Нуклеотидна послідовність фрагментів плазміди pSS27

Виявлено значну гомологію (92 %) просеквенованих стрептоміцетних послідовностей плазмід рSRL13, рSRL16 (F-праймер) та pSW49 (R-праймер) з послідовностями хромосомних генів білків споруляції Streptomyces coelicolor A3(2) та S. avermitilis MA-4680. Також встановлено їхню гомологію (73 %) з послідовнос...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:

Bibliographische Detailangaben
Datum:	2008
Hauptverfasser:	Лук‘янчук, В.В., Поліщук, Л.В., Мацелюх, Б.П.
Format:	Artikel
Sprache:	Ukrainian
Veröffentlicht:	Українське товариство генетиків і селекціонерів ім. М.І. Вавилова 2008
Schriftenreihe:	Вісник Українського товариства генетиків і селекціонерів
Schlagworte:	Оригінальні статті
Online Zugang:	http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/18823
Tags:	Tag hinzufügen Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
Назва журналу:	Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Zitieren:	Нуклеотидна послідовність фрагментів плазміди pSS27 / В.В. Лук‘янчук, Л.В. Поліщук, Б.П. Мацелюх // Вісник Українського товариства генетиків і селекціонерів. — 2008. — Т. 6, № 2. — С. 256-261. — Бібліогр.: 15 назв. — укр.

Institution

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine

id	irk-123456789-18823
record_format	dspace
spelling	irk-123456789-188232013-02-13T02:43:06Z Нуклеотидна послідовність фрагментів плазміди pSS27 Лук‘янчук, В.В. Поліщук, Л.В. Мацелюх, Б.П. Оригінальні статті Виявлено значну гомологію (92 %) просеквенованих стрептоміцетних послідовностей плазмід рSRL13, рSRL16 (F-праймер) та pSW49 (R-праймер) з послідовностями хромосомних генів білків споруляції Streptomyces coelicolor A3(2) та S. avermitilis MA-4680. Також встановлено їхню гомологію (73 %) з послідовностями TraА-генів кількох стрептоміцетних плазмід (pJV1, рSLS і pSN22). Нуклеотидні послідовності плазміди pSS27, що клоновані в гібридних плазмідах рSRL13, рSRL16 (F-праймер) та pSW49 (R-праймер), є гомологічними між собою. Обнаружена значительная гомология (до 92%) стрептомицетных последовательностей гибридных плазмид рSRL13, рSRL16 (F-праймер) и pSW49 (R-праймер) с последовательностями хромосомных генов белков спорулляции Streptomyces coelicolor A3(2) и S. avermitilis MA-4680. Также установлено их гомологию (73%) с последовательностями TraА-генов ряда стрептомицетных плазмид (pJV1, рSLS и pSN22). Hуклеотидные последовательности плазмиды pSS27, клонированные в гибридных плазмидах рSRL13, рSRL16 (F-праймер) и pSW49 (R-праймер), гомологичны между собой. It was found significant homology (up to 92%) of Streptomyces sequences of hybrid plasmid рSRL13, рSRL16 (F-primer) and pSW49 (R- primer) with ones of genes for sporulation protein of Streptomyces coelicolor A3(2) and S. avermitilis MA-4680 chromosomes. Also it is established them homology (73 %) with sequences of TraА-genes some Streptomycetes plasmids (pJV1, рSLS and pSN22). Homology one to others of sequences of plasmid pSS27 which were maintenanced in hybrid plasmids рSRL13, рSRL16 (F-primer) and pSW49 (R- primer) was established. 2008 Article Нуклеотидна послідовність фрагментів плазміди pSS27 / В.В. Лук‘янчук, Л.В. Поліщук, Б.П. Мацелюх // Вісник Українського товариства генетиків і селекціонерів. — 2008. — Т. 6, № 2. — С. 256-261. — Бібліогр.: 15 назв. — укр. 1810-7834 http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/18823 577.113.3:579.25:579.873.7:633.15 uk Вісник Українського товариства генетиків і селекціонерів Українське товариство генетиків і селекціонерів ім. М.І. Вавилова
institution	Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection	DSpace DC
language	Ukrainian
topic	Оригінальні статті Оригінальні статті
spellingShingle	Оригінальні статті Оригінальні статті Лук‘янчук, В.В. Поліщук, Л.В. Мацелюх, Б.П. Нуклеотидна послідовність фрагментів плазміди pSS27 Вісник Українського товариства генетиків і селекціонерів
description	Виявлено значну гомологію (92 %) просеквенованих стрептоміцетних послідовностей плазмід рSRL13, рSRL16 (F-праймер) та pSW49 (R-праймер) з послідовностями хромосомних генів білків споруляції Streptomyces coelicolor A3(2) та S. avermitilis MA-4680. Також встановлено їхню гомологію (73 %) з послідовностями TraА-генів кількох стрептоміцетних плазмід (pJV1, рSLS і pSN22). Нуклеотидні послідовності плазміди pSS27, що клоновані в гібридних плазмідах рSRL13, рSRL16 (F-праймер) та pSW49 (R-праймер), є гомологічними між собою.
format	Article
author	Лук‘янчук, В.В. Поліщук, Л.В. Мацелюх, Б.П.
author_facet	Лук‘янчук, В.В. Поліщук, Л.В. Мацелюх, Б.П.
author_sort	Лук‘янчук, В.В.
title	Нуклеотидна послідовність фрагментів плазміди pSS27
title_short	Нуклеотидна послідовність фрагментів плазміди pSS27
title_full	Нуклеотидна послідовність фрагментів плазміди pSS27
title_fullStr	Нуклеотидна послідовність фрагментів плазміди pSS27
title_full_unstemmed	Нуклеотидна послідовність фрагментів плазміди pSS27
title_sort	нуклеотидна послідовність фрагментів плазміди pss27
publisher	Українське товариство генетиків і селекціонерів ім. М.І. Вавилова
publishDate	2008
topic_facet	Оригінальні статті
url	http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/18823
citation_txt	Нуклеотидна послідовність фрагментів плазміди pSS27 / В.В. Лук‘янчук, Л.В. Поліщук, Б.П. Мацелюх // Вісник Українського товариства генетиків і селекціонерів. — 2008. — Т. 6, № 2. — С. 256-261. — Бібліогр.: 15 назв. — укр.
series	Вісник Українського товариства генетиків і селекціонерів
work_keys_str_mv	AT lukânčukvv nukleotidnaposlídovnístʹfragmentívplazmídipss27 AT políŝuklv nukleotidnaposlídovnístʹfragmentívplazmídipss27 AT macelûhbp nukleotidnaposlídovnístʹfragmentívplazmídipss27
first_indexed	2025-07-02T19:46:26Z
last_indexed	2025-07-02T19:46:26Z
_version_	1836565750999941120
fulltext	256 ISSN 1810�7834. Вісн. Укр. тов�ва генетиків і селекціонерів. 2008, том 6, № 2 УДК 577.113.3:579.25:579.873.7:633.15 НУКЛЕОТИДНА ПОСЛІДОВНІСТЬ ФРАГМЕНТІВ ПЛАЗМІДИ pSS27 В.В. ЛУК’ЯНЧУК, Л.В. ПОЛІЩУК, Б.П. МАЦЕЛЮХ Інститут мікробіології і вірусології імені Д.К. Заболотного, НАН України, Україна, 03143, Київ, вул. академіка Заболотного, 154 e�mail: vitaly@serv.imv.kiev.ua Виявлено значну гомологію (92 %) просеквенованих стрептоміцетних послідов� ностей плазмід рSRL13, рSRL16 (F�праймер) та pSW49 (R�праймер) з послідов� ностями хромосомних генів білків споруляції Streptomyces coelicolor A3(2) та S. avermitilis MA�4680. Також встановлено їхню гомологію (73 %) з послідовно� стями TraА�генів кількох стрептоміцетних плазмід (pJV1, рSLS і pSN22). Нук� леотидні послідовності плазміди pSS27, що клоновані в гібридних плазмідах рSRL13, рSRL16 (F�праймер) та pSW49 (R�праймер), є гомологічними між со� бою. Ключові слова: стрептоміцет, плазміда, нуклеотидна послідовність. Вступ. На даний час повідомлено, що встановлено повну нуклео� тидну послідовність майже 1300 хромосомних ДНК мікроорганізмів у тому числі і 3 стрептоміцетних – S. avermitilis MA�4680, Streptomyces coelicolor A3(2) та S. griseus subsp. griseus NBRC 13350 [1, 2]. Також велика увага приділяється встановленню нуклеотидної по� слідовності позахромосомних ДНК. На початок 2008 року визначено повну нуклеотидну послідовність більш ніж 1200 плазмід мікроор� ганізмів, що належать до різних родин. Повну нуклеотидну послідовність встановлено для 22 плазмід стрептоміцетів [1, 2]. Відомо, що плазміди стрептоміцетів поряд із генами, необхідними для своєї реплікації, передачі та розповсюдження, можуть містити і гени, що надають клітині�господарю ряд властивостей (наприклад, синтез антибіотика метиленоміцину детермінується плазмідами SCP1 i pSV1, плазміда pST4 детермінує РНК�метилазу, що забезпечує клітину стійкістю до стрептоміцину�лінкоміцину�спіраміцину) [3, 4]. Базуючись на даних секвенування плазмідних ДНК, виявлено детер� мінацію плазмідами ряду ферментів (наприклад, ендо� і екзонуклеаз, лігази, полікетидсинтаз І типу, дегідрогеназ), білків мембран та ряду інших метаболітів [1, 2]. Плазмід SCP1, SCP2 і SLP2 повідомляється про кодування ними білків, що беруть участь в утворенні повітряного міце� лію і спор [5–7]. © В.В. ЛУК’ЯНЧУК, Л.В. ПОЛІЩУК, Б.П. МАЦЕЛЮХ, 2008 257ISSN 1810�7834. Вісн. Укр. тов�ва генетиків і селекціонерів. 2008, том 6, № 2 Нуклеотидна послідовність фрагментів плазміди pSS27 Таким чином, визначення послідов� ності ДНК має важливе значення як для дослідження всіх фундаментальних біологічних процесів, так і для встанов� лення таксономічних зв’язків мікроор� ганізмів, генно�інженерних та біотех� нологічних розробок. Метою даної роботи було встанов� лення нуклеотидної послідовності низ� ки фрагментів стрептоміцетної плазмі� ди pSS27, клонованих раніше в біфун� кціональному векторі pWHM4. Матеріали і методи У роботі досліджували плазмідні ДНК ряду трансформантів Escherichia coli [8] (табл. 1). В експериментах використовували середовища МПА та МПБ, які містили ампіцилін у концентрації 100 мкг/мл. Плазмiдну ДНК з клітин трансфор� мантів отримували за методикою Кie� ser [9]. Електрофорез плазмідної ДНК проводили в 0,8 % агарозi в ТБЕ� буферi [10]. Визначення нуклеотидних послі� довностей проводили на секвенаторі CEQ2000XL “Beckman”. Секвенування проводили з використанням пари праймерів: F�праймер 5’�GTAAAACGACCGCCAGT�3’ R�праймер 5’�CAGGAAACAGCTATGAC�3’. Результати та обговорення З літературних джерел відомо, що завдяки наявності плазмідної ДНК клітина стрептоміцету може отримати здатність продукувати ряд біологічно активних речовин, таких як антибіоти� ки, пігменти і амінокислоти, набути стійкість до токсичних речовин та ряд інших життєво важливих властивостей [5, 11, 12]. Штам Streptomyces sp. 27 було ви� ділено із зразка ґрунту Київської обл. в 1995 р. У результаті досліджень його фізіологічних та морфологічних влас� тивостей було встановлено, що штам є продуцентом ендонуклеази ІІ типу Ssp27 та містить плазміду pSS27 (13,7 ± 0,2 тпн) [8]. На базі векторів pBluescriptII SK(+) та pWHM4 створено банк фрагментів стрептоміцетної плазміди pSS27. Ві� дібрані трансформанти містили гіб� ридні молекули ДНК зі вставками ДНК стрептоміцетної плазміди pSS27 від 0,5 тпн до 12,3 тпн [8]. Відомо, що інди� відуальні гени складають лише незнач� ну частину банку клонованих послідов� ностей. Як встановлено, в складі век� торної плазміди pWHM4 проклоновано як послідовності ДНК плазміди pSS27, що обмежені сайтами впізнавання ре� стриктази Pst1, так і такі, що мають один чи більше сайтів рестрикції для даного ферменту всередині проклоно� ваного фрагмента [8]. Проведено сек� венування фрагментів ДНК плазміди pSS27, які були включені до складу 11 гібридних плазмід. Розміри визначе� Таблиця 1. Трансформанти E. coli та їхні гібридні плазміди Трансформанти Умови конструювання плазмід SRL13 (рSRL13); SRL14 (рSRL14); SRL15 (рSRL15); SRL16 (рSRL16); SRL17 (рSRL17); SRL19 (рSRL19); SRL22 (рSRL22); SRL23 (рSRL23) вектор: pBlueskript II SK (+) (2,9 тпн). ендонуклеаза: Bsp120I. реципієнт: E. coli DH1. SW49 (рSW49); SW51 (рSW51) вектор: pWHM4 ( 6,6 тпн). ендонуклеаза: PstI. реципієнт: E. coli JM109. Примітка: * – частковий гідроліз плазміди pSS27. 258 ISSN 1810�7834. Вісн. Укр. тов�ва генетиків і селекціонерів. 2008, том 6, № 2 В.В. Лук’янчук, Л.В. Поліщук, Б.П. Мацелюх них нуклеотидних послідовностей ста� новили від 352 до 1034 пн (рис. 1, табл. 2). Порівняння визначених нуклеотид� них послідовностей проклонованих фрагментів плазміди pSS27 з Інтернет� базами даних GenBank та EMBL, які містять інформацію про визначені нук� леотидні послідовності, дозволили ви� явити високу тотожність її з низкою генів стрептоміцетів (як хромосомних, так і плазмідних), які детермінують білки з різними функціями [1, 2]. Для просеквенованої частини по� слідовності плазміди pSW49 (F�прай� мер) виявлена гомологія в більш ніж в 85 % з послідовностями ДНК низки стрептоміцетів: S. coelicolor A3(2), S. avermitilis MA�4680 та S. рhaeochro� mogenes. Встановлена гомологія 86 % – 92 % послідовностей цього фрагмен� та плазміди pSS27 з послідовностями білків (хромосомні гени), які беруть участь у споруляції S. coelicolor A3(2) та S. avermitilis MA�4680 відповідно і гомологія в 92 % послідовності цього фрагмента з плазмідою pJV1 S. рhaeo� chromogenes [8]. Було виявлено гомо� логію (до 67 %) з послідовностями плазмід pSLS (S. lauterentii), pSN22 1 ccggcacgtg ataatcgcag ccatgatgta tacgactcac tatagggcga ttgggtaccg 61 ggcccagttc atgaccggct gctgcggctt ccgggcgcgg ggttgatctc ggttgatctc 121 ttcctcgtac tcctgctgga acgaggcgta ggcagcggca gcgttcttcg cggcgtcccg 181 cagagcgtcg cgctctgcgc ntctgcggcg acctctgcgc gcgatgcgga gcgacgcacg 241 ccctcgggtc ggcacgcggg agcncgctct gcaggatctc gctgcatcgc gaactcgatg 301 gagagcgtca cgcccgcggc ccgcagggtg ttgcagtagt tccgcacctg cgccgggaca 361 agaactcggc gagggcagag cgactgcacg acgcccgccg ggcggcggcg ctgcctgttg 421 tgtccgtacg tgaccgcgga gagcgcacca gccccgacga acgccgcgcg cccacgtggc 481 aactgtgtcc cgctgctccg tgtctgtggc atgctganct cgttgctctt tcgtncgccc 541 tcgtncgccc tgcgtacggc agcggaacac gacgtacgat cttcttgcac cgcgtt Рис. 1. Нуклеотидна послідовність фрагмента плазміди pSS27 {гібридна плазміда рSRL13 (R�прай� мер)} Таблиця 2. Визначення нуклетидної послідовності фрагментів стрептоміцетної плазміди pSS27 Розміри просіквенованих фрагментів гібридних плазмідГібридні плазміди та їхні молекулярні розміри F-праймер R-праймер рSRL13 (12,0 тпн) 596 581 рSRL14 (4,4 тпн) 668 590 рSRL15 (4,4 тпн) 747 648 рSRL16 (7,0 тпн) 761 1034 рSRL17 (6,0 тпн) 725 630 рSRL19 (10,5 тпн) 684 718 рSRL22 (4,0 тпн) H 352 рSRL23 (7,0 тпн) 181 H рSW49 (8,0 тпн) 694 800 рSW41 (18,0 тпн) 590 401 Примітка: Н – визначення не проведено. 259ISSN 1810�7834. Вісн. Укр. тов�ва генетиків і селекціонерів. 2008, том 6, № 2 Нуклеотидна послідовність фрагментів плазміди pSS27 (S. flavovirens) та pRL1 (S. sp. 44030). Так гомологічними виявилися гени пе� ренесення TraBSL плазміди pSLS та TraB плазміди pRL1 [1, 2]. Подальші наші дослідження також виявили знач� ну гомологію (до 92 %) просеквенова� них стрептоміцетних послідовностей гібридних плазмід рSRL13, рSRL16 (F� праймер) та pSW49 (R�праймер) з по� слідовностями хромосомних генів білків споруляції S. coelicolor A3(2) та S. avermitilis MA�4680 тих же кластерів, що і послідовність плазміди pSW49 (F� праймер). Було виявлено гомологію (до 73 %) секвенованих послідовностей плазмід рSRL16 (F�праймер) та pSW49 (R�пра� ймер) з послідовностями плазмід pJV1, рSLS і pSN22. Для послідовнос� тей даних фрагментів плазміди pSS27 виявлено гомологію до послідовнос� тей TraА�генів вище означених плазмід [1, 2]. У той час як для першої просікве� нованої послідовності плазміди pSW49 (F�праймер) встановлено гомологію в 92 % з нуклеотидною послідовностю гена TraB плазміди pJV1 S. рhaeo� chromogenes [8]. З даних літератури відомо, що у штама S. coelicolor A3(2) білки, які за� безпечують утворення повітряного міцелію та спор детермінуються гена� ми, локалізованими на хромосомі та плазмідах SCP1 та SСP2 [1, 2, 5, 6]. Необхідно підкреслити, що не виявле� но гомології нуклеотидної будови у ви� щезгаданих генів. Цікавим є той факт, що нами виявлено гомологію нуклео� тидної послідовності плазміди pSS27 з локалізованими на хромосомі S. coelicolor A3(2) генами, які детермі� нують білки споруляції. В літературі є повідомлення про го� мологічність нуклеотидних послідов� ностей плазмідних і хромосомних генів клітини�господаря. Такі гени можуть детермінувати властивості, що є важ� ливими для носія. Наприклад, у штамі S. cattleya знайдено плазміду, що містить ген аргінінсукцинат синтетази, який гібридизується з аналогічними генами стрептоміцетів [13]. Зі штаму S. rimosus SRP2 було виділено плазмі� ду SRP2’, яка містила ген стійкості до окситетрацикліну, послідовність якого гомологічна з хромосомним геном стійкості [14]. Висловлено припущен� ня, що прим�форма плазміди SRP2 ут� ворилася при ексцизії плазміди з хро� мосоми. Загальновідома прим�форма плазміди S. coelicolor SCP1’�cysB, яка утворюється після кон’югаційного пе� ренесення [15]. На підставі наших даних, можна зробити припущення, що штам Strep� tomyces sp. 27 є таксономічно близь� ким S. coelicolor A3(2) та S. avermitilis MA�4680, а фрагменти плазміди pSS27, що проклоновані в гібридних плазмідах pSW49, рSRL13 та рSRL16, походять з хромосоми носія. Як було встановлено, три визначені нуклеотидні послідовності плазміди pSS27, які містяться в гібридних плаз� мідах рSRL13, рSRL16 (F�праймер) та pSW49 (R�праймер), є гомологічними між собою (рис. 2). Як вказувалося ра� ніше, при конструюванні плазмід рSRL13 та рSRL16 використовували рестриктазу Bsp120I, в той час як для створення плазміди pSW49 застосува� ли ендонуклеазу PstI. Вірогідно, що “зсув” у розташуванні послідовністі плазміди pSW49 (R�праймер) на схемі є наслідком того, що клонування про� ведено в цьому випадку з використан� ням ендонуклеази PstI. Крім того, ви� явлено різницю в напрямках розташу� вання клонованих стрептоміцетних фрагментів у гібридних плазмідах рSRL13 та рSRL16 щодо такого плаз� міди pSW49. Таким чином, у плазмідах 260 ISSN 1810�7834. Вісн. Укр. тов�ва генетиків і селекціонерів. 2008, том 6, № 2 В.В. Лук’янчук, Л.В. Поліщук, Б.П. Мацелюх рSRL13, рSRL16 та pSW49 було про� клоновано фрагменти плазміди pSS27 різних розмірів, які розташовуються на одному і тому сегменті молекули стрептоміцетної плазміди pSS27. Рис. 2. Гомологія секвенованих фрагментів гібридних плазмід рSRL13, рSRL16 та pSW49 Висновки В гібридних плазмідах рSRL13, рSRL16 та pSW49 було проклоновано фрагменти плазміди pSS27 різних мо� лекулярних розмірів, які проте розта� шовуються на одному і тому ж сегменті молекули стрептоміцетної плазміди pSS27. Встановлено значну гомологію (до 92 %) нуклеотидної послідовності фрагмента плазміди pSS27, який вхо� дить до складу гібридних плазмід рSRL13, рSRL16 та pSW49 із послідов� ностями низки генів стрептоміцетів (як хромосомних, так і плазмідних), що детермінують білки з різними функці� ями. Перелік літератури 1. Інтернет�база даних GenBank (www.ncbi.nlm.nih.gov). 2. Iнтернет�база даних EMBL (www.ebi.ac.uk/embl.html). 3. Kinashi H., Shimaji M., Sakai A. Giant linear plasmids in Streptomyces which code for antibiotic biosynthesis genes // Nature, London. – 1987. – Vol. 328, № 6129. – P. 454–456. 4. Lin C., Xue Y. Plasmid characteristics of termophilic Streptomycetes // Biologycal, biochemical and biomedical aspects of actinomycetes. Proceeding of the Sixth International Symposium on Actino� mycetes Biology, (Szabo G., Biro S., Goodfellow M, eds), Academiai Kiado, Budapest.– 1986. –B. – P.606. 5. Bentley S.D., Chater K.F., Cerdeno– Tarraga A.M., et al. Complete genome sequence of the model actinomycetes Streptomyces coelicolor A3(2) // Nature. – 2002. – Vol. 417, №6885. – P. 141�147. 6. Huang C., Chen C., Tsai H., Chen C., Lin Y., Chen C.W. Linear plasmid SLP2 of Streptomyces lividans is a composite replicon // Mol. Microbiol. – 2003. – Vol. 47, №6. – P. 1563–1576. 7. Kataoka M., Kiyose Y.M., Michisuji Y., Horiguchi T., Seki T., Yoshida T. Complete nucleotide sequence of the Streptomyces nigrifaciens plasmid, pSN22: genetic organization and correlation with genetic properties // Plasmid. – 1994. – Vol. 32, №1. – P. 55�69. 8. Лук’янчук В.В., Поліщук Л.В., Маце� люх Б.П. Дослідження стрептоміцетної плазміди pSS27 // Мікроб. журн. – 2006. – Vol. 68, №5. – С. 20–25. 9. Kieser T. Factors affecting the isolation of CCC DNA from Streptomyces lividans and Escherichia coli // Plasmid. – 1984. – Vol. 12, №1. – P. 19–36. 10. Маниатис Т., Фрич Э., Сэмбук Дж. Мо� лекулярное клонирование. Методы ге� нетической инженерии. – Москва: Мир, 1984. – 450 с. 11. MacNeil T., Gibbons P.H. Characte� rization of the Streptomyces plasmid pVE1 // Plasmid. – 1986. – Vol. 16, № 3. – P. 182–194. 12. Thompson C.J., Ward J.M., Hopwo� od D.A. Cloning of antibiotic resistance and nutritional genes in Streptomycetes // J. Bacteriol. – 1982. – Vol. 15, №2. – P. 668–677. 13. Usdin K., Christians K.M., De Wet C., Potgieter T.D., Shaw C.B., Kirby R. The loss of a large DNA fragment is associated with an aerial mycelium negative (Amy –) phenotype of Streptomyces cattleya //J. Gen. Microbiol. – 1985. – Vol. 131, №2. – P. 979–981. 14. Rhodes P.M., Hunter I.S., Friend E.J., Warren M. Recombinant DNA method for 261ISSN 1810�7834. Вісн. Укр. тов�ва генетиків і селекціонерів. 2008, том 6, № 2 Нуклеотидна послідовність фрагментів плазміди pSS27 the oxytetracycline producer Strepto� myces rimosus // Biochemical Society Transaction. – 1984. – №12. – P. 586– 587. 15. Hopwood D.A., Wright H.M. Genetic studies on SCP1–prime strains of Strepto� myces coelicolor A3(2) // J. Gen. Micro� biol. – 1976. – Vol. 95, №1. – P. 107–120. Представлено Ф.І. Товкачем Надійшла 19.05.2008 ИССЛЕДОВАНИЕ НУКЛЕОТИДНОЙ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ ПЛАЗМИДЫ pSS27 В.В. Лукьянчук, Л.В. Полищук, Б.П. Мацелюх Ин�т микробиологии и вирусологи НАН Украины Украина, 03143, Киев, ул. Академика Заболотного, 154 e�mail: vitaly@serv.imv.kiev.ua Обнаружена значительная гомология (до 92%) стрептомицетных последовательно� стей гибридных плазмид рSRL13, рSRL16 (F�праймер) и pSW49 (R�праймер) с пос� ледовательностями хромосомных генов белков спорулляции Streptomyces coelicolor A3(2) и S. avermitilis MA�4680. Также установлено их гомологию (73%) с последовательностями TraА�генов ряда стрептомицетных плазмид (pJV1, рSLS и pSN22). Hуклеотидные последовательно� сти плазмиды pSS27, клонированные в гибридных плазмидах рSRL13, рSRL16 (F�праймер) и pSW49 (R�праймер), гомо� логичны между собой. Ключевые слова: стрептомицет, плазми� да, нуклеотидная последовательность. RESEACH OF NUCLEOTIDE SEQUENCE OF PLASMID pSS27 V.V. Lukyanchuk, L.V. Polishchuk, B.P. Matselyukh Int. of Microbiology and Virology NASU Ukraine, 03143, Kyiv, Zabolotny st., 154 e�mail: vitaly@serv.imv.kiev.ua It was found significant homology (up to 92%) of Streptomyces sequences of hybrid plasmid рSRL13, рSRL16 (F�primer) and pSW49 (R� primer) with ones of genes for sporulation protein of Streptomyces coelicolor A3(2) and S. avermitilis MA�4680 chromosomes. Also it is established them homology (73 %) with sequences of TraА�genes some Strepto� mycetes plasmids (pJV1, рSLS and pSN22). Homology one to others of sequences of plasmid pSS27 which were maintenanced in hybrid plasmids рSRL13, рSRL16 (F�primer) and pSW49 (R� primer) was established. Key words: Streptomycetes. plasmid, nucleotide sequence.

Нуклеотидна послідовність фрагментів плазміди pSS27

Institution

Ähnliche Einträge