ПАТОЛОГІЧНЕ ЗНАЧЕННЯ СПАДКОВИХ ВАРІАНТІВ ГЕНА CDH1/E-КАДГЕРИНУ У ХВОРИХ НА РАК МОЛОЧНОЇ ЗАЛОЗИ

ПАТОЛОГІЧНЕ ЗНАЧЕННЯ СПАДКОВИХ ВАРІАНТІВ ГЕНА CDH1/E-КАДГЕРИНУ У ХВОРИХ НА РАК МОЛОЧНОЇ ЗАЛОЗИ

Background. Germline alterations of the CDH1 (E-cadherin) tumor suppressor gene have been reported in several epithelial malignancies like hereditary diffuse gastric cancer and lobular breast cancer. E-cadherin plays a central role in proliferation, maintenance of cell-to-cell adhesion, polarity, an...

Повний опис

Збережено в:
Бібліографічні деталі
Дата:2023
Автори: Tabassum, S., Munir, F., Al Awadh, A.A., Anwar, Z.
Формат: Стаття
Мова:English
Опубліковано: PH Akademperiodyka 2023
Теми:
рак молочної залози
CDH1
Е-кадгерин
одноланцюговий конформаційний поліморфізм
секвенування
варіантний аналіз
Онлайн доступ:https://exp-oncology.com.ua/index.php/Exp/article/view/2023-2-4
Теги: Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Назва журналу:Experimental Oncology

Репозитарії

Experimental Oncology
id oai:ojs2.ex.aqua-time.com.ua:article-316
record_format ojs
institution Experimental Oncology
baseUrl_str
datestamp_date 2023-10-14T18:02:08Z
collection OJS
language English
topic рак молочної залози
CDH1
Е-кадгерин
одноланцюговий конформаційний поліморфізм
секвенування
варіантний аналіз
spellingShingle рак молочної залози
CDH1
Е-кадгерин
одноланцюговий конформаційний поліморфізм
секвенування
варіантний аналіз
Tabassum, S.
Munir, F.
Al Awadh, A.A.
Anwar, Z.
ПАТОЛОГІЧНЕ ЗНАЧЕННЯ СПАДКОВИХ ВАРІАНТІВ ГЕНА CDH1/E-КАДГЕРИНУ У ХВОРИХ НА РАК МОЛОЧНОЇ ЗАЛОЗИ
topic_facet рак молочної залози
CDH1
Е-кадгерин
одноланцюговий конформаційний поліморфізм
секвенування
варіантний аналіз
breast cancer
CDH1
E-cadherin
SSCP
sequencing
variant analysis.
format Article
author Tabassum, S.
Munir, F.
Al Awadh, A.A.
Anwar, Z.
author_facet Tabassum, S.
Munir, F.
Al Awadh, A.A.
Anwar, Z.
author_sort Tabassum, S.
title ПАТОЛОГІЧНЕ ЗНАЧЕННЯ СПАДКОВИХ ВАРІАНТІВ ГЕНА CDH1/E-КАДГЕРИНУ У ХВОРИХ НА РАК МОЛОЧНОЇ ЗАЛОЗИ
title_short ПАТОЛОГІЧНЕ ЗНАЧЕННЯ СПАДКОВИХ ВАРІАНТІВ ГЕНА CDH1/E-КАДГЕРИНУ У ХВОРИХ НА РАК МОЛОЧНОЇ ЗАЛОЗИ
title_full ПАТОЛОГІЧНЕ ЗНАЧЕННЯ СПАДКОВИХ ВАРІАНТІВ ГЕНА CDH1/E-КАДГЕРИНУ У ХВОРИХ НА РАК МОЛОЧНОЇ ЗАЛОЗИ
title_fullStr ПАТОЛОГІЧНЕ ЗНАЧЕННЯ СПАДКОВИХ ВАРІАНТІВ ГЕНА CDH1/E-КАДГЕРИНУ У ХВОРИХ НА РАК МОЛОЧНОЇ ЗАЛОЗИ
title_full_unstemmed ПАТОЛОГІЧНЕ ЗНАЧЕННЯ СПАДКОВИХ ВАРІАНТІВ ГЕНА CDH1/E-КАДГЕРИНУ У ХВОРИХ НА РАК МОЛОЧНОЇ ЗАЛОЗИ
title_sort патологічне значення спадкових варіантів гена cdh1/e-кадгерину у хворих на рак молочної залози
title_alt PATHOLOGICAL SIGNIFICANCE OF CDH1/E-CADHERIN GERMLINE SEQUENCE VARIANTS IN BREAST CANCER PATIENTS
description Background. Germline alterations of the CDH1 (E-cadherin) tumor suppressor gene have been reported in several epithelial malignancies like hereditary diffuse gastric cancer and lobular breast cancer. E-cadherin plays a central role in proliferation, maintenance of cell-to-cell adhesion, polarity, and epithelial-mesenchymal transition of tissue cells. It is necessary to analyze the impact of the CDH1 germline sequence variants on protein and predict its clinical significance in breast cancer (BC) progression. The aim of the current study was to evaluate the impact and association of CDH1 gene potentially pathogenic variants/likely pathogenic variants (PVs/LPVs) with the initiation and progression of BC. Materials and Methods. In this study, the clinical data of 200 BC patients have been analyzed based on the type of BC, age, grade, stage, hormonal status, and risk factors. Blood samples from 50 healthy donors were used as a control. Furthermore, CDH1 gene molecular analysis, along with in silico analysis, was provided to assess the invasiveness and progression of BC caused by the E-cadherin protein. Results. Four variants were identified by genetic screening within the CDH1 gene that included variations in exons 7, 8, 10, 11, and 13. Exon 10 had splice site mutation at position c.1337C>A, affecting the protein structure. In exon 11, there was an insertion of T base at position 1669, resulting in truncated protein compared to a normal one that can lead to the disease-causing non- sense-mediated decay and exon 13 variant c.2076T>C has already known polymorphism. In silico analysis of CDH1 showed the presence of the different variants that indicated the overall disruption of protein structure and function. Conclusions. The further functional analysis of these variants and their association with BC can be ensured by increasing the sample size and in vivo studies using mouse models.
publisher PH Akademperiodyka
publishDate 2023
url https://exp-oncology.com.ua/index.php/Exp/article/view/2023-2-4
work_keys_str_mv AT tabassums pathologicalsignificanceofcdh1ecadheringermlinesequencevariantsinbreastcancerpatients
AT munirf pathologicalsignificanceofcdh1ecadheringermlinesequencevariantsinbreastcancerpatients
AT alawadhaa pathologicalsignificanceofcdh1ecadheringermlinesequencevariantsinbreastcancerpatients
AT anwarz pathologicalsignificanceofcdh1ecadheringermlinesequencevariantsinbreastcancerpatients
AT tabassums patologíčneznačennâspadkovihvaríantívgenacdh1ekadgerinuuhvorihnarakmoločnoízalozi
AT munirf patologíčneznačennâspadkovihvaríantívgenacdh1ekadgerinuuhvorihnarakmoločnoízalozi
AT alawadhaa patologíčneznačennâspadkovihvaríantívgenacdh1ekadgerinuuhvorihnarakmoločnoízalozi
AT anwarz patologíčneznačennâspadkovihvaríantívgenacdh1ekadgerinuuhvorihnarakmoločnoízalozi
first_indexed 2025-07-17T12:17:36Z
last_indexed 2025-07-17T12:17:36Z
_version_ 1837896467913637888
spelling oai:ojs2.ex.aqua-time.com.ua:article-3162023-10-14T18:02:08Z PATHOLOGICAL SIGNIFICANCE OF CDH1/E-CADHERIN GERMLINE SEQUENCE VARIANTS IN BREAST CANCER PATIENTS ПАТОЛОГІЧНЕ ЗНАЧЕННЯ СПАДКОВИХ ВАРІАНТІВ ГЕНА CDH1/E-КАДГЕРИНУ У ХВОРИХ НА РАК МОЛОЧНОЇ ЗАЛОЗИ Tabassum, S. Munir, F. Al Awadh, A.A. Anwar, Z. рак молочної залози, CDH1, Е-кадгерин, одноланцюговий конформаційний поліморфізм, секвенування, варіантний аналіз breast cancer, CDH1, E-cadherin, SSCP, sequencing, variant analysis. Background. Germline alterations of the CDH1 (E-cadherin) tumor suppressor gene have been reported in several epithelial malignancies like hereditary diffuse gastric cancer and lobular breast cancer. E-cadherin plays a central role in proliferation, maintenance of cell-to-cell adhesion, polarity, and epithelial-mesenchymal transition of tissue cells. It is necessary to analyze the impact of the CDH1 germline sequence variants on protein and predict its clinical significance in breast cancer (BC) progression. The aim of the current study was to evaluate the impact and association of CDH1 gene potentially pathogenic variants/likely pathogenic variants (PVs/LPVs) with the initiation and progression of BC. Materials and Methods. In this study, the clinical data of 200 BC patients have been analyzed based on the type of BC, age, grade, stage, hormonal status, and risk factors. Blood samples from 50 healthy donors were used as a control. Furthermore, CDH1 gene molecular analysis, along with in silico analysis, was provided to assess the invasiveness and progression of BC caused by the E-cadherin protein. Results. Four variants were identified by genetic screening within the CDH1 gene that included variations in exons 7, 8, 10, 11, and 13. Exon 10 had splice site mutation at position c.1337C>A, affecting the protein structure. In exon 11, there was an insertion of T base at position 1669, resulting in truncated protein compared to a normal one that can lead to the disease-causing non- sense-mediated decay and exon 13 variant c.2076T>C has already known polymorphism. In silico analysis of CDH1 showed the presence of the different variants that indicated the overall disruption of protein structure and function. Conclusions. The further functional analysis of these variants and their association with BC can be ensured by increasing the sample size and in vivo studies using mouse models. Стан питання. Спадкові зміни гена-супресора пухлинного росту CDH1 (E-кадгерину) виявлено при кількох типах епітеліальних злоякісних новоутворень, таких як спадковий дифузний рак шлунка та лобулярний рак молочної залози. Е-кадгерин відіграє центральну роль у проліферації, підтримці міжклітинної адгезії, полярності та епітеліально-мезенхімальному переході. Це свідчить про необхідність аналізу впливу варіантів гена CDH1 на структуру відповідного білка для прогнозування його клінічного значення в прогресії раку молочної залози (РМЗ). Метою дослідження було оцінити вплив та зв’язок потенційно патогенних/імовірно патогенних варіантів (PV/LPV) гена CDH1 з ініціацією та прогресуванням РМЗ. Матеріали та методи. Дослідження ґрунтується на результатах обстеження та лікування 200 хворих на РМЗ. В якості контролю використовували зразки крові 50 здорових донорів. Проведено молекулярний аналіз гена CDH1, а також дослідження in silico з метою оцінки інвазивності та прогресування РМЗ, спричиненого білком Е-кадгерину. Результати. За допомогою генетичного скринінгу ідентифіковано чотири варіанти послідовності гена CDH1, які включали варіації в екзонах 7 8 10, 11 і 13. Екзон 10 характеризувався наявністю мутації сайту сплайсингу в положенні c.1337C>A що впливало на структуру білка. В екзоні 11 відзначалася вставка Т-основи в позиції 1669, що призводило до вкорочення білка порівняно з нормальним та може призводити до асоційованого із захворюванням нонсенс-осередкованого розпаду mРНК. Зауважимо, що у екзоні 13 детектувався уже відомий поліморфізм у позиції c.2076T>C. Аналіз in silico показав наявність різних варіантів послідовності гена CDH1, що свідчить про загальне порушення структури та функцій білка. Висновки. Подальший функціональний аналіз цих варіантів та їх асоціацій з РМЗ можна забезпечити шляхом збільшення розміру вибірки та досліджень in vivo з використанням мишачих моделей. PH Akademperiodyka 2023-10-11 Article Article application/pdf https://exp-oncology.com.ua/index.php/Exp/article/view/2023-2-4 10.15407/exp-oncology.2023.02.170 Experimental Oncology; Vol. 45 No. 2 (2023): Experimental Oncology; 170-179 Експериментальна онкологія; Том 45 № 2 (2023): Експериментальна онкологія; 170-179 2312-8852 1812-9269 10.15407/exp-oncology.2023.02 en https://exp-oncology.com.ua/index.php/Exp/article/view/2023-2-4/2023-2-4 Copyright (c) 2023 Experimental Oncology https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

Схожі ресурси