остаток по срав- нению с комплексами 2 и 3, у которых половина оснований находится в одноцепочечном состоянии. Так, например, температура плавления комплекса 6 (24 °С) будет определяться величинами температуры для комплекса 2 (30 °С) и комплекса 11 (22 °С). Суммарная кривая плав- ления этих двух комплексов и приводит к понижению температуры плавления комплекса 6 по сравнению с комплексом 2. В комплексах 3 и 7 присутствует З'-Б-метилтиофосфатный остаток, что приводит к небольшому уменьшению температуры плавления по сравнению с комплексами 2 и 6 соответственно. Слабое влияние З'-фос- фата на температуру плавления отмечалось ранее для комплексов по- ISSN 0233-7657. БИОПОЛИМЕРЫ И КЛЕТКА. 1989. Т. 5. № 3 45 Т а б л и ц а 1 Температура плавления олигонуклеотидных комплексов в 30 мМ калий-фосфатном буфере (рН 7,8) Melting points of the oligonucleotide complexes in ЗО мМ potassium phosphate buffer (pH 7,8) Номер Темпе- комп- Структура комплекса ратура, лекса °С ли-С с гексаинозиновой кислотой [15]. Замена аденина на гуанин в олигонуклеотиде VIII незначительно уменьшает температуру плавления комплекса 9 по сравнению с олигонуклеотидным комплексом 2, в кото- ром декануклеотид II полностью комплементарен З'-половине олигонук- леотида I. Наблюдаемый эффект такой некомплементарной замены со- гласуется с незначительным влиянием G-T-пары на стэкинг соседних оснований и стабильность дуплекса, обнаруженные в работе Парэля и др. [16]. Суммируя изложенные данные, отметим, что за исключением оли- гонуклеотида I, плавящегося при температуре меньше 5 °С, остальные исследованные субстраты плавятся в сравнительно узком температур- ном интервале 22—31 °С. Как видно из табл. 2, при 20 °С большая доля олигонуклеотидов находится в двуспиральном состоянии, тогда как при 37 °С эта доля незначительна. Несмотря на существенное различие доли дуплексной структуры олигонуклеотидов при 20 и 37 °С, эффективность метилиро- вания их метилазой Ecodam слабо зависит от температуры, а определя- ется, в основном, структурой комплекса. Например, в случае комплек- са 6 при переходе от 20 к 37 °С доля дуплексной структуры снижается более чем в 20 раз. Однако степень метилирования этого комплекса при температурах 20 и 37 °С практически не отличается. С другой стороны, комплекс 8, имеющий с комплексом 6 одинаковую температуру плав- ления, существенно отличается от последнего по степени метилирова- ния его метилазой Ecodam. Отсутствие одного остатка аденина в слу- чае комплекса 8 приводит практически к полной потере субстратных свойств этого комплекса в реакции метилирования, в то время как от- сутствие остатка тимидина в составе комплекса 6 лишь незначительно снижает эффективность метилирования его по сравнению с нативным субстратом. Одноцепочечный олигонуклеотид 1, для которого не наблюдается образования дуплексной структуры при температуре выше 5 °С, обла- дает хорошими субстратными свойствами при 20 и даже 30 °С [6]. Способность метилазы Eeodam метилировать одноцепочечные оли- гонуклеотиды при пониженных температурах, а также эффективно ме- тилировать олигонуклеотидные комплексы при температуре 37 °С, ког- да доля двуспиральной структуры незначительна, позволяет предполо- жить, что в присутствии метилазы происходит стабилизация дуплекс- ной структуры субстратов. Для того чтобы оценить влияние метилазы Eeodam на стабиль- ность дуплексной структуры субстратов, мы провели плавление олиго- нуклеотидного комплекса в присутствии фермента (рис. 2). Как видно из рисунка, в присутствии фермента наблюдается сдвиг кривой плав- ления примерно на 5 °С в сторону повышения температуры. Точно оце- нить повышение температуры плавления в присутствии фермента не представляется возможным, так как на кривую плавления налагается быстро возрастающий после 30 °С фон поглощения, обусловленный де- Т а б л и ц а 2 Образование дуплексной структуры и метилирование олигонуклеотидных субстратов в зависимости от температуры The part of the duplex structure and methylation per cent of the oligonucleotide substrates in different temperatures Номер комплекса Доля структуры, % Степень метилирования по отношению к таковому полностью комплементарного дуплекса [6], % Температура, °С 20 30 37 20 30 37 5 95 62 15 71 122 128 6 71 17 2,5 41 47 34 7 63 6,6 0,5 34 52 39 8 74 10 1,5 0 3 4 10,11 65 15 4 — — _ П р и м е ч а н и е . Номера комплексов соответствуют приведенным в табл. 1. ISSN 0233-7657. БИОПОЛИМЕРЫ И КЛЕТКА. 1989. Т. 5. JY2 3 47 натурацией фермента. Попытка учесть этот фон, вычитая кривую де- натурации чистого фермента, может привести к некорректному резуль- тату, поскольку сам фермент в присутствии субстрата денатурирует иначе. Наблюдаемое изменение температуры плавления комплекса явля- ется усредненной минимальной величиной температурной стабилизации олигонуклеотидного комплекса, так как здесь не учтена доля комплек- са, не связанного с ферментом. Локальный эффект стабилизации, по- видимому, значительно выше, что объясняет сохранение при 37 °С суб- стратных свойств олигонуклеотидных комплексов, плавящихся при тем- пературах более чем на IO0C ниже этого значения. Таким образом, метилаза Ecodam способна стабилизировать ло- кальные дуплексные структуры, содержащие участок узнавания фер- мента. Это свойство, очевидно, является общим для большинства фер- ментов рестрикции-модификации типа II. СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ 1. Geier G. E., Modrich P. Recognition sequence of the dam methylase of Escherichia coli K12 and mode of cleavage of DpnI endonuc lease / / J . Biol. Chem.— 1979.—254, N 4.—P. 1408—1413. 2. Lacks S., Greenderg B. Complementary specificity of restriction endonucleases of Diplococcus pneumoniae with respect to DNA m e t h y l a t i o n / / J . Мої. Biol.— 1977.—114, N 1.—P. 153—168. 3. Herman G. E., Modrich P. Escherichia coli dam methylase. Physical and catalytic properties of the homogeneous e n z y m e / / J . Biol. Chem.— 1982.—257, N 5.— P. 2605— 2 6 1 2 . 4. Использование ДНК-метилаз в качестве реагента для получения меченных изото- пами Д Н К / Я- И. Бурьянов, И. Г. Богдарина, В. Ф. Нестеренко, А. А. Б а е в / / Б и о - химия.— 1982.—47, № 4.—С. 695—697. 5. Daes the DNA methylase Ecodam pair nucleotide sequences to form site-specific duplexes? / Ya. I. Buryanov, V. V. Zinoviev, M. T. Vienozhinskis et a l . / / F E B S Letts.— 1984.—168, N 1.—P. 166—168. 6. Действие ДНК-метилазы Ecodam на однонитчатые последовательности и синтети- ческие олигонуклеотиды / В. В. Зиновьев, Ю. А. Горбунов, С. Г. Попов и др. / / Молекуляр. биология.— 1985—19, № 4.—С. 947—954. 7. Type II restriction endonucleases cleave single-stranded DNAs in general / К. Nishi- gaki, Y. Kaneko, Η. Wakuda et al. / / Nucl. Acids Res.— 1985.—13, N 16.—P. 5747— 5760. 8. Бурьянов Я. И., Захарченко В. H., Баев А. А. Выделение, очистка и некоторые свойства адениновой ДНК-метилазы Ecodam /1 Докл. АН СССР.— 1981.—259, No 6.—С. 1492—1495. 9. Hirose Т., Crea R., Itakura К. Rapid synthesis of trideoxyribonucleotide blocks / / Tetrahedron Lett.— 1978.—19, N 28.—P. 2449—2452. 10. Relse C. R., Jau L. O-Aryl S-methyl phosphorochloridothioates: terminal phosphoryla- ting agents in the phosphotriester approach to oligonucleotide s y n t h e s i s / / J . Chem. Soc. Chem. C o m m u n s . - 1978.— N 23.—P. 1050—1052. 11. Попов С. Г., Шамовский Г. Г. Комплексообразование диолигодезоксиаденилин-5', 5'-пирофосфатов с полирибоуридиловой кислотой//Молекуляр. биология.— 1976.— 10, № 3.—С. 576—583. 12. Nelson /. W., Martin F., Tinoko I. DNA and RNA oligomer thermodynamics: the effect of mismatched bases on double-helix s tabi l i ty/ /Biopolymers.— 1981.—20, N 12.— P. 2509—2531. 13. Взаимодействие рестриктазы BamHI с синтетическими субстратами, содержащими полный или частичный участки узнавания этого фермента / В. В. Зиновьев, В. А. Колесников, Н. И. Безнедельная и др . / /Молекуляр . биология.— 1984.—18, Кя 1,—С. 169—175. 14. Improved estimation of secondary structure in ribonucleic acids / 1 . Tinoko, P. N. Bo- rer, B. Dengler et al. / / N a t u r e . New Biol.— 1979.—246, N 150.—P. 40—41. 15. Bresler S. E., Chernayenko V. M., Saminski Ε. M. Study of the interaction of poly- nucleotide chains with oligomers by means of chromatography//Biopolymers.— 1972.—11, N 8.—P. 1541 — 1550. 16. Structure, dynamics and energetics of deoxyguanosine thymidine wobble base pair formation in the self-complementary d(CGTGAATTCGCG) duplex in so lu t ion / D. J. Parel, A. S. Kozlovski, L. A. Marky et a l . / /Biochemistry.— 1982.—21, N 3.— p. 437—444. ВНИИ молекуляр. биологии НПО «Вектор», Получено 13.01.88 пос. Кольцово Новосиб. обл. Ин-т биоорг. химии Сиб. отд-ния АН СССР, Новосибирск Ин-т биохимии и физиологии микроорганизмов АН СССР, Пущино 48 ISSN 0233-7657. БИОПОЛИМЕРЫ И КЛЕТКА. 1989. Т. 5. № 3 48

Стабильность вторичной структуры олигонуклеотидных субстратов. Эффект ДНК-метилазы Ecodam

Репозитарії

Схожі ресурси