Конформаційні можливості уридину: квантово-механічне дослідження методом функціоналу густини
Квантово-механічним методом функціоналу густини на рівні теорії MP2/6-311++G(d,p)//DFT B3LYP/6-31G(d,p) проведено вичерпний конформаційний аналіз уридину. Представлено основні геометричні, енергетичні та полярні характеристики усіх його 111 стійких конформерів. Отримано конформаційні рівноваги у діа...
Збережено в:
Дата: | 2008 |
---|---|
Автори: | , |
Формат: | Стаття |
Мова: | Ukrainian |
Опубліковано: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
2008
|
Назва видання: | Біополімери і клітина |
Теми: | |
Онлайн доступ: | http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/157675 |
Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
Цитувати: | Конформаційні можливості уридину: квантово-механічне дослідження методом функціоналу густини / Р.О. Жураківський, Д.М. Говорун // Біополімери і клітина. — 2008. — Т. 24, № 2. — С. 142-157. — Бібліогр.: 28 назв. — укр. |
Репозитарії
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraineid |
irk-123456789-157675 |
---|---|
record_format |
dspace |
spelling |
irk-123456789-1576752019-06-21T01:27:01Z Конформаційні можливості уридину: квантово-механічне дослідження методом функціоналу густини Жураківський, Р.О. Говорун, Д.М. Молекулярна біофізика Квантово-механічним методом функціоналу густини на рівні теорії MP2/6-311++G(d,p)//DFT B3LYP/6-31G(d,p) проведено вичерпний конформаційний аналіз уридину. Представлено основні геометричні, енергетичні та полярні характеристики усіх його 111 стійких конформерів. Отримано конформаційні рівноваги у діапазоні температур 298,15–420 К: при 298,15 К syn:anti = 10,6:89,4 %, S:N = 85,5:14,5 %; при Т = 420 К syn:anti = 16,6:83,4 %, S:N = 68,6:31,4 %. Методом квантово-механічного аналізу топології електронної густини (теорія атомів у молекулах Бейдера) в усіх можливих конформерах зафіксовано 17 типів внутрішньомолекулярних водневих зв’язків, від одного до п’яти на конформер (їхня загальна кількість – 313): C1'H...O2, C2'H2...O5', C2'H2...O2, C3'H...O2, C5'H1...O2, C5'H2...O2, C6H...O4', C6H...O5', C3'H…HC6, C5'H1…HC6, C5'H2…HC6, O2'H...O2, O2'H...O3', O3'H...O2', O3'H...O5', O5'H...O2 та O5'H...O3'. Представлено їхні конформаційні властивості, геометричні та електронно-топологічні характеристики. Complete conformational analysis of uridine is performed by density functional theory at MP2/6-311++G(d, p)//DFT B3LYP/6-31G(d, p) level. Main geometric, energetic, and polar characteristics of all 111 conformers were presented, along with conformational equilibria in temperature range of 298.15–420 K. At T = 298.15 K these are syn:anti = 10.6:89.4 %; S:N = 85.5:14.5 %, and at T = 420 K syn:anti = 16.6:83.4 %; S:N = 68.6:31.4 %. By quantum mechanical method (Bader’s atoms in molecules theory) as many as 17 types of intramolecular hydrogen bonds were established (total number is 313) in all possible conformers of uridine, namely, C1'H...O2, C2'H2...O5', C2'H2...O2, C3'H...O2, C5'H1...O2, C5'H2...O2, C6H...O4', C6H...O5', C3'H…HC6, C5'H1…HC6, C5'H2…HC6, O2'H...O2, O2'H...O3', O3'H...O2', O3'H...O5', O5'H...O2, and O5'H...O3'. Their conformational properties, geometric and electron topology characteristics were described. Квантово-механическим методом функционала плотности на уровне теории MP2/6-311++G(d, p)//DFT B3LYP/6-31G(d, p) проведен полный конформационный анализ уридина. Представлены основные геометрические, энергетические и полярные характеристики всех его 111 устойчивых конформеров. Получены конформационные равновесия в диапазоне температур 298,15–420 К: при 298,15 К syn:anti = 10,6:89,4 %, S:N=85,5:14,5 %; при Т = 420 К syn:anti = 16,6:83,4 %, S:N = 68,6:31,4 %. Методом квантово-механического анализа топологии электронной плотности (теория атомов в молекулах Бейдера) во всех возможных конформерах зафиксированы 17 типов внутримолекулярных водородных связей, от одного до пяти на конформер (их общее число – 313): C1'H...O2, C2'H2...O5', C2'H2...O2, C3'H...O2, C5'H1...O2, C5'H2...O2, C6H...O4', C6H...O5', C3'H…HC6, C5'H1...HC6, C5'H2…HC6, O2'H...O2, O2'H...O3', O3'H...O2', O3'H...O5', O5'H...O2 и O5'H...O3'. Представлены их конформационные свойства, геометрические и электронно-топологические характеристики. 2008 Article Конформаційні можливості уридину: квантово-механічне дослідження методом функціоналу густини / Р.О. Жураківський, Д.М. Говорун // Біополімери і клітина. — 2008. — Т. 24, № 2. — С. 142-157. — Бібліогр.: 28 назв. — укр. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.00079C http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/157675 577.3 uk Біополімери і клітина Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
institution |
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
collection |
DSpace DC |
language |
Ukrainian |
topic |
Молекулярна біофізика Молекулярна біофізика |
spellingShingle |
Молекулярна біофізика Молекулярна біофізика Жураківський, Р.О. Говорун, Д.М. Конформаційні можливості уридину: квантово-механічне дослідження методом функціоналу густини Біополімери і клітина |
description |
Квантово-механічним методом функціоналу густини на рівні теорії MP2/6-311++G(d,p)//DFT B3LYP/6-31G(d,p) проведено вичерпний конформаційний аналіз уридину. Представлено основні геометричні, енергетичні та полярні характеристики усіх його 111 стійких конформерів. Отримано конформаційні рівноваги у діапазоні температур 298,15–420 К: при 298,15 К syn:anti = 10,6:89,4 %, S:N = 85,5:14,5 %; при Т = 420 К syn:anti = 16,6:83,4 %, S:N = 68,6:31,4 %. Методом квантово-механічного аналізу топології електронної густини (теорія атомів у молекулах Бейдера) в усіх можливих конформерах зафіксовано 17 типів внутрішньомолекулярних водневих зв’язків, від одного до п’яти на конформер (їхня загальна кількість – 313): C1'H...O2, C2'H2...O5', C2'H2...O2, C3'H...O2, C5'H1...O2, C5'H2...O2, C6H...O4', C6H...O5', C3'H…HC6, C5'H1…HC6, C5'H2…HC6, O2'H...O2, O2'H...O3', O3'H...O2', O3'H...O5', O5'H...O2 та O5'H...O3'. Представлено їхні конформаційні властивості, геометричні та електронно-топологічні характеристики. |
format |
Article |
author |
Жураківський, Р.О. Говорун, Д.М. |
author_facet |
Жураківський, Р.О. Говорун, Д.М. |
author_sort |
Жураківський, Р.О. |
title |
Конформаційні можливості уридину: квантово-механічне дослідження методом функціоналу густини |
title_short |
Конформаційні можливості уридину: квантово-механічне дослідження методом функціоналу густини |
title_full |
Конформаційні можливості уридину: квантово-механічне дослідження методом функціоналу густини |
title_fullStr |
Конформаційні можливості уридину: квантово-механічне дослідження методом функціоналу густини |
title_full_unstemmed |
Конформаційні можливості уридину: квантово-механічне дослідження методом функціоналу густини |
title_sort |
конформаційні можливості уридину: квантово-механічне дослідження методом функціоналу густини |
publisher |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
publishDate |
2008 |
topic_facet |
Молекулярна біофізика |
url |
http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/157675 |
citation_txt |
Конформаційні можливості уридину: квантово-механічне дослідження методом функціоналу густини / Р.О. Жураківський, Д.М. Говорун // Біополімери і клітина. — 2008. — Т. 24, № 2. — С. 142-157. — Бібліогр.: 28 назв. — укр. |
series |
Біополімери і клітина |
work_keys_str_mv |
AT žurakívsʹkijro konformacíjnímožlivostíuridinukvantovomehaníčnedoslídžennâmetodomfunkcíonalugustini AT govorundm konformacíjnímožlivostíuridinukvantovomehaníčnedoslídžennâmetodomfunkcíonalugustini |
first_indexed |
2025-07-14T10:06:03Z |
last_indexed |
2025-07-14T10:06:03Z |
_version_ |
1837616399737946112 |
fulltext |
ÌÎËÅÊÓËßÐÍÀ Á²ÎÔ²ÇÈÊÀ
Êîí ôîð ìàö³éí³ ìîæ ëè âîñò³ óðè äè íó:
êâàí òî âî-ìå õàí³÷íå äîñë³äæåí íÿ ìå òî äîì
ôóíêö³îíà ëó ãóñòèíè
Ð. Î. Æó ðàê³âñüêèé, Ä. Ì. Ãî âî ðóí1
Íàö³îíàëü íèé óí³âåð ñè òåò ³ìåí³ Òà ðà ñà Øåâ ÷åí êà
Âóë. Âî ëî äè ìè ðñüêà, 64, Êè¿â, 01033, Óêðà¿ íà
1²íñòè òóò ìî ëå êó ëÿð íî¿ á³îëî㳿 ³ ãå íå òè êè ÍÀÍ Óêðà¿ íè
Âóë. Àêàäåì³êà Çà áî ëîò íî ãî, 150, 03680, Êè¿â, Óêðà¿ íà
zhr@univ.kiev.ua
Êâàí òî âî-ìå õàí³÷íèì ìå òî äîì ôóíêö³îíà ëó ãóñ òè íè íà ð³âí³ òåî𳿠MP2/6-311++G(d,p)//DFT
B3LYP/6-31G(d,p) ïðî âå äå íî âè ÷åð ïíèé êîí ôîð ìàö³éíèé àíàë³ç óðè äè íó. Ïðåä ñòàâ ëå íî îñíîâí³ ãå î -
ìåò ðè÷í³, åíåð ãå òè÷í³ òà ïî ëÿðí³ õà ðàê òå ðèñ òè êè óñ³õ éîãî 111 ñò³éêèõ êîí ôîð ìåð³â. Îòðè ìà íî
êîí ôîð ìàö³éí³ ð³âíî âà ãè ó ä³àïà çîí³ òåì ïå ðà òóð 298,15–420 Ê: ïðè 298,15 Ê syn:anti = 10,6:89,4 %,
S:N = 85,5:14,5 %; ïðè Ò = 420 Ê syn:anti = 16,6:83,4 %, S:N = 68,6:31,4 %. Ìå òî äîì êâàí òî âî-ìå -
õàí³÷íî ãî àíàë³çó òî ïî ëî㳿 åëåê òðîí íî¿ ãóñ òè íè (òåîð³ÿ àòîì³â ó ìî ëå êó ëàõ Áåé äå ðà) â óñ³õ ìîæ ëè -
âèõ êîí ôîð ìå ðàõ çàô³êñî âà íî 17 òèï³â âíóòð³øíüî ìî ëå êó ëÿð íèõ âîä íå âèõ çâ’ÿçê³â, â³ä îä íî ãî äî
ï’ÿ òè íà êîí ôîð ìåð (¿õíÿ çà ãàëü íà ê³ëüê³ñòü – 313): C1'H...O2, C2'H2...O5', C2'H2...O2, C3'H...O2,
C5'H1...O2, C5'H2...O2, C6H...O4', C6H...O5', C3'H…HC6, C5'H1…HC6, C5'H2…HC6, O2'H...O2,
O2'H...O3', O3'H...O2', O3'H...O5', O5'H...O2 òà O5'H...O3'. Ïðåä ñòàâ ëå íî ¿õí³ êîí ôîð ìàö³éí³ âëàñ -
òè âîñò³, ãå î ìåò ðè÷í³ òà åëåê òðîí íî-òî ïî ëîã³÷í³ õà ðàê òå ðèñ òè êè.
Êëþ ÷îâ³ ñëî âà: óðè äèí, êîí ôîð ìàö³éíèé àíàë³ç, êâàí òî âî-ìåõàí³÷íèé ìå òîä ôóíêö³îíà ëó ãóñ òè íè,
âíóòð³øíüî ìî ëå êó ëÿðí³ âîä íåâ³ çâ’ÿç êè, àíàë³ç òî ïî ëî㳿 åëåê òðîí íî¿ ãóñ òè íè.
Âñòóï. Âèâ ÷åí íÿ êîí ôîð ìàö³éíèõ âëàñ òè âîñ òåé
³çîëü î âà íèõ íóê ëå î çèä³â òà ç’ÿ ñó âàí íÿ ïðè ðî äè
âíóòð³øíüî ìî ëå êó ëÿð íèõ âçàºìîä³é, çîê ðå ìà, âîä -
íå âèõ çâ’ÿçê³â, ÿê³ ¿õ ñòàá³ë³çó þòü, º êëà ñè÷ íîþ
ïðî áëå ìîþ ñó ÷àñ íî¿ á³îõ³ì³¿, ìî ëå êó ëÿð íî¿ ôàð ìà -
êî ëî㳿 òà ñòðóê òóð íî¿ á³îëî㳿 [1, 2]. Ñàìå ó ö³é
ïëî ùèí³ òðå áà ïðî âî äè òè äîñë³äæåí íÿ, ÿê³ äîç âî -
ëÿòü çðî çóì³òè á³îëîã³÷íó àê òèâí³ñòü ìî äèô³êî âà -
íèõ íóê ëå î çèä³â òà «ìî ëå êó ëÿð íó ëîã³êó» ïðî ñòî -
ðî âî¿ áó äî âè òà ôóíêö³îíó âàí íÿ íóê ëå¿ íî âèõ
êèñëîò.
Ó ïî ïå ðåäí³õ íà øèõ ðî áî òàõ ðå àë³çî âà íî íî âèé
ï³äõ³ä äî òå î ðå òè÷ íî ãî êîí ôîð ìàö³éíî ãî àíàë³çó
2'-äåç îêñè ðè áî íóê ëå î çèä³â: êâàí òî âî-ìå õàí³÷íèì
ìå òî äîì ôóíêö³îíà ëó ãóñ òè íè âïåð øå îò ðè ìà íî
ïî âíó êîí ôîð ìàö³éíó ðî äè íó 1',2'-äè äå çîê ñè ðè áî -
çè – ìî äåëü íî ãî öóê ðî âî ãî çà ëèø êó âè ùåç ãà äà íèõ
íóê ëå î çèä³â [3] – ³ íà éî ãî îñíîâ³ çä³éñíå íî ïî âíèé
êîí ôîð ìàö³éíèé àíàë³ç óñ³õ êà íîí³÷íèõ íóê ëå î -
çèä³â – òèì³äè íó [4], 2'-äåç îêñè öè òè äè íó [5],
2'-äåçîêñè à äå íî çè íó [6], 2'-äåç îêñè ãó à íî çè íó [7] òà
ì³íîðíîãî íóêëåîçèäó 2'-äåç îêñè ó ðè äè íó [8].
Öÿ ïðà öÿ ïðî äîâ æóº ñåð³þ àíà ëîã³÷íèõ
äîñë³äæåíü êà íîí³÷íèõ ðè áî íóê ëå î çèä³â – âî íà
ïðè ñâÿ ÷å íà ïî âíî ôîð ìàò íî ìó êâàí òî âî-ìå -
õàí³÷íî ìó êîí ôîð ìàö³éíî ìó àíàë³çó óðè äè íó
(Urd). Ìè òà êîæ ðî áè ìî ñïðî áó äîñë³äè òè ìå òî äîì
àíàë³çó òî ïî ëî㳿 åëåê òðîí íî¿ ãóñ òè íè [9] ïðè ðî äó
142
ISSN 0233-7657. Á³îïîë³ìåðè ³ êë³òèíà. 2008. Ò. 24. ¹ 2
Ó Ð. Î. ÆÓÐÀʲÂÑÜÊÈÉ, Ä. Ì. ÃÎÂÎÐÓÍ, 2008
âíóòð³øíüî ìî ëå êó ëÿð íèõ Í-çâ’ÿçê³â ó âñ³õ áåç
âèíÿòêó éîãî ñò³éêèõ êîíôîðìåðàõ.
Ìà òåð³àëè ³ ìå òî äè. Äëÿ âèâ ÷åí íÿ êîí ôîð -
ìàö³éíèõ âëàñ òè âîñ òåé Urd âè êî ðèñ òà íî òå îð³þ
ôóíêö³îíà ëó ãóñ òè íè (DFT) ³ç çà ñòî ñó âàí íÿì
ã³áðèä íî ãî îáì³ííî-êî ðå ëÿö³éíî ãî ôóíêö³îíà ëó
åëåê òðîí íî¿ ãóñ òè íè â óçà ãàëü íå íî ìó ãðà䳺íòíî ìó
íà áëè æåíí³ B3LYP [10–12]. Äëÿ îïòèì³çàö³¿ ãå î -
ìåò𳿠ìè ñêî ðèñ òà ëè ñÿ ñòàí äàð òíèì íà áî ðîì áà -
çèñ íèõ ôóíêö³é 6-31G(d, p), ÿê³ çà äîâ³ëüíî çà ðå êî -
ìåí äó âà ëè ñå áå äëÿ ïîä³áíèõ çà äà÷ [3–8]. Óñ³
îïòèì³çî âàí³ êîí ôîð ìå ðè ïå ðåâ³ðå íî íà ñò³éê³ñòü
çà â³äñóòí³ñòþ óÿâ íèõ ÷àñ òîò ó ¿õí³õ êî ëè âàëü íèõ
ñïåê òðàõ. Îñòàíí³ îò ðè ìà íî íà çãà äà íî ìó ð³âí³ òå -
î𳿠ó ãàð ìîí³éíî ìó íà áëè æåíí³. Ùîá êî ðåêòí³øå
âðà õó âà òè åëåê òðîí íî-êî ðå ëÿö³éí³ åôåê òè, äëÿ âñ³õ
êîí ôîð ìåð³â çðîá ëå íî ðîç ðà õóí êè åëåê òðîí íî¿
åíåð㳿 çà ìå òî äîì òå î𳿠çáó ðåíü äðó ãî ãî ïî ðÿä êó
(MP2) ç á³ëüøèì íà áî ðîì áà çèñ íèõ ôóíêö³é
6-311++G(d, p). Çíà ÷åí íÿ åíåð㳿 óááñà (DG) âèç íà -
÷å íî ÿê ñó ìó åëåê òðîí íî¿ åíåð㳿, ðîç ðà õî âà íî¿ íà
ð³âí³ òå î𳿠MP2/6-311++G(d, p), åíåð㳿 íóëü î âèõ
êî ëè âàíü ìî ëå êó ëè, òåðì³÷íèõ ïî ïðà âîê äî åí -
òàëüﳿ òà åí òðîï³éíî ãî ôàê òî ðà, îá÷èñëåíèõ íà
ð³âí³ òå î𳿠DFT B3LYP/6-31G(d, p).
Íà ÿâí³ñòü âíóòð³øíüî ìî ëå êó ëÿð íèõ Í-çâ’ÿçê³â
âñòà íîâ ëþ âà ëè ìå òî äîì êâàí òî âî-ìå õàí³÷íî ãî
àíàë³çó òî ïî ëî㳿 åëåê òðîí íî¿ ãóñ òè íè çà Áåé äå ðîì
[9], âè êî ðèñ òî âó þ ÷è ïðî ãðàì íèé ïà êåò AIM2000.
Õâèëü îâ³ ôóíêö³¿ äëÿ àíàë³çó ðîç ïîä³ëó åëåê òðîí -
íî¿ ãóñ òè íè ðîç ðà õî âà íî íà ð³âí³ òåî𳿠DFT
B3LYP/6-31G(d, p).
Óñ³ êâàí òî âî-ìå õàí³÷í³ îá ÷èñ ëåí íÿ ïðî âå äå íî ç
âè êî ðèñ òàí íÿì ïðî ãðàì íî ãî ïà êå òó «GAUSSI-
AN03» äëÿ ïëàò ôîð ìè Win32 [13].
Âè êî ðèñ òàí³ â ðî áîò³ ïî çíà ÷åí íÿ ñå ìè êëà ñè÷ -
íèõ êîí ôîð ìàö³éíèõ çì³ííèõ º ñòàí äàðòíèìè [14].
Äëÿ õà ðàê òå ðèñ òè êè ïðî ñòî ðî âî¿ îð³ºíòàö³¿ ã³äðîê -
ñèëü íî¿ ãðó ïè O2'H äî äàò êî âî ââå äå íî òîðñ³éíèé
êóò h = C3'C2'O2'H, à äëÿ îïè ñó âçàºìíî¿ îð³ºíòàö³¿
çâ’ÿçê³â O3'C3' òà C2'O2' – òîðñ³éíèé êóò q = O3'C3'
C2'O2'. Çà ì³ðó êîí ôîð ìàö³éíî¿ ì³íëè âîñò³ òî ãî ÷è
³íøî ãî ñòðóê òóð íî ãî ïà ðà ìåò ðà – äîâ æè íè çâ’ÿç êó,
âå ëè ÷è íè âà ëåí òíî ãî êó òà – âè êî ðèñ òà íî
áåçðîçì³ðíó âå ëè ÷è íó D, ÿêà º â³äíî øåí íÿì ñòàí -
äàð òíî ãî â³äõè ëåí íÿ âå ëè ÷è íè ñòðóê òóð íî ãî ïà ðà -
ìåò ðà äî éî ãî ñå ðåä íüî ãî çíà ÷åí íÿ.
Êî åô³ö³ºíòè ë³í³éíî¿ êî ðå ëÿö³¿ ì³æ òîðñ³éíè ìè
êó òà ìè, ÿê³ çì³íþ þòü ñÿ öèêë³÷íî â³ä 0 äî 360°, îá -
÷èñ ëþ âà ëè çà ìå òî äè êîþ, çà ïðî ïî íî âà íîþ ³ ðå -
àë³çî âà íîþ ó ðîáîò³ [15].
Ðå çóëü òà òè ³ îá ãî âî ðåí íÿ. Îòðè ìàí³ ðå çóëü òà -
òè ïðåä ñòàâ ëå íî â òàáë. 1–3 òà íà ðèñ. 1–6.
Êîí ôîð ìàö³éí³ âëàñ òè âîñò³. Âïåð øå âñòà íîâ -
ëå íî, ùî ³çîëü î âà íèé Urd ìຠ111 ñò³éêèõ êîí ôîð -
ìåð³â, ÿê³ ëå æàòü ó ä³àïà çîí³ â³äíîñ íèõ åíåðã³é
óááñà 0–11,64 êêàë/ìîëü çà íîð ìàëü íèõ óìîâ. Çà
ñâî¿ ìè êîí ôîð ìàö³éíè ìè îçíà êà ìè òà ê³ëüê³ñòþ
âî íè ðîç ïîä³ëåí³ òàêèì ÷èíîì.
Syn-îð³ºíòàö³þ öóê ðî âî ãî çà ëèø êó â³äíîñ íî
íóê ëå î òèä íî¿ îñíî âè çàô³êñî âà íî ó 35 êîí ôîð ìå -
ðàõ (55,9°£c syn£81,4°), à 76 êîí ôîð ìåð³â ìà þòü
anti-îð³ºíòàö³þ (178,2°; –177,6°£canti£–115,3°).
Ç-ïîì³æ anti-êîí ôîð ìåð³â âèð³çíÿºòüñÿ îêðå ìà
ãðó ïà ç 50 êîí ôîð ìåð³â (canti=178,2°; –177,6°£canti £
£–157,8°), 48 ç íèõ ìà þòü âíóòð³øíüî ìî ëå êó ëÿð -
íèé Í-çâ’ÿ çîê Ñ6H…O4' (äèâ. íè æ÷å). Ïå ðå âà æà þ -
÷à ê³ëüê³ñòü anti-êîí ôîð ìåð³â òà çíà÷ íî á³ëüøèé
ä³àïà çîí ¿õí³õ òîðñ³éíèõ êóò³â c ñâ³ä÷àòü ïðî òå, ùî
äëÿ íèõ ìà þòü ì³ñöå ìåíø³ ñòå ðè÷í³ îá ìå æåí íÿ,
çó ìîâ ëåí³ íå âà ëåí òíîþ âçàºìî䳺þ ì³æ öóê ðî âèì
çà ëèø êîì òà îñíî âîþ, í³æ äëÿ syn-êîí ôîð ìåð³â.
ʳëüê³ñòü êîí ôîð ìåð³â ç ï³âí³÷íîþ (N) êîí ôîð -
ìàö³ºþ ôó ðà íîç íî ãî ê³ëüöÿ öóê ðî âî ãî çà ëèø êó
(PN = 329,4°, PN = 339,8°; 0,4°£PN£43,31) (¿õ 37)
ïîì³òíî ìåí øà, í³æ òà êà ç ï³âäåí íîþ (S) êîí ôîð -
143
ÊÎÍÔÎÐÌÀÖ²ÉͲ ÌÎÆËÈÂÎÑÒ² ÓÐÈÄÈÍÓ: ÊÂÀÍÒÎÂÎ-ÌÅÕÀͲ×ÍÅ ÄÎÑË²ÄÆÅÍÍß
Ðèñ. 1. Ñòðóê òó ðà òà ïî çíà ÷åí íÿ àòîìiâ ìî ëå êó ëè óðè äè íó
ìàö³ºþ ôó ðà íîç íî ãî ê³ëüöÿ (136,0°£PS£202,4°) (¿õ
59); îêð³ì òî ãî, 13 êîí ôîð ìåð³â ìà þòü çíà ÷åí íÿ êó -
òà ïñåâ äî î áåð òàí íÿ 46,3°£PE£108,5°, ùî ëå æàòü ó
ñõ³äíî ìó (E) êâàä ðàíò³. Øèð øèé ä³àïà çîí êóò³â
ïñåâ äî î áåð òàí íÿ P òà âóæ ÷èé ä³àïà çîí çì³í ìàê ñè -
ìàëü íî ãî âè ãè íó ôó ðà íîç íî ãî ê³ëüöÿ nmax (àìïë³òó -
äè ïñåâ äî î áåð òàí íÿ) ñâ³ä÷àòü ïðî òå, ùî S-êîí ôîð -
ìå ðè ñòå ðè÷ íî ìåí øå îá ìå æåí³, í³æ N-êîí ôîð ìå -
ðè. Ïðè öüî ìó S- òà N-êîí ôîð ìå ðè íå çâî äÿòü ñÿ
ëè øå äî «êëà ñè÷ íèõ» Ñ2'endo òà Ñ3'endo
â³äïîâ³äíî. Õî ÷à ê³ëüê³ñòü îñòàíí³õ ó çà ãàëüí³é ÷è -
ñåëü íîñò³ ñâ ï³äðî äè íè º ìàê ñè ìàëü íîþ (40 òà
28 â³äïîâ³äíî), ïðî òå ïî ðÿä ç íè ìè ñïîñ òåð³ãà þòü ñÿ
é ³íø³ – 15 êîí ôîð ìåð³â Ñ3'exo ³ ï’ÿòü êîí ôîð ìåð³â
Ñ1'exo â S-ï³äðî äèí³ òà 17 êîí ôîð ìåð³â Ñ4'exo ³ äâà
Ñ2'exo ñå ðåä N-ï³äðî äè íè, à òà êîæ ÷î òè ðè E-êîí -
ôîð ìå ðè O4'endo.
Ðîç ïîä³ë çíà ÷åíü òîðñ³éíèõ êóò³â g äëÿ âñ³õ
ìîæ ëè âèõ êîí ôîð ìåð³â Urd – òðè ìî äàëü íèé. Ïðè
öüî ìó âî íè çà é ìà þòü òðè äî âîë³ âóçü êèõ ñåê òî ðè:
g+ (42,7°£g+£64,0°) (39 êîí ôîð ìåð³â), t (158,8°£gt
£180,0°; –180,0°£gt£–170,5°) (35 êîí ôîð ìåð³â) ³ g–
(–75,4°£gg–£–56,1°) (37 êîí ôîð ìåð³â).
144
ÆÓÐÀʲÂÑÜÊÈÉ Ð. Î., ÃÎÂÎÐÓÍ Ä. Ì.
Ðèñ. 2. Çà ëåæíiñòü âiäíîñ íî¿ âiëüíî¿ åíåðãi¿ Ãiááñà DG (à) òà ìàê ñè ìàëü íî ãî âè ãè íó êiëüöÿ öóê ðî âî ãî çà ëèø êó nmax (á) âiä ôà çî âî ãî
êóòà ïñåâ äî î áåð òàí íÿ ôó ðà íîç íî ãî ê³ëüöÿ öóê ðî âî ãî çà ëèø êó P óñ³õ ìîæ ëè âèõ êîí ôîð ìåð³â óðè äè íó
Ðèñ. 3. Êîí ôîð ìàöiéíi êiëüöÿ äëÿ îñíîâ íèõ ñòðóê òóð íèõ ïà ðà -
ìåòðiâ óðè äè íó
Òðè ìî äàëü íèé ðîç ïîä³ë ìຠì³ñöå ³ äëÿ êóò³â b,
ÿê³ çà é ìà þòü ò³ æ ñàì³ ñåê òî ðè g+, t ³ g–: g+ (42,7°£bg+£
£83,6°) (34 êîí ôîð ìå ðè), t (169,0°£bt£180,0°;
–180,0°£bt£–169,1°) (34 êîí ôîð ìå ðè) ³ g– (–88,8°£
£bg–£–43,6°) (38 êîí ôîð ìåð³â). Ï’ÿòü êîí ôîð ìåð³â
ìà þòü çíà ÷åí íÿ êó òà b = –93,7°; –90,0°; 91,2°; 98,0° ³
98,3°, ùî ïðè ëÿ ãà þòü äî ñåê òîð³â g– ³ g+.
Äëÿ êó òà e ìàºìî ñåê òî ðè, ùî ò³ëüêè ÷àñ òêî âî
çá³ãà þòü ñÿ ç³ ñòàí äàð òíè ìè: g+ (23,1°£eg+£100,9°)
(38 êîí ôîð ìåð³â), t (142,5°£et£149,6°; –165,2°£
£et£–144,6°) (36 êîí ôîð ìåð³â) ³ g– (–97,5°£eg–£
£–46,21) (37 êîí ôîð ìåð³â). Öå ïî â’ÿ çà íî ³ç ñïå -
öèô³÷íîþ âçàºìî䳺þ ã³äðîê ñèëü íèõ ãðóï ïðè àòî -
ìàõ Ñ2' òà Ñ3'. Êîí ôîð ìå ðè ³ç eÎt ðîç ïîä³ëÿ þòü ñÿ çà
êó òîì e íà äâ³ ï³äãðó ïè – âóæ ÷ó ³ øèð øó: äî ïåð øî¿
âõî äÿòü 22 êîí ôîð ìå ðè ç H-çâ’ÿç êîì O3'H…O2'.
Îêð³ì òî ãî, âñ³ êîí ôîð ìå ðè ö³º¿ ãðó ïè ìà þòü
S-êîí ôîð ìàö³þ öóê ðó. Äî äðó ãî¿ ï³äãðó ïè íà ëå -
æàòü 14 êîí ôîð ìåð³â, ñòàá³ë³çî âà íèõ H-çâ’ÿç êîì
O2'H…O3' ³ ìà þòü N-êîí ôîð ìàö³þ öóê ðó (îêð³ì
îä íî ãî êîí ôîð ìå ðà C1'exo).
Ðîç ïîä³ë òîðñ³éíèõ êóò³â d äëÿ âñ³õ ìîæ ëè âèõ
êîí ôîð ìåð³â Urd º á³ìî äàëü íèì. Âî íè çà é ìà þòü
äâà ñåê òî ðè – îäèí (âóæ ÷èé) (75,9°£ d £112,4°) ïî -
áëè çó âå ðõíüî¿ ìåæ³ ñåê òî ðà g+ (52 êîí ôîð ìå ðè),
³íøèé (øèð øèé) (130,2°£ d £159,6°) – ïî áëè çó íè -
æíüî¿ ìåæ³ ñåê òî ðà t (59 êîí ôîð ìåð³â). Ïðè öüî ìó
âóæ ÷èé ñåê òîð ïðåä ñòàâ ëå íèé ëè øå N-êîí ôîð ìå -
ðà ìè, à øèð øèé – S-êîí ôîð ìå ðà ìè ôó ðà íîç íî ãî
ê³ëüöÿ öóê ðî âî ãî çà ëèø êó. Âñ³ E-êîí ôîð ìå ðè íà ëå -
æàòü äî âóæ ÷î ãî ñåê òî ðà g+ êóò³â d.
Òà êèì ÷è íîì, ñïîñ òåð³ãàºòüñÿ ïðè áëèç íî
ð³âíîì³ðíèé ê³ëüê³ñíèé ðîç ïîä³ë óñ³õ ìîæ ëè âèõ
êîí ôîð ìåð³â Urd çà êëà ñè÷ íè ìè òîðñ³éíè ìè êó òà -
ìè g, b ³ e â ñåê òî ðàõ g+, t ³ g– òà êó òîì d ïî áëè çó ñåê -
òîð³â g+ ³ t.
óäðîê ñèë ó ïî ëî æåíí³ 2' íà áó âຠòðüîõ
îð³ºíòàö³é (òîðñ³éíèé êóò h) – äî îñíî âè (ñåê òîð
êóò³â t: 145,6°£h£180,0°; –177,2°£h£149,3°, 37 êîí -
ôîð ìåð³â), ï³ä öóê ðî âèé çà ëè øîê (ñåê òîð êóò³â g+:
19,9°£h£84,9°, 35 êîí ôîð ìåð³â) ³ äî ã³äðîê ñè ëó
O3'H (ñåê òîð êóò³â g–: –99,9°£h£–21,7°, 39 êîí ôîð -
ìåð³â). Âçàºìíà îð³ºíòàö³ÿ çâ’ÿçê³â O3'C3' ³ C2'O2'
òà êà, ùî òîðñ³éíèé êóò q ëå æèòü ó äâîõ ñåê òî ðàõ:
–44,0°£ q £ –20,2° òà 14,6°£q£44,2°.
Âèâ ÷à þ ÷è ñòðóê òóðí³ îñîá ëè âîñò³ âñ³õ ìîæ ëè -
âèõ êîí ôîð ìåð³â Urd, ìè íå îá ìå æè ëè ñÿ àíàë³çîì
¿õí³õ îñíîâ íèõ (íî ìåí êëà òóð íèõ) õà ðàê òå ðèñ òèê, à
äîñë³äè ëè êîí ôîð ìàö³éíó ì³íëèâ³ñòü óñ³õ áåç âè -
íÿò êó ñòðóê òóð íèõ ïà ðà ìåòð³â, à ñà ìå – äîâ æèí
õ³ì³÷íèõ çâ’ÿçê³â, âå ëè ÷èí âà ëåí òíèõ êóò³â òà
òîðñ³éíèõ êóò³â, ùî îïè ñó þòü íå ïëî ùèíí³ñòü ãå òå -
ðî öèê ëó îñíî âè òà âèõ³ä ãë³êî çèä íî ãî çâ’ÿç êó ³ç ñå -
ðåä íüî¿ ïëî ùè íè ãå òå ðî öèê ëó îñíîâè. Ïðè öüîìó
çàô³êñîâàíî òàê³ çàêîíîì³ðíîñò³.
Ãå òå ðî öèêë íóê ëå î òèä íî¿ îñíî âè ó ñêëàä³ íóê -
ëå î çè äó º íå ïëàñ êèì – íå çàô³êñî âà íî æîä íî ãî êîí -
ôîð ìå ðà ³ç 111, ó ÿêî ìó á îñíî âà ìà ëà ïëàñ êèé ãå òå -
ðî öèêë (ó êîí ôîð ìàö³¿ ç íà é ïëàñê³øèì ãå òå ðî öèê -
ëîì âíóòð³øíüî öèê ëîâ³ òîðñ³éí³ êó òè íå
ïå ðå âè ùó þòü 0,44°). (Íà ãà äàºìî äëÿ ïîð³âíÿí íÿ,
ùî ³çîëü î âà íèé Ura º ïëàñ êîþ ìî ëå êó ëîþ.) Àíàë³ç
÷èñ ëî âèõ çíà ÷åíü øåñ òè òîðñ³éíèõ êóò³â, ÿê³ îïè ñó -
þòü âèõ³ä àòîì³â ãå òå ðî öèê ëó ³ç ïëî ùè íè îñíî âè:
C6N1C2N3, C5C6N1C2, N1C2N3C4, N3C4C5C6,
C4C5C6N1 òà C2N3C4C5, âêà çóº íà òå, ùî êîí ôîð -
ìàö³éíî íà é ÷óò ëèâ³øè ìè ç-ïîì³æ íèõ º òðè ïåð -
øèõ. Âî íè çì³íþ þòü ñÿ â íà é øèð øèõ ìåæ àõ:
–5,3° ̧+8,8°; –7,6° ̧ +3,8° ³ –5,6° ̧ +3,9° â³äïîâ³äíî.
Äëÿ òðüîõ íà ñòóï íèõ òîðñ³éíèõ êóò³â ö³ ìåæ³
ìåíø³: –3,0° ̧ +3,2°; –1,5° ̧ +2,0° ³ –1,2° ̧ +0,8°
â³äïîâ³äíî. Çàç íà ÷åí³ òîðñ³éí³ êó òè çêî ðåëü î âàí³
òà êèì ÷è íîì, ùî ¿õíÿ àëãåáðà¿÷íà ñóìà äëÿ
êîæíîãî êîíôîðìåðà áëèçüêà äî íóëÿ ³ íå
ïåðåâèùóº çà ìîäóëåì 0,34°.
145
ÊÎÍÔÎÐÌÀÖ²ÉͲ ÌÎÆËÈÂÎÑÒ² ÓÐÈÄÈÍÓ: ÊÂÀÍÒÎÂÎ-ÌÅÕÀͲ×ÍÅ ÄÎÑË²ÄÆÅÍÍß
Ðèñ. 4. Òåì ïå ðà òóð íà çà ëåæí³ñòü â³äíî øåí íÿ ñó ìàð íèõ çà ñå ëå -
íîñ òåé ï³äðî äè íè êîí ôîð ìåð³â óðè äè íó syn:anti (1) òà
North:South (2)
²íøîþ ñòðóê òóð íîþ îñîá ëèâ³ñòþ êîí ôîð ìåð³â
Urd º âèõ³ä ãë³êî çèä íî ãî çâ’ÿç êó C1'N1 ³ç ñå ðåä íüî¿
ïëî ùè íè ãå òå ðî öèê ëó íóê ëå î òèä íî¿ îñíî âè. Ñå -
ðåä íüîþ ïëî ùè íîþ ãå òå ðî öèê ëó ââà æà þòü ïëî ùè -
íó, ïðî âå äå íó òà êèì ÷è íîì, ùîá çà áåç ïå ÷è òè
ì³í³ìàëü íå çíà ÷åí íÿ ñó ìè êâàä ðàò³â â³äñòà íåé â³ä
íå¿ äî àòîì³â ãå òå ðî öèê ëó. Çã³äíî ç îò ðè ìà íè ìè ðå -
çóëü òà òà ìè, êóò âè õî äó çâ ÿç êó C1'N1 ç ïëî ùè íè ãå -
òå ðî öèê ëó îñíî âè çì³íþºòüñÿ â³ä –5,3° äî +7,4°
(çíàê «+» â³äïîâ³äຠïîëîæåííþ, êî ëè âåê òî ðè
N1C2, N1C6 òà N1C1' óòâî ðþ þòü ïðà âó òð³éêó), à
òîðñ³éí³ êó òè C1'N1C2N3 ³ C1'N1C6C5 ëå æàòü ó
ìåæ àõ (174,9°, 180°) ³ (–180°, –172,0°) òà (172,1°,
180°) ³ (–180°, –174,1°) â³äïîâ³äíî.
Ðàí³øå íå ïëî ùèíí³ñòü ãå òå ðî öèê ëó îñíîâ ó
ï³ðèì³äè íî âèõ ðè áî íóê ëå î çè äàõ òà âèõ³ä ãë³êî çèä -
íî ãî çâ’ÿç êó ç ïëî ùè íè ãå òå ðî öèê ëó îñíî âè â íèõ
ô³êñó âà ëè â êðèñ òàë³÷íî ìó ñòàí³ ðåí òãå íîñ òðóê -
òóð íèì àíàë³çîì [16]. Îäíàê áó ëî íå çðî çóì³ëî, ÷è
öåé åôåêò çî áîâ ’ÿ çà íèé ñè ëàì êðèñ òàë³÷íî ãî ïà êó -
âàí íÿ, ÷è â³í ìຠ³ âíóòð³øíüî ìî ëå êó ëÿð íó ñêëà äî -
âó. Ïðî âå äå íèé íà ìè êîí ôîð ìàö³éíèé àíàë³ç
â³ëüíî ãî íóê ëå î çè äó äå ìî íñòðóº, ùî òàê³ åôåê òè
ìà þòü âíóòð³øíüî ìî ëå êó ëÿð íå ïî õîä æåí íÿ ³ ïðè
ïå ðå õîä³ â êðèñòàë, î÷åâèäíî, äî äàò êî âî çáó ðþ -
þòü ñÿ ñèëàìè êðèñòàë³÷íîãî ïàêóâàííÿ.
Ç-ïîì³æ óñ³õ õ³ì³÷íèõ çâ’ÿçê³â íóê ëå î çè äó êîí -
ôîð ìàö³éíî íà é ÷óò ëèâ³øèì º ãë³êî çèä íèé çâ’ÿ -
146
ÆÓÐÀʲÂÑÜÊÈÉ Ð. Î., ÃÎÂÎÐÓÍ Ä. Ì.
Ðèñ. 5. Ïîð³âíÿí íÿ ðîç -
ðà õî âà íî ãî êî ëè âàëü íî -
ãî ²× ñïåê òðà óðè äè íó
(à–â) ïðè T = 420 K ç åêñ-
ïå ðè ìåí òàëü íèì [17]
(ã). ²íäèâ³äó àëüí³ ñìó ãè
êî ëè âàíü àï ðîê ñè ìî âà -
íî ôóíêö³ºþ Ãà óñ ñà ç
íàï³âøè ðè íîþ Dn1/2 =
= 8,5 ñì–1, ÿêà çà áåç ïå -
÷óº ãëàä åíüêèé ðå çóëü -
òó þ ÷èé ñïåêòð
çîê – äëÿ íüî ãî ïà ðà ìåòð D ñòà íî âèòü 0,0095, äîâ -
æè íà çâ’ÿç êó çì³íþºòüñÿ â ìåæ àõ 1,448–1,502 &À, à
ñå ðåäíº çíà ÷åí íÿ ñêëà äຠ1,473 &À. Äëÿ ïîð³âíÿí íÿ
çà çíà ÷è ìî, ùî äëÿ çâ’ÿçê³â N1C2, C2O2 òà C2N3
îñíî âè 0,0025£D£0,0046, äëÿ çâ’ÿçê³â N3C4, N1C6,
C6H, C5C6 – 0,001£D£0,002, à çâ’ÿç êè C4C5, C4O4,
N3H ³ C5H º êîí ôîð ìàö³éíî íå ÷óò ëè âè ìè
(D<0,001). Ó öóê ðî âî ìó çà ëèø êó íà éá³ëüø³ çíà ÷åí -
íÿ D, îêð³ì C1'N1, ìà þòü çâ’ÿç êè C2'O2', C3'O3' ³
C1'O4' (0,0057<D<0,0078), à ì³í³ìàëü íå çíà ÷åí íÿ D
â³äì³÷åíî äëÿ çâ’ÿçê³â O5'H (D = 0,0021). Îòæå,
õ³ì³÷í³ çâ’ÿç êè öóê ðî âî ãî çà ëèø êó çà ãà ëîì êîí -
ôîð ìàö³éíî ëàá³ëüí³ø³, í³æ õ³ì³÷í³ çâ’ÿç êè îñíî âè.
Òà êó æ çà êî íîì³ðí³ñòü â³äì³÷å íî ³ äëÿ âà ëåí -
òíèõ êóò³â: âà ëåíòí³ êó òè öóê ðî âî ãî çà ëèø êó êîí -
ôîð ìàö³éíî ëàá³ëüí³ø³, í³æ âà ëåíòí³ êó òè îñíî âè.
 îñíîâ³ ïà ðà ìåòð D äëÿ íèõ çì³íþ þòü ñÿ â³ä 0,0007
(C4N3H) äî 0,0051 (N1C2O2). Ó öóê ðî âî ìó çà ëèø -
êó ö³ çì³íè çíà÷ íî á³ëüø³ ³ ñÿ ãà þòü 0,0267
(C1'C2'O2'); ïðè öüî ìó ùå ÷î òè ðè âà ëåí òíèõ êó òè
ìà þòü âå ëè êå çíà ÷åí íÿ D: Ñ2'C3'O3 (0,0238),
O5'C5'H2 (0,0228), C4'C5'O5' (0,0219) ³ O5'C5'H1
(0,0221).
Òà êèì ÷è íîì, çà âñ³ìà ñòðóê òóð íè ìè îçíà êà ìè
àçî òèñ òà îñíî âà Urd º êîí ôîð ìàö³éíî êîí ñåð âà -
òèâí³øîþ, í³æ öóê ðî âèé çàëèøîê.
Êî ðå ëÿö³éí³ çà êî íîì³ðíîñò³. Ìà þ ÷è ó ñâîºìó
ðîç ïî ðÿä æåíí³ äàí³ äëÿ ïî âíî¿ ðî äè íè êîí ôîð -
ìåð³â Urd, ìè çà ñòî ñó âà ëè ñòà òèñ òè÷í³ ï³äõî äè,
ùîá âè ÿ âè òè âçàºìîç â’ÿ çîê ì³æ íî ìåí êëà òóð íè ìè
êîí ôîð ìàö³éíè ìè ïà ðà ìåò ðà ìè, à ñà ìå –
òîðñ³éíèìè êóòàìè.
147
ÊÎÍÔÎÐÌÀÖ²ÉͲ ÌÎÆËÈÂÎÑÒ² ÓÐÈÄÈÍÓ: ÊÂÀÍÒÎÂÎ-ÌÅÕÀͲ×ÍÅ ÄÎÑË²ÄÆÅÍÍß
Ðèñ. 6. Äå êîí âî ëþö³ÿ ðîç -
ðà õî âà íî ãî êî ëè âàëü íî ãî
²× ñïåê òðà óðè äè íó â îá -
ëàñò³ âà ëåí òíèõ NH- ³
OH-êî ëè âàíü íà ñêëà äîâ³
148
ÆÓÐÀʲÂÑÜÊÈÉ Ð. Î., ÃÎÂÎÐÓÍ Ä. Ì.
Êîí-
ôîðìåð
DG D P nmax c b g d e h q
Âíóòð³øíüîìîëåêóëÿðí³
Í-çâ’ÿçêè
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13
1 0,00 4,66 180,1 32,0 –169,2 –178,4 55,9 –89,2 144,4 156,7 –37,2 2, 7, 8, 13, 14
2 1,05 2,50 164,1 34,6 –177,2 71,2 53,6 –93,6 148,3 158,0 –39,1 2, 7, 13, 14
3 1,40 4,64 19,4 32,7 –163,8 –176,5 55,4 83,9 85,0 –170,5 37,8 7, 8, 14
4 1,50 3,36 161,8 37,4 61,6 65,1 45,8 –92,3 149,6 –97,1 –36,0 2, 3, 14, 17
5 1,86 3,91 177,1 32,6 –169,1 –87,5 55,6 –89,8 145,2 154,9 –37,8 2, 7, 13, 14
6 2,05 5,79 160,9 34,6 60,8 64,6 43,8 –91,5 –87,5 27,7 –36,5 2, 3, 12, 17
7 2,07 4,02 39,3 35,0 68,3 169,0 –60,0 –153,4 –50,7 –29,2 33,6 4, 12, 15
8 2,21 4,41 19,1 33,9 –163,8 -88,2 54,7 82,6 84,8 –170,6 39,5 7, 8, 14
9 2,28 3,78 197,1 34,0 –172,9 176,9 171,3 –83,4 144,8 163,1 –37,9 7, 8, 13, 14
10 2,42 3,31 32,4 36,6 –159,1 80,2 63,8 –160,5 84,4 –173,3 37,6 7, 8, 14
11 2,42 3,56 195,9 33,9 –171,1 56,0 164,7 –83,6 144,7 161,7 –37,9 7, 8, 13, 14
12 2,44 3,40 40,1 28,3 61,7 43,9 44,1 –147,4 –144,6 –21,7 24,2 4, 12, 17
13 2,54 1,13 161,4 35,3 –169,6 –48,4 177,0 –94,4 148,6 149,9 –39,2 7, 13, 14
14 2,62 2,06 75,3 40,7 –176,5 58,8 56,0 86,9 99,4 174,5 15,3 7, 13, 14
15 2,65 0,49 72,2 41,7 –174,5 –56,5 –178,8 84,6 97,0 174,2 18,3 7, 13, 14
16 2,66 3,30 173,7 34,7 –173,9 –179,8 –69,2 –88,6 148,5 156,8 –40,6 7, 13, 14
17 2,69 2,85 172,4 34,5 –173,5 –67,0 –65,5 –89,5 148,4 156,6 –40,1 7, 13, 14
18 2,98 3,04 65,6 39,0 –172,8 88,8 52,4 82,2 96,1 177,1 22,5 7, 13, 14
19 3,00 3,03 32,3 28,9 68,2 –57,4 179,1 –147,9 –151,7 –22,3 26,8 4, 12
20 3,37 0,39 65,7 44,2 –174,7 44,2 –69,6 75,9 90,3 176,5 25,3 7, 13, 14, 16
21 3,43 4,70 40,7 36,5 69,4 –82,3 –59,8 –155,1 –55,9 –32,2 34,6 4, 12, 15
22 3,52 3,82 43,3 27,6 68,0 –58,8 –179,8 –150,2 55,7 –69,0 29,4 4
23 3,64 1,72 167,3 35,2 –173,1 71,2 –75,4 –91,8 147,9 154,1 –39,6 7, 13, 14
24 3,70 7,22 166,3 34,7 –124,8 176,3 50,9 –92,5 142,5 –93,1 –35,2 1, 2, 8, 14
25 3,74 3,05 74,4 42,1 –176,1 177,1 –173,8 –156,3 97,8 173,4 16,8 7, 13, 14
26 3,77 7,34 22,5 39,2 –163,9 177,4 –59,6 82,3 –48,3 –38,7 43,4 7, 12, 15
27 3,88 7,45 14,0 36,1 –158,3 172,1 51,0 85,3 –157,4 –33,6 37,7 7, 8, 12
28 3,96 7,36 43,3 41,0 –121,8 177,4 –58,4 80,5 –46,2 –33,8 37,0 1, 9, 12, 15
29 4,03 9,20 164,9 35,1 –124,9 174,7 50,5 –89,0 –82,8 38,5 –40,5 1, 2, 8, 12
30 4,07 2,28 76,4 40,8 –176,0 67,7 –178,6 85,6 100,9 173,1 14,6 7, 13, 14
31 4,08 4,77 55,8 24,2 62,4 43,2 46,6 –145,6 59,8 –65,1 23,0 17
32 4,10 5,09 108,5 40,2 –122,1 63,2 58,2 -128,8 –158,9 39,2 –20,2 1, 12
33 4,32 5,61 27,1 35,5 –132,1 70,9 62,1 –154,7 –155,0 –30,3 34,0 1, 8, 9, 12
34 4,35 5,04 164,6 33,3 61,6 66,0 42,7 –96,2 28,6 21,3 –31,6 3, 2, 12, 17
35 4,42 4,78 148,5 38,3 –118,6 81,0 61,2 –100,2 143,9 –92,9 –34,2 1, 8, 14
36 4,49 5,20 175,4 37,0 57,3 –67,5 159,1 –86,4 148,8 –95,4 –36,8 3, 5, 14, 17
37 4,73 4,84 173,6 31,7 64,8 173,8 –68,1 –88,0 –81,5 27,8 –35,6 3, 6, 12
38 4,74 4,34 36,9 35,5 76,5 173,8 49,5 –154,5 –150,4 –29,0 31,8 3, 4, 12
39 4,81 3,52 34,8 30,4 68,2 –171,9 –170,5 –149,7 –153,0 –22,5 27,5 4, 12
40 4,81 7,61 142,3 39,9 –130,0 –178,8 –67,1 –99,9 –80,0 34,6 –38,0 1, 12
Òàá ëè öÿ 1
Äåÿê³ ñòðóê òóðí³, åíåð ãå òè÷í³ òà ïî ëÿðí³ õà ðàê òå ðèñ òè êè ïî âíî¿ ðî äè íè êîí ôîð ìåð³â óðè äè íó
149
ÊÎÍÔÎÐÌÀÖ²ÉͲ ÌÎÆËÈÂÎÑÒ² ÓÐÈÄÈÍÓ: ÊÂÀÍÒÎÂÎ-ÌÅÕÀͲ×ÍÅ ÄÎÑË²ÄÆÅÍÍß
Ïðî äîâ æåí íÿ òàáë. 1
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13
41 5,02 4,28 49,7 37,2 70,2 48,2 –68,3 –160,1 61,8 –83,9 33,8 3, 4, 16
42 5,04 5,57 15,9 38,0 –162,7 170,5 50,0 81,1 –97,5 –175,5 42,7 7, 8
43 5,06 6,42 43,1 41,4 –122,7 –84,2 –59,1 78,9 –49,7 –36,1 37,7 1, 9, 12, 15
44 5,20 4,73 32,8 29,5 68,5 64,0 –176,2 –148,9 –151,7 –23,8 27,5 4, 12
45 5,38 6,25 9,2 35,2 –157,8 –179,3 53,5 83,4 87,2 84,7 37,5 8, 14
46 5,41 3,26 40,5 37,7 71,0 42,7 –71,3 –158,0 –159,8 –25,8 32,3 4, 12, 16
47 5,41 6,09 148,5 39,5 –126,9 –50,4 173,3 –95,8 –77,7 37,0 –39,8 1, 12
48 5,44 7,42 165,8 34,4 –124,9 –93,7 51,9 146,4 142,6 –94,7 –34,5 1, 2, 8, 14
49 5,52 5,01 19,3 38,3 –164,4 –52,9 178,3 87,7 –70,7 –44,7 43,9 7, 12
50 5,54 7,13 143,0 39,9 –129,7 –76,8 –66,3 –99,7 –90,3 34,4 –38,2 1, 12
51 5,55 2,88 172,8 34,7 66,2 177,6 –67,9 –88,8 147,8 –96,9 –35,1 3, 6, 14
52 5,56 7,39 172,2 34,6 –120,9 177,4 49,9 –92,1 36,9 28,5 –36,7 1, 2, 8, 12
53 5,62 7,26 12,6 37,0 –160,4 –90,0 53,4 84,3 –164,8 –33,1 39,3 7, 8, 12
54 5,68 4,40 17,6 37,1 –165,2 –54,1 179,2 85,6 –160,7 –33,0 38,5 7, 12
55 5,70 3,39 172,9 34,3 66,0 –67,7 –64,5 –89,3 147,6 –97,7 –34,6 3, 6, 14
56 5,72 4,65 136,0 39,8 –115,3 69,0 58,6 –111,0 36,6 19,9 –29,9 1, 12
57 5,98 9,03 166,5 36,0 –125,6 –86,9 53,5 –87,5 –72,1 41,3 –41,5 1, 2, 8, 12
58 6,03 5,24 46,3 29,4 68,7 66,8 –176,0 –151,9 65,4 –80,3 29,5 4
59 6,16 5,31 150,1 38,9 –127,3 –48,9 173,0 –98,9 145,2 –92,9 –35,3 1, 14
60 6,23 3,66 26,8 40,1 –158,7 82,9 59,1 78,5 –95,4 –177,2 41,8 7, 8
61 6,26 7,81 12,4 37,0 –161,3 –81,2 55,4 87,8 –63,2 –45,0 44,2 7, 8, 12
62 6,40 5,49 8,4 36,0 –158,6 –86,0 53,1 82,6 87,2 84,0 38,9 8, 14
63 6,41 4,36 184,7 35,6 56,7 –74,1 159,3 –85,8 23,5 26,2 –35,5 3, 5, 12, 17
64 6,41 4,13 21,8 34,5 –132,4 72,4 64,0 84,1 90,0 81,8 34,8 1, 8, 9, 14
65 6,43 6,59 147,0 40,0 –132,2 91,2 –70,6 –96,5 –69,2 38,8 –39,8 1, 12
66 6,47 7,25 184,1 33,7 –168,5 178,8 55,9 –85,4 –76,4 158,3 –39,7 2, 7, 8, 13
67 6,69 2,83 11,6 36,5 –164,2 –56,5 179,6 83,6 87,6 78,7 38,9 7, 14
68 6,70 4,04 145,0 38,9 –123,1 –52,5 173,8 –104,6 31,8 26,0 –33,5 1, 12
69 6,75 4,53 172,4 33,8 66,4 80,7 –73,4 –90,5 147,1 –99,6 –33,5 3, 6, 14
70 6,84 4,77 151,0 39,2 –129,6 –66,9 –64,5 142,8 144,9 –91,0 –36,3 1, 14
71 6,85 4,67 26,6 14,9 68,7 –58,1 –56,1 –137,0 63,5 –68,0 22,2 4, 6
72 7,07 6,17 152,9 39,2 –130,0 –174,6 –67,6 –96,3 144,9 –89,8 –37,0 1, 14
73 7,15 3,31 183,1 32,1 66,9 171,6 –69,9 –89,3 25,3 23,3 –32,4 3, 6, 12
74 7,20 6,11 10,4 35,5 –170,6 61,8 177,5 86,0 –160,3 –34,2 38,7 7, 12
75 7,24 7,19 173,6 35,3 –121,3 –88,1 52,2 –90,9 34,3 30,7 –37,7 1, 2, 8, 12
76 7,25 4,39 19,9 39,3 –167,0 43,7 –71,6 79,7 –165,2 –34,5 40,9 7, 12, 16
77 7,26 5,72 55,6 40,5 –171,9 176,6 –58,7 80,1 –52,0 179,4 29,3 7, 13, 15
78
79
80
7,28
7,37
7,39
6,51
2,86
7,26
14,9
18,9
17,6
36,5
38,8
37,7
–169,7
–164,5
–168,6
177,9
46,1
–175,6
–174,3
–70,1
–173,1
84,2
76,5
86,1
–161,9
83,6
–67,3
–32,8
84,9
–44,5
38,8
40,1
44,2
7, 12
7, 14, 16
7, 12
81 7,41 5,78 151,3 38,6 –125,2 –178,8 –68,3 –99,8 29,8 27,8 –35,7 1, 12
150
ÆÓÐÀʲÂÑÜÊÈÉ Ð. Î., ÃÎÂÎÐÓÍ Ä. Ì.
Çàê³í÷åí íÿ òàáë. 1
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13
82 7,55 5,00 174,8 32,6 67,2 60,7 –179,5 –90,3 146,2 –99,9 –33,0 3, 5, 14
83 7,59 5,07 186,5 34,2 178,2 75,2 53,7 –84,5 –78,3 170,6 –40,0 2, 7, 13
84 7,73 8,25 145,6 40,4 –135,7 –174,1 –176,7 –97,1 –74,9 39,7 –40,2 1, 12
85 7,79 5,17 14,6 36,9 –164,2 –84,1 56,2 83,6 –81,8 –174,8 42,7 7, 8
86 7,80 4,27 339,8 35,4 –177,0 174,1 176,3 93,7 89,0 75,8 39,1 3, 7, 10, 14
87 7,92 4,55 52,7 41,0 –171,3 –75,7 –58,2 77,7 –57,5 180,0 31,7 7, 13, 15
88 7,99 5,40 151,8 38,6 –124,6 –71,7 –64,3 140,6 35,5 26,3 –35,8 1, 12
89 8,01 5,45 180,7 35,8 –173,7 178,8 –69,2 –84,3 –74,9 159,5 –42,7 7, 13
90 8,02 3,76 177,7 40,1 55,9 –69,1 158,8 –80,8 –63,2 –149,3 –42,7 3, 5, 17
91 8,15 5,29 183,6 32,1 67,0 –71,7 –65,3 –89,6 30,8 21,7 –32,3 3, 6, 12
92 8,16 3,13 61,0 41,2 –172,7 –54,3 179,9 83,2 –89,2 177,4 24,8 7, 13
93 8,18 3,58 184,3 31,7 67,5 98,0 –71,4 –89,6 23,1 24,2 –31,9 3, 6, 12
94 8,31 5,95 202,4 36,9 –173,3 –180,0 174,0 –78,0 –69,6 166,5 –40,3 7, 8, 13
95 8,35 3,80 174,6 37,3 –165,2 –43,6 176,5 –85,2 –71,7 145,6 –44,0 7, 13
96 8,36 4,72 144,6 39,7 –127,4 74,5 –74,4 –104,3 27,6 28,5 –34,2 1, 12
97 8,44 3,23 42,8 35,5 71,8 –176,5 –171,6 –158,1 99,7 67,4 29,7 4, 14
98 8,48 5,12 329,4 35,2 –177,6 57,0 165,4 99,4 92,3 75,8 36,6 3, 7, 8, 10, 14
99 8,50 7,17 143,4 39,9 –134,7 –179,9 –178,5 –102,8 143,2 –92,7 –34,0 1, 14
100 8,62 5,58 181,7 35,9 –174,0 –74,4 –67,3 –84,1 –82,2 160,3 –42,6 7, 13
101 8,74 6,49 177,5 35,5 –164,6 –82,9 58,6 –85,6 –70,3 148,7 –42,1 2, 7, 8, 13
102 8,89 6,32 199,2 36,3 –170,6 55,2 166,0 –79,2 –75,8 163,6 –40,5 7, 8, 13
103 8,99 4,96 32,9 34,0 81,4 –169,1 54,8 –156,7 97,4 66,3 32,4 3, 4, 14
104 9,04 3,58 174,1 37,8 64,8 –75,0 –67,1 –84,5 –74,9 –150,5 –40,7 3, 6
105 9,40 4,05 181,3 36,9 –173,3 83,6 –72,1 –83,2 –66,5 157,8 –43,4 7, 13
106 9,56 2,90 174,7 37,8 65,3 98,3 –69,3 –84,4 –64,0 –154,9 –40,7 3, 6
107 9,98 4,52 0,4 34,8 –169,0 177,0 –72,3 88,9 87,8 75,6 39,6 7, 11, 14
108 10,01 7,95 152,6 38,1 72,4 –78,7 50,9 –94,1 –78,3 31,9 –38,3 3, 12
109 10,31 5,70 189,8 31,7 70,4 65,1 179,9 –88,6 31,4 22,3 –32,0 3, 5, 12
110 11,53 4,88 176,9 37,9 66,8 61,0 –178,6 –83,1 –69,4 –153,8 –41,3 3, 5
111 11,64 6,52 151,5 36,0 71,3 –83,1 49,1 –102,0 29,4 23,1 –31,5 3, 12
Ï ð è ì ³ ò ê à. Ïîç íà ÷åí íÿ êóò³â b g d e c n, , , , , , maxP º ñòàí äà ðòíèìè [1]. Òîðñ³éíèé êóò h = C3'C2'O2'H îïè ñóº îð³ºíòàö³þ ã³äðîê ñè ëó â
ïî ëî æåíí³ 2', à êóò q = O3'C3'C2'O2' – âçàºìíó îð³ºíòàö³þ çâ’ÿçê³â C3'O3' òà C2'O2'. Âå ëè ÷è íè êóò³â íà âå äå íî â ãðà äó ñàõ; G –
â³äíîñ íà â³ëüíà åíåðã³ÿ óááñà çà íîð ìàëü íèõ óìîâ, êêàë/ìîëü; D – äè ïîëü íèé ìî ìåíò, äå áà¿. Ñòðóê òóðí³ õà ðàê òå ðèñ òè êè îò ðè ìà íî
íà ð³âí³ òåî𳿠DFT B3LYP/6-31G(d, p), åíåð ãå òè÷í³ – MP2/6-311++G(d, p)//DFT B3LYP/6-31G(d, p). Êîí ôîð ìàö³¿ ïðî íó ìå ðî âà íî ó
ïî ðÿä êó çðîñ òàí íÿ ¿õíüî¿ â³ëüíî¿ åíåð㳿 G. Íó ìå ðàö³þ òà ïà ðà ìåò ðè âíóòð³øíüî ìî ëå êó ëÿð íèõ H-çâ’ÿçê³â íà âå äå íî ó òàáë. 2, 3.
Ïî-ïåð øå, ìຠì³ñöå äî âîë³ ñèëü íà êî ðå ëÿö³ÿ
(çà îäíèì âè íÿò êîì, äèâ. íè æ÷å) ì³æ òîðñ³éíèì êó -
òîì d ³ òîðñ³éíè ìè êó òà ìè n3 (–1,00), n2 (0,98),
n4 (–0,90), n1 (0,88) ³ n0 (–0,28) (òóò ³ äàë³ ó äóæ êàõ íà -
âå äå íî êî åô³ö³ºíòè ë³í³éíî¿ êî ðå ëÿö³¿, îá ÷èñ ëåí³ ³ç
óðà õó âàí íÿì êðó ãî âî¿ êî ðåêö³¿ [15]). Îêð³ì òî ãî,
ñïîñ òåð³ãàºòüñÿ äî âîë³ ñèëü íà êî ðå ëÿö³ÿ ì³æ
òîðñ³éíè ìè êó òà ìè n1 òà n2 (0,96), n3 (–0,88),
n0 (–0,70), n4 (–0,59), ì³æ n2 òà n3 (–0,98), n4 (–0,79),
n0 (–0,48) ³ ì³æ n3 òà n4 (0,90). Íàé ñëàá øå ñï³ââ³äíî -
ñÿòü ñÿ ì³æ ñî áîþ êó òè n0 òà n3 (0,28), n4 (–0,17).
Ïî-äðó ãå, âñòà íîâ ëå íî, ùî òîðñ³éí³ êó òè b, g, e ³
c ïîð³âíÿ íî ñëàá êî êî ðå ëþ þòü ÿê ì³æ ñî áîþ, òàê ³
ç òîðñ³éíè ìè êó òà ìè n0 ̧n4 (çíà ÷åí íÿ â³äïîâ³äíèõ
êî åô³ö³ºíò³â ë³í³éíî¿ êî ðå ëÿö³¿ íå ïå ðå âè ùóº çà ìî -
äó ëåì 0,28).
Öå äî âîë³ âàæ ëè âèé âèñ íî âîê ç òî÷ êè çî ðó ïðè -
ðî äè êîí ôîð ìåð³â Urd, òèì á³ëüøå, ùî òàê³ æ çà êî -
íîì³ðíîñò³ ñïîñ òåð³ãà þòü ñÿ ³ äëÿ 2'-äåç îêñè ðè áî -
íóê ëå î çèä³â [4–8]. Â³í ³ñòîò íî â³äð³çíÿºòüñÿ â³ä ðå -
çóëü òàò³â, îò ðè ìà íèõ òèì ñà ìèì ìå òî äîì äëÿ
íóê ëå î çèä³â ó êðèñ òàë³÷íî ìó ñòàí³ [1, 16], ÿê³
ñâ³ä÷àòü ïðî ñèëü íó êî ðå ëÿö³þ (êî åô³ö³ºíòè
ë³í³éíî¿ êî ðå ëÿö³¿ ëå æàòü ó ìåæ àõ 0,77–0,89) ì³æ
òîðñ³éíè ìè êó òà ìè c òà b, e, n0 ³ ì³æ êó òà ìè e òà d.
Âî ÷å âèäü, öåé åôåêò çó ìîâ ëå íèé 䳺þ ñèë êðèñ -
òàë³÷íî ãî ïà êó âàí íÿ.
Êîí ôîð ìàö³éíèé àíàë³ç ñâ³ä÷èòü ïðî òå, ùî
äîâ æè íà ãë³êî çèä íî ãî çâ’ÿç êó Urd ÿê êîí ôîð -
ìàö³éíèé ïà ðà ìåòð ò³ñí³øå êî ðå ëþº ç äîâ æè íà ìè
õ³ì³÷íèõ çâ’ÿçê³â îñíî âè, à ñà ìå – C4C5 (–0,83),
C5C6 (0,81), N1C2 (–0,78), C2O2 (0,69),
N3C4 (0,68), C6H (–0,58), C5H (0,50), à íå öóê ðî âî -
ãî çà ëèø êó, äå íà é ïîì³òí³øà êî ðå ëÿö³ÿ ñÿ ãຠìàê -
ñè ìàëü íî ãî çíà ÷åí íÿ ç äîâ æè íîþ çâ’ÿç êó C1'O4' ³
ñòà íî âèòü –0,70 (ç ³íøè ìè çâ’ÿç êà ìè êî åô³ö³ºíò êî -
ðå ëÿö³¿ çà ìî äó ëåì ìåí øèé 0,50).
Äëÿ êî ðå ëÿö³éíî ãî çâ’ÿç êó ì³æ äîâ æè íîþ
ãë³êî çèä íî ãî çâ’ÿç êó C1'N1 òà âå ëè ÷è íà ìè âà ëåí -
òíèõ êóò³â îñíî âè ³ öóê ðî âî ãî çà ëèø êó ñè òó àö³ÿ òà -
êà æ: ìàê ñè ìàëüí³ ð³âí³ ë³í³éíî¿ êî ðå ëÿö³¿ ç âà ëåí -
òíè ìè êó òà ìè îñíî âè ñêëà äà þòü ç êó òà ìè
C4N3H (0,92), C6C5H (–0,88), C5C4O4 (0,80),
N1C2N3 (0,80), C4C5C6 (0,77), C2N3C4 (–0,72) (íà -
âå äå íî êî åô³ö³ºíòè êî ðå ëÿö³¿, ÿê³ ïå ðå âè ùó þòü
0,70), ó òîé ÷àñ ÿê ìàê ñè ìàëü íà êî ðå ëÿö³ÿ ç êó òà ìè
öóê ðî âî ãî çà ëèø êó ñòà íî âèòü C3'C2'O2' (–0,60).
Íàé ñèëüí³øå äîâ æè íà ãë³êî çèä íî ãî çâ’ÿç êó êî ðå -
ëþº ç òîðñ³éíè ìè êó òà ìè öóê ðî âî ãî çà ëèø êó –
C4'O4'C1'H (0,70), íî ìåí êëà òóð íèì n0 (–0,68) òà
HC2'O2'H (–0,62). Ïðî òå íà é âè ùèé ð³âåíü êî ðå -
ëÿö³¿ ìຠì³ñöå ç òîðñ³éíèì êó òîì C4'O4'C1'N1
(0,73), ³íø³ êî åô³ö³ºíòè êî ðå ëÿö³º, á³ëüø³ çà 0,60,
öå – C1'N1C6H òà C1'N1C2N3 (0,65). Íà ïðî òè âà ãó
ïî øè ðåí³é òî÷ö³ çî ðó ïðî íà ÿâí³ñòü ñòðóê òóð íî¿
êî ðå ëÿö³¿ ì³æ äîâ æè íîþ ãë³êî çèä íî ãî çâ’ÿç êó òà
òîðñ³éíèì êó òîì c ó ï³ðèì³äè íî âèõ íóê ëå î çè äàõ
[1] (çàô³êñî âà íó, äî ðå÷³, â êðèñ òàë³÷íî ìó ñòàí³) ìè
òà êî¿ êî ðå ëÿö³¿ â êîí ôîð ìå ðàõ ³çîëü î âà íî ãî Urd íå
çàô³êñó âà ëè – ïðè íàéìí³ ¿¿ âå ëè ÷è íà íå ïå ðå âè ùóº
–0,35.
Ö³êàâ³ êî ðå ëÿö³éí³ çà êî íîì³ðíîñò³ âèç íà ÷å íî
äëÿ òîðñ³éíî ãî êó òà c: âè ÿ âè ëî ñÿ, ùî â³í äî âîë³
ñèëü íî êî ðå ëþº íå ç îäíèì–äâî ìà, ÿê öå ââà æà ëî ñÿ
ðàí³øå [1], à ç ö³ëîþ íèç êîþ ñòðóê òóð íèõ ïà ðà -
ìåòð³â – äîâ æèí çâ’ÿçê³â, âå ëè ÷èí âà ëåí òíèõ òà
òîðñ³éíèõ êóò³â. Òàê, êóò c êî ðå ëþº ç äîâ æè íà ìè
òà êèõ âà ëåí òíèõ çâ’ÿçê³â, ÿê N1C6 (0,78), C5H
(–0,71), C5C6 (–0,70), âà ëåí òíèõ êóò³â C4C5H
(0,87), C1'N1C2 (0,86), N1C6C5 (0,84), C2N1C6
(–0,83), C1'N1C6 (–0,83), C5C6H (–0,82), C2'C1'N1
(0,79), C2'C1'H (–0,76) , N1C1'H (–0,72) òà C4C5C6
(–0,70) ³ 11 òîðñ³éíèõ êóò³â, çíà ÷åí íÿ êî åô³ö³ºíò³â
ë³í³éíî¿ êî ðå ëÿö³¿ äëÿ ÿêèõ ³ç âðà õó âàí íÿì êðó ãî âî¿
êîðåêö³¿ ïåðåâèùóþòü çà ìîäóëåì çíà÷åííÿ 0,70.
Ïðè âåð òຠäî ñå áå óâà ãó òîé ôàêò, ùî âçàºìíà
îð³ºíòàö³ÿ ã³äðîê ñèë³â ó ïî ëî æåí íÿõ 2' òà 3' ïðàê -
òè÷ íî íå çà ëåæ íà – êî åô³ö³ºíò êî ðå ëÿö³¿ ð³âíèé
0,10.
Ùî äî ïî ëÿð íèõ âëàñ òè âîñ òåé Urd, òî äè ïîëü -
íèé ìî ìåíò öüî ãî íóê ëå î çè äó ñèëü íî çì³íþºòüñÿ
â³ä êîí ôîð ìå ðà äî êîí ôîð ìå ðà ³ ëå æèòü ó ìåæàõ
0,39¸9,20 D.
Êîí ôîð ìàö³éí³ ð³âíî âà ãè. Ñïè ðà þ ÷èñü íà åíåð -
ãå òè÷í³ õà ðàê òå ðèñ òè êè óñ³õ áåç âè íÿò êó êîí ôîð -
ìåð³â Urd, ìè ÷è ñåëü íî îõà ðàê òå ðè çó âà ëè éî ãî
êîíôîðìàö³éí³ ð³âíîâàãè.
Âè ÿ âè ëî ñÿ, ùî ð³âíî âà ãà syn:anti çà òåì ïå ðà òó -
ðè T = 298,15 K ñèëü íî çñó íó òà ïðà âî ðó÷
(syn:anti = 10,6:89,4 %), à ð³âíî âà ãà S:N – ó á³ê
S-êîí ôîð ìåð³â (S:N = 85,5:14,5 %). Ïðè öüî ìó
ñï³ââ³äíî øåí íÿ ì³æ «êëà ñè÷ íè ìè» òà «íå êëà ñè÷ -
151
ÊÎÍÔÎÐÌÀÖ²ÉͲ ÌÎÆËÈÂÎÑÒ² ÓÐÈÄÈÍÓ: ÊÂÀÍÒÎÂÎ-ÌÅÕÀͲ×ÍÅ ÄÎÑË²ÄÆÅÍÍß
íè ìè» êîí ôîð ìå ðà ìè ôó ðà íîç íî ãî ê³ëüöÿ öóê ðî -
âî ãî çà ëèø êó òà êå: äëÿ S-ï³äðî äè íè – C3'exo
(63,0 %), C2'endo (22,4 %) ³ C1'exo (0,1 %); äëÿ
N-ï³äðî äè íè – C3'endo (8,9 %), C4'exo (4,0 %),
O4'endo (1,6 %) ³ C2'exo (2×10–6 %). Êîí ôîð ìàö³¿
C2'endo º anti-ëþá íè ìè (15,5 ïðî òè 6,9 %), êîí ôîð -
ìàö³ÿ C1'exo ìຠanti-îð³ºíòàö³þ, à C3'exo ìàé æå
âè íÿò êî âî àíò³-îð³ºíòàö³þ – çà ñå ëåí³ñòü syn-êîí -
ôîð ìåð³â ïî ðÿä êó 2×10–3 %; êîí ôîð ìàö³¿ C3'endo
ìàé æå âè íÿò êî âî anti- – çà ñå ëåí³ñòü syn-êîí ôîð -
ìåð³â 0,4 %, äëÿ êîí ôîð ìàö³¿ C4'exo
syn:anti = 3,3:0,7 %. Êîíôîðìåðè O4'endo – âè íÿò -
êî âî anti-êîíôîðìåðè.
Ùî æ ñòî ñóºòüñÿ ³íøèõ íî ìåí êëà òóð íèõ êîí -
ôîð ìàö³éíèõ õà ðàê òå ðèñ òèê, òî íàì âäà ëî ñÿ
çàô³êñó âà òè òàê³ çà êî íîì³ðíîñò³ (ó äóæ êàõ íà âå äå -
íî çàñåëåíîñò³).
Êîí ôîð ìå ðè ç gÎg+ (91,4 %) äîì³íó þòü íàä êîí -
ôîð ìå ðà ìè ç gÎt (4,6 %) òà êîí ôîð ìå ðà ìè ç gÎg–
(4,0 %); ïðè öüî ìó ïà ðà ìåòð g º anti-ëþá íèì äëÿ
gÎg+ (83,5 ïðî òè 7,9 %) ³ äëÿ gÎt (4,0 ïðî òè 0,6 %), ó
ðàç³ gÎg– ðîç ïîä³ë çà öèì ïà ðà ìåò ðîì ìàé æå îäíà -
êî âèé – 1,9 ïðî òè 2,1 %. Êîí ôîð ìå ðè ç gÎg+
àñîö³þþòü ñÿ ïå ðå âàæ íî (60,7 %) ç êîí ôîð ìàö³ºþ
ôó ðà íîç íî ãî ê³ëüöÿ öóê ðî âî ãî çà ëèø êó C3'exo.
Êîí ôîð ìå ðè ç bÎt (70,9 %) äîì³íó þòü íàä êîí ôîð -
ìå ðà ìè ç bÎg+ (21,6 %) ³ êîí ôîð ìå ðà ìè ç bÎg– (7,5
%); ïðè öüî ìó âñ³ êîí ôîð ìå ðè º anti-ëþáí èìè: bÎg+
(13,7 ïðî òè 7,9 %), bÎt (69,1 ïðî òè 1,9 %), bÎg– (6,7
ïðî òè 0,8 %). Êîí ôîð ìå ðè ç bÎt ó ïå ðå âàæí³é ñâî¿é
152
ÆÓÐÀʲÂÑÜÊÈÉ Ð. Î., ÃÎÂÎÐÓÍ Ä. Ì.
Òàá ëè öÿ 2
Îñíîâí³ ãå î ìåò ðè÷í³ òà åëåê òðîí íî-òî ïî ëîã³÷í³ õà ðàê òå ðèñ òè êè âíóòð³øíüî ìî ëå êó ëÿð íèõ âîä íå âèõ çâ’ÿçê³â ÀÍ...Â, ÿê³
ñòàá³ë³çó þòü êîí ôîð ìå ðè óðè äè íó
Òèï Í-çâ’ÿçîê
AH…B
AB, A HB, A AHB, ãðàä r, à. î. Ñ 2r, à. î.
min max min max min max min max min max
1 C1'H…O2 2,754 2,786 2,203 2,260 106,6 109,7 0,019 0,020 0,076 0,080
2 C2'H2…O5' 3,062 3,210 2,442 2,687 108,2 116,9 0,008 0,012 0,030 0,041
3 C2'H2…O2 2,813 3,153 2,183 2,555 99,0 124,0 0,010 0,019 0,037 0,064
4 C3'H…O2 2,964 3,094 2,344 2,574 104,1 117,3 0,010 0,014 0,039 0,051
5 C5'H1…O2 3,018 3,399 2,292 2,692 103,4 143,2 0,008 0,014 0,030 0,044
6 C5'H2…O2 3,211 3,452 2,359 2,649 128,0 134,0 0,007 0,012 0,025 0,040
7 C6H…O4' 2,650 2,760 2,159 2,348 100,4 104,8 0,016 0,022 0,071 0,086
8 C6H…O5' 3,245 3,777 2,214 2,844 113,9 165,9 0,005 0,016 0,022 0,046
9 C3'H…HC6 2,903 2,959 2,293 2,332 111,1 114,2 0,006 0,007 0,022 0,025
10 C5'H1…HC6 2,712 2,833 2,351 2,375 95,7 104,4 0,007 0,007 0,026 0,030
11 C5'H2…HC6 2,942 2,942 2,378 2,378 109,9 109,9 0,005 0,005 0,021 0,021
12 O2'H…O3 2,620 2,751 1,953 2,169 111,9 123,6 0,019 0,030 0,074 0,095
13 O2'H…O2 2,706 3,097 1,808 2,374 130,8 154,6 0,011 0,035 0,041 0,107
14 O3'H…O2' 2,593 2,742 1,957 2,172 116,0 120,8 0,020 0,026 0,072 0,097
15 O3'H…O5' 2,883 2,992 2,120 2,255 132,0 135,2 0,016 0,019 0,047 0,057
16 O5'H…O3' 3,044 3,067 2,240 2,286 135,8 139,5 0,014 0,015 0,044 0,047
17 O5'H…O2 2,803 3,118 1,846 2,331 137,8 166,7 0,011 0,029 0,039 0,095
á³ëüøîñò³ (62,0 %) àñîö³þþòü ñÿ ç êîí ôîð ìàö³ºþ
ôó ðà íîç íî ãî ê³ëüöÿ öóê ðî âî ãî çà ëèø êó C3'exo, íà -
òîì³ñòü êîí ôîð ìå ðè ç bÎg+ òà bÎg– ïå ðå âà æà þòü ó
C2'endo êîí ôîð ìàö³¿ öóê ðó – 17,3 òà 4,2 %
â³äïîâ³äíî. Êîí ôîð ìå ðè ç eÎt (85,0 %) äîì³íó þòü
íàä êîí ôîð ìå ðà ìè ç eÎg+ (10,7 %) òà ç eÎg– (4,3 %);
ïðè öüî ìó êîí ôîð ìå ðè eÎt òà ç eÎg+ º anti-ëþá íè ìè:
78,7 ïðî òè 6,3 % òà 10,4 ïðî òè 0,3 % â³äïîâ³äíî,
êîí ôîð ìå ðè ç eÎg– º syn-ëþ áè âè ìè – 3,9 ïðî òè
0,3 %. Êîí ôîð ìå ðè ç eÎt ïðåä ñòàâ ëåí³ â îñíîâ íî ìó
êîí ôîð ìàö³ÿìè öóê ðó C3'exo òà C2'endo – 63,0 òà
20,4 % â³äïîâ³äíî, êîí ôîð ìå ðè ç eÎg+ ïå ðå âàæ íî
àñîö³þþòü ñÿ ç êîí ôîð ìàö³ºþ ôó ðà íîç íî ãî ê³ëüöÿ
öóê ðî âî ãî çà ëèø êó C3'endo (8,2 %), à êîí ôîð ìå ðè ç
eÎg– – öå ïå ðå âàæ íî êîí ôîð ìå ðè C4'exo (2,1 %) òà
C2'endo (2,0 %).
Îêð³ì òî ãî, çàô³êñî âà íî ñóòòºâó çà ëåæí³ñòü
êîí ôîð ìàö³éíèõ ð³âíî âàã â³ä òåì ïå ðà òó ðè (ðèñ. 4):
çà òåì ïå ðà òó ðè 420 Ê (¿¿ âè êî ðèñ òî âó þòü â åê ñïå ðè -
ìåí òàõ ç ìàò ðè÷ íî¿ ³çî ëÿö³¿ [17]) syn:anti =
= 16,6:83,4 %, à S:N = 68,6:31,4 %.
Âíóòð³øíüî ìî ëå êó ëÿðí³ âîä íåâ³ çâ’ÿç êè. Îòðè -
ìàí³ ðå çóëü òà òè ùî äî âíóòð³øíüî ìî ëå êó ëÿð íèõ
âîä íå âèõ çâ’ÿçê³â ó êîí ôîð ìå ðàõ Urd ïðåä ñòàâ ëåíî
ó òàáë. 1–3.  111 êîí ôîð ìå ðàõ Urd íà ìè çàô³êñî -
âà íî 17 òèï³â âíóòð³øíüî ìî ëå êó ëÿð íèõ Í-çâ’ÿçê³â
(¿õíÿ çà ãàëü íà ê³ëüê³ñòü – 313), à ñà ìå – C1'H...O2
(26 çâ’ÿçê³â), C2'H2...O5' (15), C2'H2...O2 (25),
153
ÊÎÍÔÎÐÌÀÖ²ÉͲ ÌÎÆËÈÂÎÑÒ² ÓÐÈÄÈÍÓ: ÊÂÀÍÒÎÂÎ-ÌÅÕÀͲ×ÍÅ ÄÎÑË²ÄÆÅÍÍß
Òàá ëè öÿ 3
Êîí ôîð ìàö³éí³ õà ðàê òå ðèñ òè êè âíóòð³øíüî ìî ëå êó ëÿð íèõ âîä íå âèõ çâ’ÿçê³â AH…B, ÿê³ îõîï ëþ þòü óñ³ ìîæ ëèâ³ êîí ôîð ìå ðè
óðè äè íó
Òèï Í-çâ’ÿçîê
AH…B
Çàãàëüíà
ê³ëüê³ñòü
syn anti N S
b g e
g
+ t g– g+ t g– g+ t g–
1 C1'H…O2 26 0 26 4 22 7 9 10 11 5 10 8 9 9
2 C2'H2…O5' 15 3 12 0 15 5 5 5 15 0 0 3 6 6
3 C2'H2…O2 25 23 2 5 20 11 6 8 7 8 10 11 7 7
4 C3'H…O2 14 14 0 14 0 5 5 4 3 6 5 6 6 2
5 C5'H1…O2 6 6 0 0 6 3 0 3 0 6 0 2 2 2
6 C5'H2…O2 10 10 0 1 9 3 3 4 0 0 10 4 3 3
7 C6H…O4' 48 0 48 30 18 15 16 17 17 18 13 14 15 19
8 C6H…O5' 28 0 28 14 14 8 11 9 23 5 0 9 9 10
9 C3'H…HC6 4 0 4 4 0 2 1 1 2 0 2 1 1 2
10 C5'H1…HC6 2 0 2 2 0 1 1 0 0 2 0 2 0 0
11 C5'H2…HC6 1 0 1 1 0 0 1 0 0 0 1 1 0 0
12 O2'H…O3' 46 18 28 21 25 14 15 17 16 13 17 14 14 18
13 O2'H…O2 27 0 27 9 18 9 8 10 8 10 9 6 9 12
14 O3'H…O2' 41 8 33 19 22 14 14 13 16 14 11 19 22 0
15 O3'H…O5' 7 2 5 7 0 0 4 3 0 0 7 0 0 7
16 O5'H…O3' 5 2 3 5 0 5 0 0 0 0 5 3 2 0
17 O5'H…O2 8 8 0 2 6 5 0 3 5 3 0 3 3 2
C3'H...O2 (14), C5'H1...O2 (6), C5'H2...O2 (10),
C6H...O4' (48), C6H...O5' (28), C3'H2…HC6 (4),
C5'H1…HC6 (2), C5'H2…HC6 (1), O2'H...O3' (46),
O2'H...O2 (27), O3'H...O2' (41), O3'H...O5' (7),
O5'H...O3' (5) òà O5'H...O2 (8) (òàáë. 1–3). Âî íè ðîç -
ïîä³ëÿ þòü ñÿ íà äâ³ ð³çíî âå ëèê³ ãðó ïè – H-çâ’ÿç êè,
ëî êàë³çî âàí³ ó öóê ðî âî ìó çà ëèø êó (òè ïè 2, 12,
14–16; ¿õíÿ çà ãàëü íà ê³ëüê³ñòü – 114), òà çâ’ÿç êè ì³æ
íóê ëå î òèä íîþ îñíî âîþ ³ öóê ðî âèì çà ëèø êîì (¿õ
âñüî ãî 199; öå òè ïè 1, 3–11, 13, 17) (÷èñ ëîâ³ ïî çíà -
÷åí íÿ òèï³â H-çâ’ÿçê³â äèâ. ó òàáë. 2). Ïðè ðîä íî,
ùî H-çâ’ÿç êè ì³æ îñíî âîþ òà öóê ðî âèì çà ëèø êîì
äó æå «÷óò ëèâ³» äî ¿õíüî¿ âçàºìíî¿ îð³ºíòàö³¿. Òàê,
çâ’ÿç êè òè ïó 1, 7–11, 13 ðå àë³çó þòü ñÿ ëè øå â
anti-êîí ôîð ìå ðàõ, à çâ’ÿç êè òè ïó 4–6 ³ 17 – â
syn-êîí ôîð ìå ðàõ Urd. Âíóòð³øíüî öóê ðîâ³ H-çâ’ÿç -
êè ìåíø «÷óò ëèâ³» äî âçàºìíî¿ îð³ºíòàö³¿ çà ëèø êó ³
îñíî âè, ïðî òå âñ³ âíóòð³øíüî öóê ðîâ³ çâ’ÿç êè º
anti-ëþ áíè ìè.  òîé æå ÷àñ âî íè äó æå «÷óò ëèâ³» äî
êîí ôîð ìàö³¿ öóê ðî âî ãî çà ëèø êó: 2-é òèï Í-çâ’ÿçê³â
ðå àë³çóºòüñÿ ëè øå â S-êîí ôîð ìàö³ÿõ, à òè ïè 15 ³
16 – ëè øå â N-êîí ôîð ìàö³ÿõ öóê ðî âî ãî çà ëèø êó.
Ç-ïîì³æ H-çâ’ÿçê³â ì³æ öóê ðî âèì çà ëèø êîì òà
îñíî âîþ «íà é ÷óò ëèâ³øè ìè» äî êîí ôîð ìàö³¿ çà -
ëèø êó º òèï 6, ùî ðå àë³çóºòüñÿ ëè øå â S-êîí ôîð -
ìàö³ÿõ, òà òè ïè 4, 9–11, ÿê³ ðå àë³çó þòü ñÿ ëè øå â
N-êîí ôîð ìàö³ÿõ öóê ðî âî ãî çà ëèø êó. Ðåø òà ¿õ – àáî
S-ëþáí³ (òèïè 1, 3, 6, 13 ³ 17), àáî N-ëþáí³ (òèï 7),
çâ’ÿçêè òèïó 8 ðîçïîä³ëåí³ ïîð³âíó.
Äëÿ äå ÿ êèõ òèï³â H-çâ’ÿçê³â ³ñíóº òà êîæ ñóòòºâà
çà ëåæí³ñòü ³ â³ä ³íøèõ êîí ôîð ìàö³éíèõ ïà ðà ìåòð³â
(òàáë. 1, 3). Òàê, H-çâ’ÿç êè òè ïó 2 ðå àë³çó þòü ñÿ ëè -
øå ïðè gÎg+, çâ’ÿç êè òèï³â 6, 11, 15 òà 16 – ëè øå ïðè
gÎg–, à Í-çâ’ÿç êè òèï³â 5 ³ 10 – ëè øå ïðè gÎt.
Ïðè öüî ìó êîí ôîð ìàö³éíî «íà é âè áàã ëèâ³øè -
ìè» º âíóòð³øíüî öóê ðîâ³ H-çâ’ÿç êè òè ïó 15 ( bÎt, g–;
gÎg–; g–) ³ 16 (bÎg+; gÎg–; eÎg+, t) (ó äóæ êàõ âêà çà íî
êîí ôîð ìàö³éí³ îá ìå æåí íÿ ¿õíüî ãî ³ñíó âàí íÿ).
Ó êîí ôîð ìå ðàõ Urd âíóòð³øíüî ìî ëå êó ëÿðí³
H-çâ’ÿç êè ó á³ëüøîñò³ âè ïàäê³â ñï³â³ñíó þòü. Ó äâîõ
anti-êîí ôîð ìå ðàõ íà ìè çàô³êñî âà íî ï’ÿòü H-
çâ’ÿçê³â, 23 êîí ôîð ìå ðè (18 anti òà 5 syn) ìà þòü ÷î -
òè ðè çâ’ÿç êè, â 42 êîí ôîð ìå ðàõ (25 anti òà 17 syn)
çàô³êñî âà íî òðè çâ’ÿç êè, â 41 êîí ôîð ìåð³ (31 anti òà
10 syn) – äâà çâ’ÿç êè ³ â òðüîõ syn-êîí ôîð ìå ðàõ
çàô³êñî âà íî ëè øå îäèí çâ’ÿ çîê. Ïðè öüî ìó ìè íå
âè ÿ âè ëè æîä íî ãî êîí ôîð ìå ðà, ÿêèé áè íå áóâ îõîï -
ëå íèé õî ÷à á îäíèì H-çâ’ÿç êîì. Ñå ðåä H-çâ’ÿçê³â,
â³äïîâ³äàëü íèõ çà ï³äòðè ìàí íÿ anti-êîí ôîð ìàö³é
Urd, íà é ïî øè ðåí³øè ìè º C6H…O4', C6H…O5',
C1'H…O2 ³ O2'H…O2 (òàáë. 1–3).
Ç-ïîì³æ çàô³êñî âà íèõ íà ìè âíóòð³øíüî ìî ëå êó -
ëÿð íèõ H-çâ’ÿçê³â, ÿê³ ñòàá³ë³çó þòü óñ³ ìîæ ëèâ³
êîí ôîð ìå ðè Urd, – OH…O, CH…O ³ CH…HC –
íàéá³ëüøó óâà ãó ïðè âåð òຠäî ñå áå îñòàíí³é. Õà -
ðàê òåð íîþ éî ãî îçíà êîþ º òå, ùî äî íî ðîì ³ àê öåï -
òî ðîì H-çâ’ÿ çó âàí íÿ âèñòóïàþòü àòî ìè âîä íþ
äâîõ ð³çíèõ ãðóï CH. Ó ðè áî íóê ëå î çè äàõ ¿õ âè ÿâ -
ëåíî íà ìè âïåð øå. Ðàí³øå ìå òî äîì àíàë³çó òî ïî -
ëî㳿 åëåê òðîí íî¿ ãóñ òè íè âî íè çàô³êñî âàí³ ó äå ÿ -
êèõ àì³íî êèñ ëî òàõ [17], à â ë³òå ðà òóð³ çãà äó þòü ñÿ
âïåð øå ó ìî íîã ðàô³¿ [19]. Îïè ñà íî òà êîæ ïðè êëà äè
åê ñïå ðè ìåí òàëü íî ãî ñïîñ òå ðå æåí íÿ ïîä³áíèõ
Í-çâ’ÿçê³â (äèâ. [17, 19] ³ íà âå äå íó òàì
á³áë³îãðàô³þ). Íèí³ ¿õ ïðî äîâ æó þòü ³íòåíñèâíî
âèâ÷àòè, çäåá³ëüøîãî òå î ðå òè÷ íè ìè (êâàí òî âî-ìå -
õàí³÷íèìè) ìåòîäàìè [20].
Íà ãî ëî ñè ìî, ùî ìàé æå âñ³ âíóòð³øíüî ìî ëå êó -
ëÿðí³ H-çâ’ÿç êè (âè íÿò êè ñòî ñó þòü ñÿ ëè øå ÷î òèðü -
îõ çâ’ÿçê³â C6H…O5') çà äî âîëü íÿ þòü êëà ñè÷ íèì
ãå î ìåò ðè÷ íèì âè ìî ãàì (òàáë. 2) – äëÿ çâ’ÿçê³â
AH…B ñó ìà âàí-äåð-âà àëü ñî âèõ ðàä³óñ³â àòîì³â H ³
B ïî âèí íà ïå ðå âè ùó âà òè â³äñòàíü HB (äëÿ ñèñ òå ìè
ðàä³óñ³â [21] âè ùåç ãà äàí³ âå ëè ÷è íè ñêëà äà þòü 2,72
³ 2,40 &À äëÿ àòîì³â H ³ O òà H ³ H â³äïîâ³äíî). Ïðè
öüî ìó íà é ìåí øà âå ëè ÷è íà êóò³â H-çâ’ÿ çó âàí íÿ
AHB ñïîñ òåð³ãàºòüñÿ äëÿ çâ’ÿçê³â C5'H1...HC6 –
ì³í³ìàëüíå çàô³êñîâàíå çíà÷åííÿ ñêëàäຠ95,7°.
Ñòî ñîâ íî åëåê òðîí íî-òî ïî ëîã³÷íèõ õà ðàê òå -
ðèñ òèê âíóòð³øíüî ìî ëå êó ëÿð íèõ H-çâ’ÿçê³â, çîê -
ðå ìà, ïà ðà ìåòð³â r ³ Ñ2r, òî âî íè òåæ âêëà äà þòü ñÿ ó
íà âå äåí³ â ë³òå ðà òóð³ ìåæ³ [22–27]. Ö³êà âî, ùî ïå -
ðå âàæ íà á³ëüø³ñòü âíóòð³øíüî ìî ëå êó ëÿð íèõ
H-çâ’ÿçê³â, çàô³êñî âà íèõ íà ìè â Urd, ðå àë³çóºòüñÿ ³
â éî ãî 2'-äåç îêñè à íà ëî ãó [22], à ñà ìå: C1'H…O2,
C2'H…O5', C2'H…O2, C3'H…O2, C5'H1…O2,
C5'H2…O2, C6H…O4, C6H…O5', C3'H…HC6,
O3'H…O5' òà O5'H…O3' ç áëèçü êè ìè çíà ÷åí íÿ ìè
åëåê òðîí íî-òî ïî ëîã³÷íèõ õà ðàê òå ðèñ òèê. Ïðè âåð -
òຠäî ñå áå óâà ãó òîé ôàêò, ùî Í-çâ’ÿç êè çà ó÷àñò³
äî âîë³ êèñ ëî¿ ãðó ïè C6H [28] õà ðàê òå ðè çó þòü ñÿ âå -
ëè ÷è íà ìè r ³ Ñ2r òà êî ãî æ ïî ðÿä êó, ÿê ³ êëà ñè÷í³
154
ÆÓÐÀʲÂÑÜÊÈÉ Ð. Î., ÃÎÂÎÐÓÍ Ä. Ì.
Í-çâ’ÿç êè OH…O (òàáë. 2), ùî âêà çóº íà ¿õíþ
â³äíîñ íî âå ëè êó ì³öí³ñòü. Îòæå, º âñ³ ï³äñòà âè êëà -
ñèô³êó âà òè óñ³ âè ÿâ ëåí³ òà îõà ðàê òå ðè çî âàí³ íà ìè
âíóòð³øíüî ìî ëå êó ëÿðí³ çâ’ÿç êè ó êîí ôîð ìå ðàõ
Urd ÿê âîä íåâ³.
Äîñ òàò íüî âå ëè êà ê³ëüê³ñòü çàô³êñî âà íèõ
H-çâ’ÿçê³â äîç âî ëè ëà íàì çà ñòî ñó âà òè ñòà òèñ òè÷í³
ìå òî äè, à ñà ìå – ë³í³éíî-êî ðå ëÿö³éíèé àíàë³ç, àáè
âñòà íî âè òè äå ÿê³ çà êî íîì³ðíîñò³, ùî ñòî ñó þòü ñÿ
¿õíüî¿ ïðè ðî äè. Òàê, çîê ðå ìà, âè ÿâ ëå íî äî âîë³
ñèëü íó êî ðå ëÿö³þ ì³æ ïà ðà ìåò ðà ìè r ³ Ñ2r (0,94), à
òà êîæ ì³æ r ³ HB (–0,95) òà ì³æ Ñ2r ³ HB (–0,87). Íà -
âå äå ìî òà êîæ çíà÷åííÿ äëÿ êî åô³ö³ºíò³â ë³í³éíî¿
êî ðå ëÿö³¿, ÿê³ ñòàíîâëÿòü ì³æ r ³ AB –0,77 òà ì³æ Ñ2r
³ AB –0,89.
Êî ëè âàëü íèé ²× ñïåêòð Urd â îá ëàñò³ âà ëåí -
òíèõ NH ³ OH-êî ëè âàíü. Ó ðî áîò³ [17] îò ðè ìà íî
óí³êàëü íèé åê ñïå ðè ìåí òàëü íèé ðå çóëü òàò – êî ëè -
âàëü íèé ²× ñïåêòð Urd ó íèç ü êî òåì ïå ðà òóðí³é ìàò -
ðèö³ ³íå ðòíî ãî ãà çó çà òåì ïå ðà òó ðè âè ïà ðî âó âàí íÿ
ïîë³êðèñ òàë³÷íî ãî çðàç êà 420 Ê. Ïðè öüî ìó ó âè ñî -
êî ÷àñ òîòí³é îá ëàñò³, äå ëå æàòü ÷àñ òî òè âà ëåí òíèõ
NH- ³ OH-êî ëè âàíü ³ ÿêà º íà é ÷óò ëèâ³øîþ äî êîí -
ôîð ìàö³éíèõ çì³í, çàô³êñî âà íî ø³ñòü ñìóã. Çà êî -
íîì³ðíî ïî ñòຠïè òàí íÿ: ñê³ëüêè êîí ôîð ìåð³â Urd
ôîð ìó þòü ö³ ñìó ãè? Ìà þ ÷è ó ñâîºìó ðîç ïî ðÿä -
æåíí³ êî ëè âàëüí³ ñïåê òðè äëÿ âñ³õ çíàé äå íèõ 111
êîí ôîð ìåð³â, à òà êîæ çà ñå ëå íîñò³ îñòàíí³õ çà òåì -
ïå ðà òó ðè 420 Ê, ìè ï³äðà õó âà ëè, ùî ÿê ùî âçÿ òè çà
«âíóòð³øí³é ñòàí äàðò» ³íòåí ñèâí³ñòü ñìó ãè n(N3H)
(â åê ñïå ðè ìåíò³ âîíà ñïîñ òåð³ãàºòüñÿ íà ÷àñ òîò³
3427,2 ñì–1), òî 10 % òî÷ íîñò³ âèç íà ÷åí íÿ ³íòåí ñèâ -
íîñò³ çà áåç ïå ÷àòü 18 êîí ôîð ìåð³â, à 5 % – 27 êîí -
ôîð ìåð³â. Òà êèì ÷è íîì, ïðè T = 420 K â ²× ñïåêòð³
Urd, ³çîëü î âà íî ãî ó íèç ü êî òåì ïå ðà òóðí³é ³íå ðòí³é
ìàò ðèö³, ïðî ÿâ ëÿºòüñÿ ùî íàé ìåí øå ê³ëüêà íàä öÿòü
åíåð ãå òè÷ íî íà é âèã³äí³øèõ êîí ôîð ìåð³â. Öåé âèñ -
íî âîê ïðî³ëþñ òðî âà íî íà ðèñ. 5.
Íà ðèñ. 6 ïîä à íî äå êîí âî ëþö³þ ðîç ðà õî âà íî ãî
êî ëè âàëü íî ãî ²× ñïåê òðà Urd íà ñêëà äîâ³ ñìó ãè âà -
ëåí òíèõ êî ëè âàíü n(N3H), n(O2'H), n(O3'H) ³
n(O5'H), ÿêà äîç âî ëÿº îä íî çíà÷ íî âèò ëó ìà ÷è òè
åêñïå ðè ìåí òàëü íèé ñïåêòð. Òà êèì ÷è íîì, åê ñïå ðè -
ìåí òàëü íèé äóá ëåò ñìóã 3446,4¸3456,3 ñì–1 â³äíå -
ñå íî äî êî ëè âàíü n(O2'H) anti-êîí ôîð ìåð³â ç
âíóòð³øíüî ìî ëå êó ëÿð íèì H-çâ’ÿç êîì O2'H…O2, à
äóá ëåò ñìóã 3484,3¸3491,7 ñì–1 – äî êî ëè âàíü
n(O5'H) syn-êîí ôîð ìåð³â ³ç H-çâ’ÿç êîì O5'H…O2.
Êâàð òåò íà ñìó ãà 3558,2¸3568,0¸3575,5¸3587,8 ñì–1
ôîð ìóºòüñÿ, â îñíîâ íî ìó, êîí ôîð ìå ðà ìè ç âíóò-
ð³øíüîìî ëå êó ëÿð íè ìè H-çâ’ÿç êà ìè O3'H…O2' ³
O3'H…O5'. Äóá ëåò íà ñìó ãà 3641,4¸3664,9ñì–1
â³äïîâ³äຠâ³ëüíèì â³ä H-çâ’ÿ çó âàí íÿ âà ëåí òíèì
êî ëè âàí íÿì n(O2'H) ³ n(O5'H) â³äïîâ³äíî, âíå ñîê
êî ëè âàíü n(O3'H) â îñòàí íþ ñìó ãó º íå çíà÷ íèì.
Âèñ íîâ êè. Âïåð øå ïðî âå äå íî âè ÷åð ïíèé êîí -
ôîð ìàö³éíèé àíàë³ç êà íîí³÷íî ãî ðè áî íóê ëå î çè äó
óðè äè íó êâàí òî âî-ìå õàí³÷íèì ìå òî äîì
ôóíêö³îíà ëó ãóñ òè íè íà ð³âí³ òå î𳿠MP2/6-
311++G(d, p)//DFT B3LYP/6-31G(d, p). Ïðåä ñòàâ ëå -
íî îñíîâí³ ãå î ìåò ðè÷í³, åíåð ãå òè÷í³ òà ïî ëÿðí³ õà -
ðàê òå ðèñ òè êè óñ³õ éî ãî 111 ñò³éêèõ êîí ôîð ìåð³â, à
òà êîæ êîí ôîð ìàö³éí³ ð³âíî âà ãè çà íîð ìàëü íèõ
óìîâ. Îêð³ì òî ãî, îò ðè ìà íî äàí³ ùî äî âíóòð³øíüî -
ìî ëå êó ëÿð íèõ Í-çâ’ÿçê³â â ³çîëü î âà íî ìó Urd çà ðå -
çóëü òà òà ìè àíàë³çó òî ïî ëî㳿 åëåê òðîí íî¿ ãóñ òè íè.
Âî íè ñâ³ä÷àòü ïðî ñêëàä íó ñèñ òå ìó ñòàá³ë³çàö³¿ éî -
ãî êîí ôîð ìåð³â ÿê êëà ñè÷ íè ìè OH…O, òàê ³ íå -
ñòàí äàð òíè ìè CH…O òà CH…HC âíóòð³øíüî ìî -
ëå êó ëÿð íè ìè Í-çâ’ÿç êà ìè, ÿê³ ñï³â³ñíóþòü ç
íåñïåöèô³÷íèìè åëåêòðîñòàòè÷íèìè âçàºìîä³ÿìè
íóêëåîòèäíî¿ îñíîâè ³ öóêðîâîãî çàëèøêó.
Íà ñàìê³íå öü àâ òî ðè âèñ ëîâ ëþ þòü ùè ðó
âäÿ÷í³ñòü êîð ïî ðàö³¿ «GAUSSIAN» (ÑØÀ) çà
ëþá’ÿç íî íàä à íèé ãðàíò – ïðî ãðàì íèé ïà êåò
«GAUSSIAN03» äëÿ ïëàò ôîð ìè Win32.
R. O. Zhurakivsky, D. M. Hovorun
Conformational possibilities of uridine: DFT quantum mechanical
investigation
Summary
Complete conformational analysis of uridine is performed by
density functional theory at MP2/6-311++G(d, p)//DFT
B3LYP/6-31G(d, p) level. Main geometric, energetic, and polar
characteristics of all 111 conformers were presented, along with
conformational equilibria in temperature range of 298.15–420 K.
At T = 298.15 K these are syn:anti = 10.6:89.4 %; S:N = 85.5:14.5
%, and at T = 420 K syn:anti = 16.6:83.4 %; S:N = 68.6:31.4 %. By
quantum mechanical method (Bader’s atoms in molecules theory)
as many as 17 types of intramolecular hydrogen bonds were
established (total number is 313) in all possible conformers of
uridine, namely, C1'H...O2, C2'H2...O5', C2'H2...O2, C3'H...O2,
C5'H1...O2, C5'H2...O2, C6H...O4', C6H...O5', C3'H…HC6,
C5'H1…HC6, C5'H2…HC6, O2'H...O2, O2'H...O3', O3'H...O2',
O3'H...O5', O5'H...O2, and O5'H...O3'. Their conformational
155
ÊÎÍÔÎÐÌÀÖ²ÉͲ ÌÎÆËÈÂÎÑÒ² ÓÐÈÄÈÍÓ: ÊÂÀÍÒÎÂÎ-ÌÅÕÀͲ×ÍÅ ÄÎÑË²ÄÆÅÍÍß
properties, geometric and electron topology characteristics were
described.
Keywords: uridine, conformational analysis, quantum
mechanical density functional theory method, intramolecular
hydrogen bonds, electron density topology analysis.
Ð. À. Æó ðà êîâ ñêèé, Ä. Í. Ãî âî ðóí
Êîí ôîð ìà öè îí íûå âîç ìîæ íîñ òè óðè äè íà: êâàí òî âî-
ìå õà íè ÷åñ êîå èñ ñëå äî âà íèå ìå òî äîì ôóíê öè î íà ëà ïëîò íîñ òè
Ðå çþ ìå
Êâàí òî âî-ìå õà íè ÷åñ êèì ìå òî äîì ôóíê öè î íà ëà ïëîò íîñ òè íà
óðîâ íå òå î ðèè MP2/6-311++G(d, p)//DFT B3LYP/6-31G(d, p)
ïðî âå äåí ïî ëíûé êîí ôîð ìà öè îí íûé àíà ëèç óðè äè íà. Ïðåä -
ñòàâ ëå íû îñíîâ íûå ãå î ìåò ðè ÷åñ êèå, ýíåð ãå òè ÷åñ êèå è ïî ëÿð -
íûå õà ðàê òå ðèñ òè êè âñåõ åãî 111 óñòîé ÷è âûõ êîí ôîð ìå ðîâ.
Ïî ëó ÷å íû êîí ôîð ìà öè îí íûå ðàâ íî âå ñèÿ â äè à ïà çî íå òåì ïå ðà -
òóð 298,15–420 Ê: ïðè 298,15 Ê syn:anti = 10,6:89,4 %,
S:N=85,5:14,5 %; ïðè Ò = 420 Ê syn:anti = 16,6:83,4 %, S:N =
68,6:31,4 %. Ìå òî äîì êâàí òî âî-ìå õà íè ÷åñ êî ãî àíà ëè çà òî ïî -
ëî ãèè ýëåê òðî ííîé ïëîò íîñ òè (òå î ðèÿ àòî ìîâ â ìî ëå êó ëàõ
Áåé äå ðà) âî âñåõ âîç ìîæ íûõ êîí ôîð ìå ðàõ çà ôèê ñè ðî âà íû 17
òè ïîâ âíóò ðè ìî ëå êó ëÿð íûõ âî äî ðîä íûõ ñâÿ çåé, îò îä íî ãî äî
ïÿòè íà êîí ôîð ìåð (èõ îá ùåå ÷èñ ëî – 313): C1'H...O2,
C2'H2...O5', C2'H2...O2, C3'H...O2, C5'H1...O2, C5'H2...O2,
C6H...O4', C6H...O5', C3'H…HC6, C5'H1...HC6, C5'H2…HC6,
O2'H...O2, O2'H...O3', O3'H...O2', O3'H...O5', O5'H...O2 è
O5'H...O3'. Ïðåä ñòàâ ëå íû èõ êîí ôîð ìà öè îí íûå ñâî éñòâà, ãå î -
ìåò ðè ÷åñ êèå è ýëåê òðî ííî-òî ïî ëî ãè ÷åñ êèå õàðàêòåðèñòèêè.
Êëþ ÷å âûå ñëî âà: óðè äèí, êîí ôîð ìà öè îí íûé àíàëèç, êâàí òî -
âî-ìå õà íè ÷åñ êèé ìå òîä ôóíê öè î íà ëà ïëîòíîñòè, âíóò ðè ìî ëå -
êó ëÿðíûå âîäîðîäíûå ñâÿçè, àíàëèç òî ïî ëîãèè ýëåê òðî ííîé
ïëîò íîñ òè.
ÏÅÐÅË²Ê Ë²ÒÅÐÀÒÓÐÈ
1. Çåí ãåð Â. Ïðèí öè ïû ñòðóê òóð íîé îðãà íè çà öèè íóê ëå è íî -
âûõ êèñ ëîò.–Ì.: Ìèð, 1987.–584 ñ.
2. Ìè êåëü ñîí À. Õè ìèÿ íóê ëå î çè äîâ è íóê ëå î òè äîâ.–Ì.:
Ìèð, 1966.–668 ñ.
3. Æó ðàê³âñüêèé Ð. Î., Þðåí êî ª. Ï., Ãî âî ðóí Ä. Ì. Êîí ôîð -
ìàö³éí³ âëàñ òè âîñò³ 1',2'-äåç îêñè ðè áî çè – ìî äåëü íî ãî
öóê ðî âî ãî çà ëèø êó 2'-äåç îêñè ðè áî íóê ëå î çèä³â: ðå çóëü -
òà òè íå åìï³ðè÷ íî ãî êâàí òî âî-ìå õàí³÷íî ãî äîñë³äæåí íÿ
// Äîï. ÍÀÍ Óêðà¿ íè.–2006.–¹ 8.–Ñ. 207–213.
4. Æó ðàê³âñüêèé Ð. Î., Ãî âî ðóí Ä. Ì. Âè ÷åð ïíèé êîí ôîð -
ìàö³éíèé àíàë³ç 2'-äåç îêñè òèì³äèíó êâàí òî âî-õ³ì³÷íèì
ìå òî äîì ôóíêö³îíà ëó ãóñ òè íè // Ukr. Bioorg. Acta.–
2006.–4, ¹ 2.–Ñ. 56–63.
5. Æó ðàê³âñüêèé Ð. Î., Ãî âî ðóí Ä. Ì. Âè ÷åð ïíèé êîí ôîð -
ìàö³éíèé àíàë³ç êà íîí³÷íî ãî íóê ëå î çè äó 2'-äåç îêñè öè òè -
äè íó êâàí òî âî-ìå õàí³÷íèì ìå òî äîì ôóíêö³îíà ëó ãóñ òè -
íè // Ô³çèêà æè âî ãî.–2006.–14, ¹ 3.–Ñ. 35–48.
6. Æó ðàê³âñüêèé Ð. Î., Ãî âî ðóí Ä. Ì. Ïîâ íèé êîí ôîð -
ìàö³éíèé àíàë³ç äåç îêñè à äå íî çè íó êâàí òî âî-õ³ì³÷íèì
ìå òî äîì ôóíêö³îíà ëó ãóñ òè íè // Á³îïîë³ìåðè ³
êë³òèíà.–2007.–23, ¹ 1.–Ñ. 45–53.
7. Æó ðàê³âñüêèé Ð. Î., Ãî âî ðóí Ä. Ì. Ïîâ íèé êîí ôîð -
ìàö³éíèé àíàë³ç ìî ëå êó ëè 2'-äåç îêñè ãó à íî çè íó êâàí òî -
âî-ìå õàí³÷íèì ìå òî äîì ôóíêö³îíà ëà ãóñ òè íè // Äîï.
ÍÀÍ Óêðà¿ íè.–2007.–¹ 4.–Ñ. 187–196.
8. Æó ðàê³âñüêèé Ð. Î., Ãî âî ðóí Ä. Ì. Âè ÷åð ïíèé êîí ôîð -
ìàö³éíèé àíàë³ç 2'-äåç îêñè ó ðè äè íó êâàí òî âî-õ³ì³÷íèì
ìå òî äîì ôóíêö³îíà ëó ãóñ òè íè // Á³îïîë³ìåðè ³
êë³òèíà.–2006.–22, ¹ 5.–Ñ. 384–395.
9. Áåé äåð Ð. Àòîìû â ìî ëå êó ëàõ. Êâàí òî âàÿ òå î ðèÿ.–Ì.:
Ìèð, 2001.–532 c.
10. Parr R. G., Yang W. Density functional theory of atoms and
molecules.–New York: Oxford Univ. press, 1989.
11.Lee C., Yang W., Parr R. G. Development of the
Colle-Salvetti correlation-energy formula into a functional of
the electron density // Phys. Rev. B.–1988.–37.–P. 785–789.
12. Becke A. D. Density-functional thermochemistry. IV. A new
dynamical correlation functional and implications for
exact-exchange mixing // J. Chem. Phys.–1996.–104.–
P. 1040.
13. Frisch M. J., Trucks G. W., Schlegel H. B., Scuseria G. E.,
Robb M. A., Cheeseman J. R., Montgomery Jr., J. A., Vreven
T., Kudin K. N., Burant J. C., Millam J. M., Iyengar S. S.,
Tomasi J., Barone V., Mennucci B., Cossi M., Scalmani G.,
Rega N., Petersson G. A., Nakatsuji H., Hada M., Ehara M.,
Toyota K., Fukuda R., Hasegawa J., Ishida M., Nakajima T.,
Honda Y., Kitao O., Nakai H., Klene M., Li X., Knox J. E.,
Hratchian, H. P., Cross J. B., Bakken V., Adamo C.,
Jaramillo J., Gomperts R., Stratmann R. E., Yazyev O., Austin
A. J., Cammi R., Pomelli C., Ochterski J. W., Ayala P. Y.,
Morokuma K., Voth G. A., Salvador P., Dannenberg J. J.,
Zakrzewski V. G., Dapprich S., Daniels A. D., Strain M. C.,
Farkas O., Malick D. K., Rabuck A. D., Raghavachari K.,
Foresman J. B., Ortiz J. V., Cui Q., Baboul A. G., Clifford S.,
Cioslowski J., Stefanov B. B., Liu G., Liashenko A., Piskorz
P., Komaromi I., Martin R. L., Fox D. J., Keith T., Al-Laham
M. A., Peng C. Y., Nanayakkara A., Challacombe M., Gill P.
M. W., Johnson B., Chen W., Wong M. W., Gonzalez C., Pople
J. A. Gaussian 03, Revision C.02.–Wallingford CT: Gaussian
Inc., 2004.
14. Seeman N. C., Rosenberg J. M., Suddath F. L., Parc Kim J. J.,
Rich A. A simplified alphabetical nomenclature for dihedral
angles in the polynucleotide backbone // J. Mol.
Biol.–1976.–104.–P. 142–143.
15. Kitamura K., Wakahara A., Mizuno H., Baba Y., Tomita K.
Conformationally «concerted» changes in nucleotide
structures. A new description using circular correlation and
regression analyses // J. Amer. Chem. Soc.–1981.–103.–
P. 3899–3904.
16. Ïðå îá ðà æåí ñêàÿ Í. Í., Øà áà ðî âà Ç. À. Ïðîñ òðà íñòâåí -
íîå ñòðî å íèå íóê ëå î çè äîâ, íóê ëå î òè äîâ è èõ ïðî èç âîä -
íûõ // Óñïå õè õè ìèè.–1969.–38, ¹ 2.–Ñ. 222–247.
17. Êðàñ íî êó òñüêèé Ñ. À. Ìî ëå êó ëÿð íà ñòðóê òó ðà ìî íî ìåð -
íèõ ôðàã ìåíò³â íóê ëå¿ íî âèõ êèñ ëîò, ³çîëü î âà íèõ ó íèç ü -
êî òåì ïå ðà òóð íèõ ³íå ðòíèõ ìàò ðè öÿõ: Àâòîðåô. äèñ. ...
êàíä. ô³ç.-ìàò. íàóê / Õàðê³â. óí-ò ³ì. Â. Í. Êà -
ðàç³íà.–Õàðê³â, 2004.–19 ñ.
18. Matta C. F., Bader R. F. W. An Atoms-In-Molecules study of
the genetically-encoded amino acids: I. Effects of
conformation and of tautomerization on geometric, atomic,
and bond properties // Proteins: Struct., Funct. and Genet.–
2000.–40.–P. 310–329.
19. Ïèí ÷óê Â. Ì., Öû áó ëåâ Ï. Í., Ïàð õî ìåí êî Â. Ä. Êâàí òî -
âàÿ õè ìèÿ ìåæ ìî ëå êó ëÿð íûõ è èîí-ìî ëå êó ëÿð íûõ âçà è -
ìî äå éñòâèé ïðè ñî ëüâà òà öèè è àä ñîð áöèè.–Êèåâ: Íàóê.
äóì êà, 1994.–392 ñ.
156
ÆÓÐÀʲÂÑÜÊÈÉ Ð. Î., ÃÎÂÎÐÓÍ Ä. Ì.
20. Grabowski S. J. Ab initio calculations on conventional and
unconventional hydrogen bonds – study of the hydrogen bond
strength // J. Phys. Chem. A.–2001.–105.–P. 10739–10746.
21. Çå ôè ðîâ Þ. Â., Çîð êèé Ï. Ì. Âàí-äåð-âà àëü ñî âû ðà äè ó ñû
è èõ ïðè ìå íå íèå â õè ìèè // Óñïå õè õè ìèè.–1989.–58,
¹ 5.–Ñ. 713–746.
22. Æó ðàê³âñüêèé Ð. Î., Ãî âî ðóí Ä. Ì. Âíóòð³øíüî ìî ëå êó -
ëÿðí³ âîä íåâ³ çâ’ÿç êè ó âñ³õ ìîæ ëè âèõ êîí ôîð ìå ðàõ
2'-äåç îêñè ó ðè äè íó: íå åìï³ðè÷ íèé êâàí òî âî-õ³ì³÷íèé
àíàë³ç òî ïî ëî㳿 åëåê òðîí íî¿ ãóñ òè íè // Ukr. Bioorg.
Acta.–2006.–4, ¹ 1.–Ñ. 34–41.
23. Æó ðàê³âñüêèé Ð. Î., Ãî âî ðóí Ä. Ì. Âíóòð³øíüî ìî ëå êó -
ëÿðí³ âîä íåâ³ çâ’ÿç êè ó âñ³õ ìîæ ëè âèõ êîí ôîð ìå ðàõ
2'-äåç îêñè òèì³äèíó: íå åìï³ðè÷ íèé êâàí òî âî-õ³ì³÷íèé
àíàë³ç òî ïî ëî㳿 åëåê òðîí íî¿ ãóñ òè íè // Äîï. ÍÀÍ Óêðà¿ -
íè.–2007.–¹ 3.–C. 196–203.
24. Æó ðàê³âñüêèé Ð. Î., Ãî âî ðóí Ä. Ì. Âíóòð³øíüî ìî ëå êó -
ëÿðí³ âîä íåâ³ çâ’ÿç êè ó êîí ôîð ìå ðàõ 2'-äåç îêñè öè òè äè -
íó: ðå çóëü òà òè êâàí òî âî-õ³ì³÷íî ãî àíàë³çó òî ïî ëî㳿
åëåê òðîí íî¿ ãóñ òè íè // Óêð. á³îõ³ì. æóðí.–2006.–78,
¹ 6.–Ñ. 44–51.
25. Æó ðàê³âñüêèé Ð. Î., Ãî âî ðóí Ä. Ì. ßê³ âíóòð³øíüî ìî ëå -
êó ëÿðí³ âîä íåâ³ çâ’ÿç êè ñòàá³ë³çó þòü êîí ôîð ìå ðè äåçî-
êñè à äå íî çè íó? Ðå çóëü òà òè êâàí òî âî-õ³ì³÷íî ãî àíàë³çó
òî ïî ëî㳿 åëåê òðîí íî¿ ãóñ òè íè // Á³îïîë³ìåðè ³
êë³òèíà.–2007.–23, ¹ 4.–C. 363–368.
26. Æó ðàê³âñüêèé Ð. Î., Ãî âî ðóí Ä. Ì. Âíóòð³øíüî ìî ëå êó -
ëÿðí³ âîä íåâ³ çâ’ÿç êè, ùî ñòàá³ë³çó þòü êîí ôîð ìå ðè äåçî-
êñè ãó à íî çè íó: ðå çóëü òà òè êâàí òî âî-ìå õàí³÷íî ãî àíàë³çó
òî ïî ëî㳿 åëåê òðîí íî¿ ãóñ òè íè // Äîï. ÍÀÍ Óêðà¿ -
íè.–2007.–¹ 5.–Ñ. 180–184.
27. Shishkin O. V., Palamarchuk G. V., Gorb L., Leszczynski J.
Intramolecular hydrogen bonds in canonical 2'-deoxyri-
bonucleotides: an atoms in molecules study // J. Phys. Chem.
B.–2006.–110.–P. 4413–4422.
28. Ãî âî ðóí Ä. Ì., Êîí äðà òþê ². Â. Ãà çî ôàçí³ êèñ ëîò -
íî-ëóæí³ âëàñ òè âîñò³ êà íîí³÷íèõ íóê ëå î òèä íèõ îñíîâ //
Äîï. ÍÀÍ Óêðà¿ íè.–1998.–¹ 1.–Ñ. 207–212.
ÓÄÊ 577.3
Íàä³éøëà äî ðå äàêö³¿ 24.05.07
157
ÊÎÍÔÎÐÌÀÖ²ÉͲ ÌÎÆËÈÂÎÑÒ² ÓÐÈÄÈÍÓ: ÊÂÀÍÒÎÂÎ-ÌÅÕÀͲ×ÍÅ ÄÎÑË²ÄÆÅÍÍß
|