Фрагмент-орієнтований дизайн лікарських засобів

Fragment-based drug design (FBDD) is one of the modern techniques used for developing new drugs, and an alternative to the widely used high throughput screening. The main methodological approaches of FBDD, as well as the methods of optimization for the identified “fragments“ when transferring them t...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Datum:2017
1. Verfasser: Kryshchyshyn, A. P.
Format: Artikel
Sprache:Ukrainian
Veröffentlicht: National University of Pharmacy 2017
Schlagworte:
Online Zugang:https://ophcj.nuph.edu.ua/article/view/ophcj.17.913
Tags: Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
Назва журналу:Journal of Organic and Pharmaceutical Chemistry

Institution

Journal of Organic and Pharmaceutical Chemistry
id oai:ojs.journals.uran.ua:article-97289
record_format ojs
institution Journal of Organic and Pharmaceutical Chemistry
baseUrl_str
datestamp_date 2017-12-08T08:40:17Z
collection OJS
language Ukrainian
topic фрагмент-орієнтований дизайн ЛЗ
молекулярний фрагмент
лігандна ефективність
УДК 615.12
spellingShingle фрагмент-орієнтований дизайн ЛЗ
молекулярний фрагмент
лігандна ефективність
УДК 615.12
Kryshchyshyn, A. P.
Фрагмент-орієнтований дизайн лікарських засобів
topic_facet fragment-based drug design FBDD
molecular fragment
ligand efficiency
UDC 615.12
фрагмент-ориентированный дизайн ЛС
молекулярный фрагмент
лигандная эффективность
УДК 615.12
фрагмент-орієнтований дизайн ЛЗ
молекулярний фрагмент
лігандна ефективність
УДК 615.12
format Article
author Kryshchyshyn, A. P.
author_facet Kryshchyshyn, A. P.
author_sort Kryshchyshyn, A. P.
title Фрагмент-орієнтований дизайн лікарських засобів
title_short Фрагмент-орієнтований дизайн лікарських засобів
title_full Фрагмент-орієнтований дизайн лікарських засобів
title_fullStr Фрагмент-орієнтований дизайн лікарських засобів
title_full_unstemmed Фрагмент-орієнтований дизайн лікарських засобів
title_sort фрагмент-орієнтований дизайн лікарських засобів
title_alt Fragment-based drug design (FBDD)
Фрагмент-ориентированный дизайн лекарственных средств
description Fragment-based drug design (FBDD) is one of the modern techniques used for developing new drugs, and an alternative to the widely used high throughput screening. The main methodological approaches of FBDD, as well as the methods of optimization for the identified “fragments“ when transferring them to the drug-like molecules have been described. The basic principles of the biophysical methods for analysis of the fragment – bio-target complexes and their application have been shown. Advantages and disadvantages of such methods as fluorescence-based thermal shift, NMR-spectroscopy, mass spectrometry, surface plasmon resonance are discussed. The most informative and efficient tool for the complex screening is X-ray crystallography. The main approaches to development of the pharmacologically active molecules based on the identified fragments, namely the methods of “fragment merging”, “fragment linking” and “fragment growing”, are given. The prospects and importance of the given method has been confirmed by the specific examples of drug candidates and the antitumor drug Vemurafenib approved and developed using FBDD.
publisher National University of Pharmacy
publishDate 2017
url https://ophcj.nuph.edu.ua/article/view/ophcj.17.913
work_keys_str_mv AT kryshchyshynap fragmentbaseddrugdesignfbdd
AT kryshchyshynap fragmentorientirovannyjdizajnlekarstvennyhsredstv
AT kryshchyshynap fragmentoríêntovanijdizajnlíkarsʹkihzasobív
first_indexed 2025-07-17T12:58:51Z
last_indexed 2025-07-17T12:58:51Z
_version_ 1838411427470114816
spelling oai:ojs.journals.uran.ua:article-972892017-12-08T08:40:17Z Fragment-based drug design (FBDD) Фрагмент-ориентированный дизайн лекарственных средств Фрагмент-орієнтований дизайн лікарських засобів Kryshchyshyn, A. P. fragment-based drug design FBDD molecular fragment ligand efficiency UDC 615.12 фрагмент-ориентированный дизайн ЛС молекулярный фрагмент лигандная эффективность УДК 615.12 фрагмент-орієнтований дизайн ЛЗ молекулярний фрагмент лігандна ефективність УДК 615.12 Fragment-based drug design (FBDD) is one of the modern techniques used for developing new drugs, and an alternative to the widely used high throughput screening. The main methodological approaches of FBDD, as well as the methods of optimization for the identified “fragments“ when transferring them to the drug-like molecules have been described. The basic principles of the biophysical methods for analysis of the fragment – bio-target complexes and their application have been shown. Advantages and disadvantages of such methods as fluorescence-based thermal shift, NMR-spectroscopy, mass spectrometry, surface plasmon resonance are discussed. The most informative and efficient tool for the complex screening is X-ray crystallography. The main approaches to development of the pharmacologically active molecules based on the identified fragments, namely the methods of “fragment merging”, “fragment linking” and “fragment growing”, are given. The prospects and importance of the given method has been confirmed by the specific examples of drug candidates and the antitumor drug Vemurafenib approved and developed using FBDD. Фрагмент-ориентированный дизайн лекарственных средств является одним из современных методов разработки новых лекарственных средств и является альтернативой широко используемому методу высокоэффективного биологического скрининга. В работе представлены основные методологические подходы ФОД, а также методы оптимизации идентифицированных «фрагментов» в малые «druglike» молекулы. Описаны основные принципы биофизических методов анализа комплексов фрагмент – био-мишень, лежащие в основе ФОД, их преимущества и недостатки. К последним принадлежат метод термического сдвига, основанный на флуоресценции; методы ПМР-спектроскопии, масс-спектрометрии, поверхностного плазмонного резонанса. Наиболее информативным и эффективным методом скрининга комплексов является рентгеноструктурный анализ. Приведены основные подходы к созданию фармакологически активных молекул на основе фрагментов, а именно методы «слияния фрагментов», «соединения фрагментов» и «наращивания фрагментов». Перспективность и важность метода фрагмент-ориентированного дизайна лекарственных средств подтверждена конкретными примерами – кандидатами в лекарственные средства и введенным в клиническую практику препаратом Вемурафенибом, которые разработаны с использованием метода ФОД ЛС. Фрагмент-орієнтований дизайн лікарських засобів є одним із сучасних методів розробки нових лікарських засобів (ЛЗ), що розглядається як альтернатива до широко-використовуваного методу високоефективного біологічного скринінгу. В роботі охарактеризовані суть та принципи фрагмент-орієнтованого дизайну (ФОД), представлено методологічні підходи, а також наступні методи оптимізації ідентифікованих «фрагментів» при побудові малих «лікоподібних» молекул. Описані основні принципи біофізичних методів аналізу комплексів фрагмент – біо-мішень, що лежать в основі ФОД, їх переваги та недоліки. До останніх належать метод термічного зсуву, що базується на флуоресценції; методи спектроскопії ПМР, мас-спектрометрії та метод поверхневого плазмонного резонансу. Найбільш інформативним та ефективним інструментом скринінгу комплексів залишається рентгеноструктурний аналіз. Охарактеризовані основні підходи до створення фармакологічно активних молекул на основі ідентифікованих фрагментів, а саме, методи «злиття фрагментів», «з’єднання фрагментів» та «нарощування фрагментів». Перспективність та важливість фрагмент-орієнтованого дизайну ЛЗ підтверджена конкретними прикладами – кандидатами у ЛЗ та введеним у клінічну практику препаратом Вемурафенібом, які розроблені з використанням методу ФОД ЛЗ. National University of Pharmacy 2017-03-23 Article Article application/pdf https://ophcj.nuph.edu.ua/article/view/ophcj.17.913 10.24959/ophcj.17.913 Journal of Organic and Pharmaceutical Chemistry; Vol. 15 No. 1(57) (2017); 28-44 Журнал органической и фармацевтической химии; Том 15 № 1(57) (2017); 28-44 Журнал органічної та фармацевтичної хімії; Том 15 № 1(57) (2017); 28-44 2518-1548 2308-8303 uk https://ophcj.nuph.edu.ua/article/view/ophcj.17.913/95077 Copyright (c) 2017 National University of Pharmacy https://creativecommons.org/licenses/by/4.0