Исследование комплексообразования акридинового красителя профлавина с дезокситетрарибонуклеозидтрифосфатом 5-d(TpGpCpA) в водном растворе методом ¹Н-ЯМР спектроскопии

Исследовано взаимодействие красителя акридинового ряда профлавина с самокомплементарным дезокситетрарибонуклеозидтрифосфатом 5'-d(TpGpCpA) в водно-солевом растворе методом одномерной и двухмерной Х ¹Н-ЯМР спектроскопии (500 МГц). Измерены концентрационные и температурные зависимости протонных х...

Повний опис

Збережено в:

Бібліографічні деталі
Дата:	1998
Автори:	Итон, Р.Д., Веселков, Д.А., Дымант, Л.Н., Барановский, С.Ф., Осетров, С.Г., Дэвис, Д.Б., Веселков, А.Н.
Формат:	Стаття
Мова:	Russian
Опубліковано:	Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 1998
Назва видання:	Биополимеры и клетка
Теми:	Структура и функции биополимеров
Теги:	Додати тег Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Назва журналу:	Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Цитувати:	Исследование комплексообразования акридинового красителя профлавина с дезокситетрарибонуклеозидтрифосфатом 5-d(TpGpCpA) в водном растворе методом ¹Н-ЯМР спектроскопии / Р.Д. Итон, Д.А. Веселков, Л.Н. Дымант, С.Ф. Барановский, С.Г. Осетров, Д.Б. Дэвис, А.Н. Веселков // Биополимеры и клетка. — 1998. — Т. 14, № 2. — С. 117-126. — Бібліогр.: 30 назв. — рос.

Репозитарії

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine

id	oai:nasplib.isofts.kiev.ua:123456789-154986
record_format	dspace
institution	Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection	DSpace DC
language	Russian
topic	Структура и функции биополимеров Структура и функции биополимеров
spellingShingle	Структура и функции биополимеров Структура и функции биополимеров Итон, Р.Д. Веселков, Д.А. Дымант, Л.Н. Барановский, С.Ф. Осетров, С.Г. Дэвис, Д.Б. Веселков, А.Н. Исследование комплексообразования акридинового красителя профлавина с дезокситетрарибонуклеозидтрифосфатом 5-d(TpGpCpA) в водном растворе методом ¹Н-ЯМР спектроскопии Биополимеры и клетка
description	Исследовано взаимодействие красителя акридинового ряда профлавина с самокомплементарным дезокситетрарибонуклеозидтрифосфатом 5'-d(TpGpCpA) в водно-солевом растворе методом одномерной и двухмерной Х ¹Н-ЯМР спектроскопии (500 МГц). Измерены концентрационные и температурные зависимости протонных химических сдвигов взаимодействующих молекул Рассмотрены различные модели образования комплексов молекул красителя с тетрануклеотидом, рассчитаны равновесные константы, энтальпии ΔН и энтропии ΔS реакций образования комплексов состава 1:1, 2:1, 1:2 и 2:2. Выявлены особенности динамического равновесия комплексов различного типа в зависимости от соотношения концентраций красителя и гпетрануклеотида. Сделано заключение о преимущественной интеркаляции профлавина в пиримидин-пуриновые TG- и СА-сайты тетрануклеотида. Сравнение закономерностей интеркаляционного взаимодействия профлавина и исследованного ранее фенантридинового красителя бромистого этидия показало, что интенсивность селективного связывания ароматических лигандов с пиримидин-пуриновыми сайтами дезокситетрануклеотидов зависит от их состава и от вида оснований, фланкирующих места посадки лиганда. На основании рассчитанных значений индуцированных химических сдвигов для протонов красителя и данных 2M-NOESY определены наиболее вероятные пространственные структуры 1:2- и 2:2-комплексов профлавина с тетрануклеотидом.
format	Article
author	Итон, Р.Д. Веселков, Д.А. Дымант, Л.Н. Барановский, С.Ф. Осетров, С.Г. Дэвис, Д.Б. Веселков, А.Н.
author_facet	Итон, Р.Д. Веселков, Д.А. Дымант, Л.Н. Барановский, С.Ф. Осетров, С.Г. Дэвис, Д.Б. Веселков, А.Н.
author_sort	Итон, Р.Д.
title	Исследование комплексообразования акридинового красителя профлавина с дезокситетрарибонуклеозидтрифосфатом 5-d(TpGpCpA) в водном растворе методом ¹Н-ЯМР спектроскопии
title_short	Исследование комплексообразования акридинового красителя профлавина с дезокситетрарибонуклеозидтрифосфатом 5-d(TpGpCpA) в водном растворе методом ¹Н-ЯМР спектроскопии
title_full	Исследование комплексообразования акридинового красителя профлавина с дезокситетрарибонуклеозидтрифосфатом 5-d(TpGpCpA) в водном растворе методом ¹Н-ЯМР спектроскопии
title_fullStr	Исследование комплексообразования акридинового красителя профлавина с дезокситетрарибонуклеозидтрифосфатом 5-d(TpGpCpA) в водном растворе методом ¹Н-ЯМР спектроскопии
title_full_unstemmed	Исследование комплексообразования акридинового красителя профлавина с дезокситетрарибонуклеозидтрифосфатом 5-d(TpGpCpA) в водном растворе методом ¹Н-ЯМР спектроскопии
title_sort	исследование комплексообразования акридинового красителя профлавина с дезокситетрарибонуклеозидтрифосфатом 5-d(tpgpcpa) в водном растворе методом ¹н-ямр спектроскопии
publisher	Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
publishDate	1998
topic_facet	Структура и функции биополимеров
citation_txt	Исследование комплексообразования акридинового красителя профлавина с дезокситетрарибонуклеозидтрифосфатом 5-d(TpGpCpA) в водном растворе методом ¹Н-ЯМР спектроскопии / Р.Д. Итон, Д.А. Веселков, Л.Н. Дымант, С.Ф. Барановский, С.Г. Осетров, Д.Б. Дэвис, А.Н. Веселков // Биополимеры и клетка. — 1998. — Т. 14, № 2. — С. 117-126. — Бібліогр.: 30 назв. — рос.
series	Биополимеры и клетка
work_keys_str_mv	AT itonrd issledovaniekompleksoobrazovaniâakridinovogokrasitelâproflavinasdezoksitetraribonukleozidtrifosfatom5dtpgpcpavvodnomrastvoremetodom1nâmrspektroskopii AT veselkovda issledovaniekompleksoobrazovaniâakridinovogokrasitelâproflavinasdezoksitetraribonukleozidtrifosfatom5dtpgpcpavvodnomrastvoremetodom1nâmrspektroskopii AT dymantln issledovaniekompleksoobrazovaniâakridinovogokrasitelâproflavinasdezoksitetraribonukleozidtrifosfatom5dtpgpcpavvodnomrastvoremetodom1nâmrspektroskopii AT baranovskijsf issledovaniekompleksoobrazovaniâakridinovogokrasitelâproflavinasdezoksitetraribonukleozidtrifosfatom5dtpgpcpavvodnomrastvoremetodom1nâmrspektroskopii AT osetrovsg issledovaniekompleksoobrazovaniâakridinovogokrasitelâproflavinasdezoksitetraribonukleozidtrifosfatom5dtpgpcpavvodnomrastvoremetodom1nâmrspektroskopii AT dévisdb issledovaniekompleksoobrazovaniâakridinovogokrasitelâproflavinasdezoksitetraribonukleozidtrifosfatom5dtpgpcpavvodnomrastvoremetodom1nâmrspektroskopii AT veselkovan issledovaniekompleksoobrazovaniâakridinovogokrasitelâproflavinasdezoksitetraribonukleozidtrifosfatom5dtpgpcpavvodnomrastvoremetodom1nâmrspektroskopii AT itonrd doslídžennâkompleksoutvorennâakridinovogobarvnikaproflavínuzdezoksitetraribonukleozidtrifosfatom5dtpgpcpauvodnomurozčinímetodom1nâmrspektroskopíí AT veselkovda doslídžennâkompleksoutvorennâakridinovogobarvnikaproflavínuzdezoksitetraribonukleozidtrifosfatom5dtpgpcpauvodnomurozčinímetodom1nâmrspektroskopíí AT dymantln doslídžennâkompleksoutvorennâakridinovogobarvnikaproflavínuzdezoksitetraribonukleozidtrifosfatom5dtpgpcpauvodnomurozčinímetodom1nâmrspektroskopíí AT baranovskijsf doslídžennâkompleksoutvorennâakridinovogobarvnikaproflavínuzdezoksitetraribonukleozidtrifosfatom5dtpgpcpauvodnomurozčinímetodom1nâmrspektroskopíí AT osetrovsg doslídžennâkompleksoutvorennâakridinovogobarvnikaproflavínuzdezoksitetraribonukleozidtrifosfatom5dtpgpcpauvodnomurozčinímetodom1nâmrspektroskopíí AT dévisdb doslídžennâkompleksoutvorennâakridinovogobarvnikaproflavínuzdezoksitetraribonukleozidtrifosfatom5dtpgpcpauvodnomurozčinímetodom1nâmrspektroskopíí AT veselkovan doslídžennâkompleksoutvorennâakridinovogobarvnikaproflavínuzdezoksitetraribonukleozidtrifosfatom5dtpgpcpauvodnomurozčinímetodom1nâmrspektroskopíí AT itonrd 1hnmrinvestigationofcoraplexationofacridinedyeproflavinewithdeoxytetraribonucleosidetriphosphate5dtpgpcpainaqueoussolution AT veselkovda 1hnmrinvestigationofcoraplexationofacridinedyeproflavinewithdeoxytetraribonucleosidetriphosphate5dtpgpcpainaqueoussolution AT dymantln 1hnmrinvestigationofcoraplexationofacridinedyeproflavinewithdeoxytetraribonucleosidetriphosphate5dtpgpcpainaqueoussolution AT baranovskijsf 1hnmrinvestigationofcoraplexationofacridinedyeproflavinewithdeoxytetraribonucleosidetriphosphate5dtpgpcpainaqueoussolution AT osetrovsg 1hnmrinvestigationofcoraplexationofacridinedyeproflavinewithdeoxytetraribonucleosidetriphosphate5dtpgpcpainaqueoussolution AT dévisdb 1hnmrinvestigationofcoraplexationofacridinedyeproflavinewithdeoxytetraribonucleosidetriphosphate5dtpgpcpainaqueoussolution AT veselkovan 1hnmrinvestigationofcoraplexationofacridinedyeproflavinewithdeoxytetraribonucleosidetriphosphate5dtpgpcpainaqueoussolution
first_indexed	2025-07-22T04:13:35Z
last_indexed	2025-07-22T04:13:35Z
_version_	1838319000105254912
spelling	oai:nasplib.isofts.kiev.ua:123456789-1549862025-02-23T17:17:14Z Исследование комплексообразования акридинового красителя профлавина с дезокситетрарибонуклеозидтрифосфатом 5-d(TpGpCpA) в водном растворе методом ¹Н-ЯМР спектроскопии Дослідження комплексоутворення акридинового барвника профлавіну з дезокситетрарибонуклеозидтрифосфатом 5'-d(TpGpCpA) у водному розчині методом ¹Н-ЯМР спектроскопії ¹H-NMR investigation of coraplexation of acridine dye proflavine with deoxytetraribonucleoside triphosphate 5'-d(TpGpCpA) in aqueous solution Итон, Р.Д. Веселков, Д.А. Дымант, Л.Н. Барановский, С.Ф. Осетров, С.Г. Дэвис, Д.Б. Веселков, А.Н. Структура и функции биополимеров Исследовано взаимодействие красителя акридинового ряда профлавина с самокомплементарным дезокситетрарибонуклеозидтрифосфатом 5'-d(TpGpCpA) в водно-солевом растворе методом одномерной и двухмерной Х ¹Н-ЯМР спектроскопии (500 МГц). Измерены концентрационные и температурные зависимости протонных химических сдвигов взаимодействующих молекул Рассмотрены различные модели образования комплексов молекул красителя с тетрануклеотидом, рассчитаны равновесные константы, энтальпии ΔН и энтропии ΔS реакций образования комплексов состава 1:1, 2:1, 1:2 и 2:2. Выявлены особенности динамического равновесия комплексов различного типа в зависимости от соотношения концентраций красителя и гпетрануклеотида. Сделано заключение о преимущественной интеркаляции профлавина в пиримидин-пуриновые TG- и СА-сайты тетрануклеотида. Сравнение закономерностей интеркаляционного взаимодействия профлавина и исследованного ранее фенантридинового красителя бромистого этидия показало, что интенсивность селективного связывания ароматических лигандов с пиримидин-пуриновыми сайтами дезокситетрануклеотидов зависит от их состава и от вида оснований, фланкирующих места посадки лиганда. На основании рассчитанных значений индуцированных химических сдвигов для протонов красителя и данных 2M-NOESY определены наиболее вероятные пространственные структуры 1:2- и 2:2-комплексов профлавина с тетрануклеотидом. Досліджено взаємодію барвника акридинового ряду про флавіну з самокомплементарним дезокситетрарибонуклеозидтрифосфатом 5' -d(TpGpCpA) у водно-сольовому розчині методом одно- і двомірної ¹Н-ЯМР спектроскопії (500 МГц). Виміряно концентраційні і температурні залежності протонних хімічних зсувів взаємодіючих молекул Розглянуто різні моделі утворення комплексів молекул барвника з тетрануклеотидом, розраховано рівноважні константи, ентальпії ΔН та ентропії ΔS реакцій утворення комплексів складу 1:1, 2:1, 1:2, 2:2. Виявлено особливості динамічної рівноваги комплексів різного типу в залежності від співвідношення концентрацій барвника і тетрануклеотиду. Зроблено висновок про переважну інтеркаляцію профлавіну у піримідин-пуринові TG- і СА-сайти тетрануклеотиду. Порівняння закономірностей інтеркаляційної взаємодії профлавіну та дослідженого раніше фенантридинового барвника бромистого етидію засвідчило, що інтенсивність селективного зв'язування ароматичних лігандів з піримидин-пуриновими сайтами дезокситетрануклеотидів залежить від їх складу і виду основ, фланкуючих місця посадки ліганда. Базуючись на розрахованих значеннях індукованих хімічних зсувів для протонів барвника та даних 2M-NOESY, визначено найвірогідніші просторові структури 1:2 і 2:2 комплексів профлавіну з тетрануклеотидом. The interaction of acridine dye proflavine with self-complementary deoxytetraribonucleoside triphosphate 5'-d(TpGpCpA) in aqueous salt solution has been studied by one- and two- dimentional 500 MHz ¹H-NMR spectroscopy. Concentration and temperature dependences of proton chemical shifts of the interacting molecules have been measured. Different schemes of complexation of proflavine with the tetranucleotide have been analysed and the equilibrium constants, enthalpies ΔH, entropies ΔS of different reactions leading to the formation of 1:1, 1:2, 2:1, 2:2 complexes have been determined. The specific features of the dynamic equilibrium of different complexes as a function of the drug-tetranucleotide ratio have been examined. It is concluded that proflavine intercalates preferentially to pyrimidine-purine TG- and CA-sites of the tetranucleotide sequence. Comparative analysis of the distinctive features of the intercalative binding of proflavine and that of phenan-tridinium dye ethidium bromide studied earlier has shown that intensity of selective interaction of aromatic ligands with pyrimidine-purine sequence depends on the base content and type of the bases flanking the binding sites. The most favourable structures 1:2 and 2:2 proflavine-tetranucleotide complexes have been constructed using calculated values of induced chemical shift of dye protons and 2D-NOE spectra. Выражаем благодарность Объединенному исследовательскому центру Лондонского университета за предоставленную возможность в Беркбек колледже использовать для измерений ЯМР-спектрометр 500 МГц. 1998 Article Исследование комплексообразования акридинового красителя профлавина с дезокситетрарибонуклеозидтрифосфатом 5-d(TpGpCpA) в водном растворе методом ¹Н-ЯМР спектроскопии / Р.Д. Итон, Д.А. Веселков, Л.Н. Дымант, С.Ф. Барановский, С.Г. Осетров, Д.Б. Дэвис, А.Н. Веселков // Биополимеры и клетка. — 1998. — Т. 14, № 2. — С. 117-126. — Бібліогр.: 30 назв. — рос. 0233-7657 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154986 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.0004C3 ru Биополимеры и клетка application/pdf Інститут молекулярної біології і генетики НАН України

Репозитарії

Схожі ресурси